RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308394.8

CASP3-201, Transcript of caspase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASP3, Length 2,673 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3-201ENST00000308394 SLC9A9Q8IVB4 645 aa11.66□□□□□ -0.54
CASP3-201ENST00000308394 POMGNT1Q8WZA1 660 aa11.66□□□□□ -0.54
CASP3-201ENST00000308394 FAM117AQ9C073 453 aa11.66□□□□□ -0.54
CASP3-201ENST00000308394 AKT3Q9Y243 479 aa11.66□□□□□ -0.54
CASP3-201ENST00000308394 COL1A2P08123 1366 aa11.65□□□□□ -0.54
CASP3-201ENST00000308394 GOLGA8IPA6NC78 632 aa11.65□□□□□ -0.54
CASP3-201ENST00000308394 ANKRD33BA6NCL7 494 aa11.65□□□□□ -0.54
CASP3-201ENST00000308394 GOLGA8JA6NMD2 632 aa11.65□□□□□ -0.54
CASP3-201ENST00000308394 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CASP3-201ENST00000308394 F2P00734 622 aa11.65□□□□□ -0.54
CASP3-201ENST00000308394 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CASP3-201ENST00000308394 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CASP3-201ENST00000308394 TFDP1Q14186 410 aa11.65□□□□□ -0.54
CASP3-201ENST00000308394 GNASQ5JWF2 1037 aa11.65□□□□□ -0.54
CASP3-201ENST00000308394 MTHFD1LQ6UB35 978 aa11.65□□□□□ -0.54
CASP3-201ENST00000308394 TRIM74Q86UV6 250 aa11.65□□□□□ -0.54
CASP3-201ENST00000308394 TRIM73Q86UV7 250 aa11.65□□□□□ -0.54
CASP3-201ENST00000308394 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa11.65□□□□□ -0.54
CASP3-201ENST00000308394 XXYLT1Q8NBI6 393 aa11.65□□□□□ -0.54
CASP3-201ENST00000308394 KAT2BQ92831 832 aa11.65□□□□□ -0.54
CASP3-201ENST00000308394 PPP1R16BQ96T49 567 aa11.65□□□□□ -0.54
CASP3-201ENST00000308394 MKNK1Q9BUB5 465 aa11.65□□□□□ -0.54
CASP3-201ENST00000308394 MMRN2Q9H8L6 949 aa11.65□□□□□ -0.54
CASP3-201ENST00000308394 SPC25Q9HBM1 224 aa11.65□□□□□ -0.54
CASP3-201ENST00000308394 SEPT4O43236 478 aa11.65□□□□□ -0.54
CASP3-201ENST00000308394 PGK1P00558 417 aa11.65□□□□□ -0.54
CASP3-201ENST00000308394 GYPCP04921 128 aa11.65□□□□□ -0.54
CASP3-201ENST00000308394 RARBP10826 455 aa11.65□□□□□ -0.54
CASP3-201ENST00000308394 ADSSP30520 456 aa11.65□□□□□ -0.54
CASP3-201ENST00000308394 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP11.65□□□□□ -0.54
CASP3-201ENST00000308394 MFSD10Q14728 455 aa11.65□□□□□ -0.54
CASP3-201ENST00000308394 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CASP3-201ENST00000308394 SAAL1Q96ER3 474 aa11.65□□□□□ -0.54
CASP3-201ENST00000308394 MYADML2A6NDP7 307 aa11.64□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 FKTNO75072 461 aa11.64□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 AFPP02771 609 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa11.64□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa11.64□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 EFNA5P52803 228 aa11.64□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 SLC39A4Q6P5W5 647 aa11.64□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 C12orf56Q8IXR9 622 aa11.64□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 TC2NQ8N9U0 490 aa11.64□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa11.64□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 ERO1AQ96HE7 468 aa11.64□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 ERGIC2Q96RQ1 377 aa11.64□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 CRACR2AQ9BSW2 395 aa11.64□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 TMEM134Q9H6X4 195 aa11.64□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 TSKSQ9UJT2 592 aa11.64□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 RRN3P2A6NIE6 340 aa11.64□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 ASAP2O43150 1006 aa11.64□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 VTNP04004 478 aa11.64□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 KRT13P13646 458 aa11.64□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 TRPC1P48995 793 aa11.64□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 PSEN2P49810 448 aa11.64□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP11.64□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 PPP2R3AQ06190 1150 aa11.64□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 TRIM14Q14142 442 aa11.64□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 MAPK6Q16659 721 aa11.64□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 MARCH8Q5T0T0 291 aa11.64□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 NFRKBQ6P4R8 1299 aa11.64□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 LMBR1Q8WVP7 490 aa11.64□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 PYCARDQ9ULZ3 195 aa11.64□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa11.64□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 NRCAMQ92823 1304 aa11.64□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa11.63□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 SETSIPP0DME0 302 aa11.63□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 CNGA4Q8IV77 575 aa11.63□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 SLC35C1Q96A29 364 aa11.63□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 SCLT1Q96NL6 688 aa11.63□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 NUP58Q9BVL2 599 aa11.63□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 KATNAL1Q9BW62 490 aa11.63□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 C2orf40Q9H1Z8 148 aa11.63□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa11.63□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 TTC26A0AVF1 554 aa11.63□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 MFAP3LO75121 409 aa11.63□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 GNRH1P01148 92 aa11.63□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 HMGCRP04035 888 aa11.63□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 GJA9P57773 515 aa11.63□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 CCZ1BP86790 482 aa11.63□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 PURAQ00577 322 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 BFSP1Q12934 665 aa11.63□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 ARHGEF6Q15052 776 aa11.63□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 ZNF394Q53GI3 561 aa11.63□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 TMEM174Q8WUU8 243 aa11.63□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 BEGAINQ9BUH8 593 aa11.63□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa11.63□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 A0A087WZ62 844 aa11.63□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 DYNC1I1O14576 645 aa11.63□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 PPFIA2O75334 1257 aa11.63□□□□□ -0.55
CASP3-201ENST00000308394 PRKCBP05771 671 aa11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.3 ms