RNA–Protein interactions for RNA: YBL093C

ROX3, Transcript of Subunit of the RNA polymerase II mediator complex, yeast

Gene ROX3, Length 663 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ROX3	YBL093C	CIK1	Q01649	594 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	YKR005C	Q02203	525 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	PEX25	Q02969	394 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	BTS1	Q12051	335 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	RLM1	Q12224	676 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	FRE7	Q12333	620 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	SIR2	P06700	562 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	RIP1	P08067	215 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	RPB8	P20436	146 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	NUP1	P20676	1076 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	SCO1	P23833	295 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	PUP2	P32379	260 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.76	□□□□□ -1.65	not detected
ROX3	YBL093C	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.76	□□□□□ -1.65	not detected
ROX3	YBL093C	SEC66	P33754	206 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	RSM22	P36056	628 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	YBR063C	P38083	404 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	DTR1	P38125	572 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	PAU24	P38155	120 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	YHR180W	P38868	163 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	PAM16	P42949	149 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	PAU12	P53343	120 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	MSS11	Q03825	758 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	DCR2	Q05924	578 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	HRT1	Q08273	121 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	PEX27	Q08580	376 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	HSP42	Q12329	375 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	FRE6	Q12473	712 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	YOR343C	Q12484	108 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	URA3	P03962	267 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	KIN28	P06242	306 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	PDE2	P06776	526 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	AHC2	P25649	128 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	EHD3	P28817	500 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	FUN26	P31381	517 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	SPT14	P32363	452 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	RIB7	P33312	244 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	SLC1	P33333	303 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	SDS22	P36047	338 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	CHK1	P38147	527 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	MBA1	P38300	278 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	LEU5	P38702	357 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	MLH1	P38920	769 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	FET3	P38993	636 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	NAS2	P40555	220 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	POP1	P41812	875 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	SER2	P42941	309 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	TAX4	P47030	604 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	YNR071C	P53757	342 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	ATG21	Q02887	496 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	SNX41	Q04053	625 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	YMR252C	Q04814	134 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	PEX10	Q05568	337 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	MRPL35	Q06678	367 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	YOR376W	Q08900	122 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	AKR2	Q12013	749 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	QCR7	P00128	127 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	OPI3	P05375	206 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	COX9	P07255	59 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	PTC6	P25646	442 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	DOA4	P32571	926 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	SEF1	P34228	1148 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	YPT10	P38146	199 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	PHO90	P39535	881 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	AIM20	P40451	204 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	IRC6	P43615	237 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	SFH5	P47008	294 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	PGU1	P47180	361 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	PMT5	P52867	743 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	VOA1	P53262	265 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	SCS7	Q03529	384 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	MDM30	Q05930	598 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	BUR2	Q05949	395 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	GPN3	Q06543	272 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	AIM6	Q07716	390 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	HNT3	Q08702	217 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	RTN2	Q12443	393 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	YPR1	Q12458	312 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ROX3	YBL093C	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		4.74	□□□□□ -1.65

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