RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561685.1

RRN3-204, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene RRN3, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-204ENST00000561685 MGAT5Q09328 741 aa4.79□□□□□ -1.64
RRN3-204ENST00000561685 PTPAQ15257 358 aa4.79□□□□□ -1.64
RRN3-204ENST00000561685 VPS72Q15906 364 aa4.79□□□□□ -1.64
RRN3-204ENST00000561685 FAM214AQ32MH5 1076 aa4.79□□□□□ -1.64
RRN3-204ENST00000561685 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa4.79□□□□□ -1.64
RRN3-204ENST00000561685 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
RRN3-204ENST00000561685 TAF7LQ5H9L4 462 aa4.79□□□□□ -1.64
RRN3-204ENST00000561685 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
RRN3-204ENST00000561685 OR14C36Q8NHC7 312 aa4.79□□□□□ -1.64
RRN3-204ENST00000561685 CPT1CQ8TCG5 803 aa4.79□□□□□ -1.64
RRN3-204ENST00000561685 PRSS50Q9UI38 385 aa4.79□□□□□ -1.64
RRN3-204ENST00000561685 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP4.79□□□□□ -1.64
RRN3-204ENST00000561685 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa4.79□□□□□ -1.64
RRN3-204ENST00000561685 KDM1AO60341 852 aa4.78□□□□□ -1.64
RRN3-204ENST00000561685 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
RRN3-204ENST00000561685 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
RRN3-204ENST00000561685 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
RRN3-204ENST00000561685 DDB1Q16531 1140 aa4.78□□□□□ -1.64
RRN3-204ENST00000561685 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.78□□□□□ -1.64
RRN3-204ENST00000561685 KCNV1Q6PIU1 500 aa4.78□□□□□ -1.64
RRN3-204ENST00000561685 RASSF3Q86WH2 238 aa4.78□□□□□ -1.64
RRN3-204ENST00000561685 DNAJC10Q8IXB1 793 aa4.78□□□□□ -1.64
RRN3-204ENST00000561685 PROKR1Q8TCW9 393 aa4.78□□□□□ -1.64
RRN3-204ENST00000561685 SLC5A5Q92911 643 aa4.78□□□□□ -1.64
RRN3-204ENST00000561685 ZG16BQ96DA0 208 aa4.78□□□□□ -1.64
RRN3-204ENST00000561685 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
RRN3-204ENST00000561685 NDC1Q9BTX1 674 aa4.78□□□□□ -1.64
RRN3-204ENST00000561685 SLC46A2Q9BY10 475 aa4.78□□□□□ -1.64
RRN3-204ENST00000561685 KCNH6Q9H252 994 aa4.78□□□□□ -1.64
RRN3-204ENST00000561685 EMC7Q9NPA0 242 aa4.78□□□□□ -1.64
RRN3-204ENST00000561685 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
RRN3-204ENST00000561685 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa4.78□□□□□ -1.64
RRN3-204ENST00000561685 HS3ST4Q9Y661 456 aa4.78□□□□□ -1.64
RRN3-204ENST00000561685 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
RRN3-204ENST00000561685 GSG1L2A8MUP6 293 aa4.77□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa4.77□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 B5MCH6 92 aa4.77□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 DIRC3C9JPN6 131 aa4.77□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 CFBP00751 764 aa4.77□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 GCP02774 474 aa4.77□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 LAG3P18627 525 aa4.77□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 NR4A1P22736 598 aa4.77□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 TIGD2Q4W5G0 525 aa4.77□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 C19orf54Q5BKX5 351 aa4.77□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 BROXQ5VW32 411 aa4.77□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa4.77□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 MAPRE3Q9UPY8 281 aa4.77□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 GAGE12BA1L429 117 aa4.76□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 GAGE12HA6NDE8 117 aa4.76□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 ENPP3O14638 875 aa4.76□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 PRAMEF4O60810 478 aa4.76□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 GASTP01350 101 aa4.76□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 MGAT1P26572 445 aa4.76□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 APBA1Q02410 837 aa4.76□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 TAP1Q03518 808 aa4.76□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 FSTL1Q12841 308 aa4.76□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 UBE3CQ15386 1083 aa4.76□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa4.76□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 JAZF1Q86VZ6 243 aa4.76□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 ZNF575Q86XF7 245 aa4.76□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 MYEOVQ96EZ4 313 aa4.76□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 CRAMP1Q96RY5 1269 aa4.76□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 MLST8Q9BVC4 326 aa4.76□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 ANO3Q9BYT9 981 aa4.76□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 PACSIN3Q9UKS6 424 aa4.76□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 CDY2AQ9Y6F7 541 aa4.76□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 LCHNA4D1U4 455 aa4.75□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 PDE8AO60658 829 aa4.75□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 ULK1O75385 1050 aa4.75□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 COL10A1Q03692 680 aa4.75□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 DHCR24Q15392 516 aa4.75□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa4.75□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 CCDC62Q6P9F0 684 aa4.75□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 GDF7Q7Z4P5 450 aa4.75□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 LYSMD2Q8IV50 215 aa4.75□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 SNX33Q8WV41 574 aa4.75□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 USP7Q93009 1102 aa4.75□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 ACAP3Q96P50 834 aa4.75□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 MS4A5Q9H3V2 200 aa4.75□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 A0A087X0B3 334 aa4.74□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 AHRRA9YTQ3 701 aa4.74□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 B3GALT2O43825 422 aa4.74□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 ZEB2O60315 1214 aa4.74□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 PHF2O75151 1096 aa4.74□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 TMEM127O75204 238 aa4.74□□□□□ -1.65
RRN3-204ENST00000561685 SPATA31D3P0C874 917 aa4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.4 ms