RNA–Protein interactions for RNA: YOR259C

RPT4, Transcript of ATPase of the 19S regulatory particle of the 26S proteasome, yeast

Gene RPT4, Length 1,314 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPT4	YOR259C	FMO1	P38866	432 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	PGD1	P40356	397 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	YIL024C	P40543	189 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	GTT1	P40582	234 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	MAD2	P40958	196 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	PMT6	P42934	759 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	YHC3	P47040	408 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	RAD17	P48581	401 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	TOS2	P50078	622 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	YGL101W	P53144	215 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	CDH1	P53197	566 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	VHT1	P53241	593 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	RHO4	Q00246	291 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	SNO1	Q03144	224 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	RSF1	Q05043	376 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	CYK3	Q07533	885 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	SUL2	Q12325	893 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	PRM4	Q12498	284 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	POL2	P21951	2222 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	STE7	P06784	515 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	PHO2	P07269	559 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	ZRC1	P20107	442 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	APA2	P22108	325 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	SED4	P25365	1065 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	CNE1	P27825	502 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	YEF1	P32622	495 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	SFK1	P35735	353 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	VPS51	P36116	164 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	ECM34	P38728	170 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	PFS1	P38872	237 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	IKI1	P38874	309 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	MET30	P39014	640 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	MRX5	P47007	382 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	RSM27	P53305	110 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	NRK1	P53915	240 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
RPT4	YOR259C	YAP6	Q03935	383 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	CAC2	Q04199	468 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	NAT4	Q04751	285 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	PEX30	Q06169	523 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	GRC3	Q07845	632 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	PFA4	Q12006	378 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	SRO7	Q12038	1033 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	RRI1	Q12468	440 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	ERG4	P25340	473 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	MCM10	P32354	571 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	YKL162C	P36052	402 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	SRX1	P36077	127 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	MRPL37	P36532	105 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	WSC4	P38739	605 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	YEL068C	P39977	110 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	YJL016W	P47072	561 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	EAF1	Q06337	982 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	YPR127W	Q06494	345 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	YPR091C	Q06833	770 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	FMP27	Q06179	2628 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	COX9	P07255	59 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	PUT1	P09368	476 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	NAM2	P11325	894 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	ADE1	P27616	306 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	PHO90	P39535	881 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	RMD6	P39975	231 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	YNL195C	P40168	261 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	YIL166C	P40445	542 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	YIL077C	P40508	320 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPT4	YOR259C	BUL1	P48524	976 aa		4.88	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 34.1 ms