RNA–Protein interactions for RNA: YLL059C

YLL059C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YLL059C, Length 507 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLL059C	YLL059C	YBR285W	P38354	144 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YLL059C	YLL059C	FLO5	P38894	1075 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YLL059C	YLL059C	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
YLL059C	YLL059C	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YLL059C	YLL059C	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YLL059C	YLL059C	MNN5	P46982	586 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YLL059C	YLL059C	YGL260W	P53056	76 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YLL059C	YLL059C	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YLL059C	YLL059C	ASI1	P54074	624 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YLL059C	YLL059C	YPL039W	Q03080	316 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YLL059C	YLL059C	DML1	Q03652	475 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YLL059C	YLL059C	MIX14	Q04341	121 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YLL059C	YLL059C	IRC19	Q07843	230 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YLL059C	YLL059C	UIP4	Q08926	304 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YLL059C	YLL059C	YPL272C	Q08984	517 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YLL059C	YLL059C	YLR126C	Q12288	251 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YLL059C	YLL059C	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YLL059C	YLL059C	MEC1	P38111	2368 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YLL059C	YLL059C	PDX1	P16451	410 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	SNF6	P18888	332 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	YPK2	P18961	677 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	UTR1	P21373	530 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	YCR100C	P25606	316 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	HSP30	P25619	332 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	ATS1	P31386	333 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	MDL1	P33310	695 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	ARN2	P38724	620 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	MLH1	P38920	769 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	YEL057C	P39983	233 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	REE1	P40893	198 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	POP1	P41812	875 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	YFR054C	P43622	192 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	COS1	P53822	381 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	SDC1	Q03323	175 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	MRPL1	Q04599	285 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	YDL218W	Q07629	317 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	FLO9	P39712	1322 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	BLM10	P43583	2143 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	NUM1	Q00402	2748 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	PHO2	P07269	559 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	YEF1	P32622	495 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	SBE22	P38814	852 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	PHB1	P40961	287 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	STB1	P42845	420 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	HMS2	P47175	358 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	UBP8	P50102	471 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	RPN14	P53196	417 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	SNX41	Q04053	625 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	RNH1	Q04740	348 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	ELP6	Q04868	273 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	COX20	Q04935	205 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	SPC3	Q12133	184 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	SIA1	Q12212	622 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	HER1	Q12276	1246 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	PHO80	P20052	293 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	OAC1	P32332	324 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	APE4	P38821	490 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	TDA11	P38854	504 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	FET3	P38993	636 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	YER184C	P39961	794 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	MSS2	P40990	351 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	SHE4	P51534	789 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	COS10	P52924	374 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	YNR062C	P53748	327 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	SPO19	Q03029	223 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	HOT1	Q03213	719 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	YMD8	Q03697	442 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	CAC2	Q04199	468 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	YOR343C	Q12484	108 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	CLB2	P24869	491 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	CHK1	P38147	527 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	GPI16	P38875	610 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	CHL4	P38907	458 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	YGR066C	P53242	292 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	YGR126W	P53274	230 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	TLG1	Q03322	224 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	SCS7	Q03529	384 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLL059C	YLL059C	GAS2	Q06135	555 aa		4.87	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 45.9 ms