RNA–Protein interactions for RNA: YHR133C

NSG1, Transcript of Protein involved in regulation of sterol biosynthesis, yeast

Gene NSG1, Length 876 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NSG1	YHR133C	MTH1	P35198	433 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	SPT10	P35208	640 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	PEX32	P38292	413 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	SLS1	P42900	643 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	PAM16	P42949	149 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	PMT5	P52867	743 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	MRPL19	P53875	158 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	RSM28	Q03430	361 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	SSY1	Q03770	852 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	YDR102C	Q03864	110 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	GPI17	Q04080	534 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	HLR1	Q04429	423 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	YLR352W	Q06479	807 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	MCH4	Q08268	501 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	YPL272C	Q08984	517 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.37	□□□□□ -1.71	not detected
NSG1	YHR133C	HIS3	P06633	220 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	PHO2	P07269	559 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	PAU2	P32612	120 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	SFK1	P35735	353 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	MRPL39	P36533	70 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	YBR137W	P38276	179 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	SDS24	P38314	527 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	FCY21	P40039	528 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	XBP1	P40489	647 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	TIR3	P40552	269 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	SER2	P42941	309 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	PCP1	P53259	346 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	YNR040W	P53736	256 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	ASI3	P53983	676 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	YLR152C	P54072	576 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	PET191	Q02772	108 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	BRE4	Q07660	1125 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	PEX27	Q08580	376 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	YDL180W	Q12301	547 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	SUS1	Q6WNK7	96 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	SOD2	P00447	233 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	DBF2	P22204	572 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	ITR1	P30605	584 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	RCN1	P36054	211 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	FRM2	P37261	193 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	MBA1	P38300	278 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	YHK8	P38776	514 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	PUG1	P40100	303 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	ATG18	P43601	500 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	LOH1	P47055	219 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	MRH4	P53166	561 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	SLI1	P53304	468 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	YNL165W	P53891	406 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	SAM50	P53969	484 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	MRP51	Q02950	344 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	PLB2	Q03674	706 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	MSS11	Q03825	758 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	YAP6	Q03935	383 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	YDR387C	Q04162	555 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	COQ11	Q05892	277 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	PEX30	Q06169	523 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	RAF1	Q06891	181 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	COX17	Q12287	69 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	YBR056W-A	I2HB52	66 aa		4.34	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	COX5B	P00425	151 aa		4.34	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	NAM2	P11325	894 aa		4.34	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	SED4	P25365	1065 aa		4.34	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	PPG1	P32838	368 aa		4.34	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	ZRT3	P34240	503 aa		4.34	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	CLG1	P35190	452 aa		4.34	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	YBR096W	P38256	230 aa		4.34	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	YMR262W	P38430	313 aa		4.34	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	MTC6	P38849	526 aa		4.34	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	MIT1	P40002	666 aa		4.34	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	DLS1	P40366	167 aa		4.34	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	BNA6	P43619	295 aa		4.34	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	IRC18	P47056	224 aa		4.34	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	YJR120W	P47157	116 aa		4.34	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
NSG1	YHR133C	DOC1	P53068	250 aa		4.34	□□□□□ -1.71

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