RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471759.5

RABGGTB-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 2,137 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-208ENST00000471759 BEND5Q7L4P6 421 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 HS2ST1Q7LGA3 356 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 RELL1Q8IUW5 271 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 PDZD8Q8NEN9 1154 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 ANGPTL6Q8NI99 470 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 INPP5DQ92835 1189 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 PLEKHF1Q96S99 279 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 STK33Q9BYT3 514 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 VPS33BQ9H267 617 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 C10orf88Q9H8K7 445 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 UVRAGQ9P2Y5 699 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 GABBR1Q9UBS5 961 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 TBK1Q9UHD2 729 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 LZTS1Q9Y250 596 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 CFL2Q9Y281 166 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 SBF1O95248 1867 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 C4AP0C0L4 1744 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 FUOMA2VDF0 154 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 SIGLEC16A6NMB1 481 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 FOXN1O15353 648 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 KRT86O43790 486 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 COL6A2P12110 1019 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 PRLRP16471 622 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 CDH3P22223 829 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 ETFBP38117 255 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC1A1P43005 524 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 CENPAP49450 140 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 MAP3K7CLP57077 242 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 AP2B1P63010 937 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 RESTQ13127 1097 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 HIC1Q14526 733 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 ANO4Q32M45 955 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 DENND2CQ68D51 928 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 LLGL2Q6P1M3 1020 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 CYP2U1Q7Z449 544 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 CROCCP2Q86T23 111 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 IFNL1Q8IU54 200 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 BRSK1Q8TDC3 778 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 NLRP7Q8WX94 980 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 OSBP2Q969R2 916 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 CAPZA3Q96KX2 299 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 C1orf74Q96LT6 269 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 CTRCQ99895 268 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 RNF181Q9P0P0 153 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF212Q9UDV6 495 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 STK17AQ9UEE5 414 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 KLHL3Q9UH77 587 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 MOSPD1Q9UJG1 213 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 VANGL2Q9ULK5 521 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 ITGB4P16144 1822 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 MEGF6O75095 1541 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 ABCC4O15439 1325 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 A0A0G2JLW4 131 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 CCDC169A6NNP5 214 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 NMT2O60551 498 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 OPHN1O60890 802 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 DDHD2O94830 711 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 OCM2P0CE71 109 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 PRKACAP17612 351 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 MAN1A1P33908 653 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 CCR3P51677 355 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC34A1Q06495 639 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 TRIM14Q14142 442 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 KCTD2Q14681 263 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 LPIN1Q14693 890 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 MTF1Q14872 753 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 MAPRE2Q15555 327 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 WASHC4Q2M389 1173 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 CDONQ4KMG0 1287 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 C8orf74Q6P047 294 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 C4orf22Q6V702 233 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 GALNT7Q86SF2 657 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 AMIGO3Q86WK7 504 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 AIDAQ96BJ3 306 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 HSPBAP1Q96EW2 488 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 CFAP36Q96G28 342 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 CEP19Q96LK0 163 aa7.03□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.6 ms