RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434978.6

STXBP4-204, Transcript of syntaxin binding protein 4, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene STXBP4, Length 2,807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
STXBP4-204	ENST00000434978	DMPK	Q09013	629 aa		4.9	□□□□□ -1.62
STXBP4-204	ENST00000434978	NR5A1	Q13285	461 aa		4.9	□□□□□ -1.62
STXBP4-204	ENST00000434978	LAMC2	Q13753	1193 aa		4.9	□□□□□ -1.62
STXBP4-204	ENST00000434978	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		4.9	□□□□□ -1.62
STXBP4-204	ENST00000434978	SMUG1	Q53HV7	270 aa		4.9	□□□□□ -1.62
STXBP4-204	ENST00000434978	WDR44	Q5JSH3	913 aa		4.9	□□□□□ -1.62
STXBP4-204	ENST00000434978	SLC44A2	Q8IWA5	706 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
STXBP4-204	ENST00000434978	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		4.9	□□□□□ -1.62
STXBP4-204	ENST00000434978	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		4.9	□□□□□ -1.62
STXBP4-204	ENST00000434978	ACER1	Q8TDN7	264 aa		4.9	□□□□□ -1.62
STXBP4-204	ENST00000434978	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
STXBP4-204	ENST00000434978	APPBP2	Q92624	585 aa		4.9	□□□□□ -1.62
STXBP4-204	ENST00000434978	GMCL1	Q96IK5	515 aa		4.9	□□□□□ -1.62
STXBP4-204	ENST00000434978	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
STXBP4-204	ENST00000434978	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.62	3e-6	■■□□□ 13.5
STXBP4-204	ENST00000434978	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		4.9	□□□□□ -1.62
STXBP4-204	ENST00000434978	VCX3B	Q9H321	246 aa		4.9	□□□□□ -1.62
STXBP4-204	ENST00000434978	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		4.9	□□□□□ -1.62
STXBP4-204	ENST00000434978	KLK14	Q9P0G3	267 aa		4.9	□□□□□ -1.62
STXBP4-204	ENST00000434978	STAP2	Q9UGK3	403 aa		4.9	□□□□□ -1.62
STXBP4-204	ENST00000434978	FEM1B	Q9UK73	627 aa		4.9	□□□□□ -1.62
STXBP4-204	ENST00000434978	FBXO10	Q9UK96	956 aa		4.9	□□□□□ -1.62
STXBP4-204	ENST00000434978	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
STXBP4-204	ENST00000434978	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		4.9	□□□□□ -1.62
STXBP4-204	ENST00000434978	CABYR	O75952	493 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	STAMBP	O95630	424 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	IL33	O95760	270 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	GZMA	P12544	262 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	AKR1A1	P14550	325 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	FER	P16591	822 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	TMOD1	P28289	359 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	MRE11	P49959	708 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	TPD52	P55327	224 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	AP2B1	P63010	937 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	ALX1	Q15699	326 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	C8orf34	Q49A92	452 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	KAZN	Q674X7	775 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	FAM160B2	Q86V87	743 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	LCORL	Q8N3X6	602 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	MIEF2	Q96C03	454 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	LRRC45	Q96CN5	670 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	ALG1	Q9BT22	464 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	DKK3	Q9UBP4	350 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	IPP	Q9Y573	584 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978		H0YC42	278 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	ERC2	O15083	957 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	NEMF	O60524	1076 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	PYGL	P06737	847 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	TPM1	P09493	284 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	KRT13	P13646	458 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	CTNNA1	P35221	906 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	HAL	P42357	657 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	CLCN2	P51788	898 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	MNAT1	P51948	309 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	BOLA3	Q53S33	107 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	CEP135	Q66GS9	1140 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	RNF180	Q86T96	592 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	DPP9	Q86TI2	863 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	TREML1	Q86YW5	311 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	TRPV1	Q8NER1	839 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	GPR152	Q8TDT2	470 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	STON2	Q8WXE9	905 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	RBM18	Q96H35	190 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	FANCL	Q9NW38	375 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STXBP4-204	ENST00000434978	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		4.89	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.4 ms