RNA–Protein interactions for RNA: YLL059C

YLL059C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YLL059C, Length 507 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLL059C	YLL059C	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	YNL181W	P53878	407 aa		5	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	NCE101	Q02820	53 aa		5	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	YML122C	Q03207	126 aa		5	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	YOL163W	P0CF20	169 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	BAR1	P12630	587 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	CPR3	P25719	182 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	COQ3	P27680	312 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.99	□□□□□ -1.61	not detected
YLL059C	YLL059C	NTG1	P31378	399 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	MRPL6	P32904	214 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	FAR7	P43592	221 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	IKS1	P47042	667 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	MTQ1	P53944	314 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	SUR7	P54003	302 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	NUP53	Q03790	475 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	DCR2	Q05924	578 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	YLR446W	Q06204	433 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	RSA1	Q08932	381 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	YOR342C	Q12182	319 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	SNF4	P12904	322 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	NAM9	P27929	486 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	PKP1	P40530	394 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	IRC6	P43615	237 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	YGR168C	P53293	376 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	RSM28	Q03430	361 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	RNH202	Q05635	350 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	CRC1	Q12289	327 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	APC2	Q12440	853 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	TIM9	O74700	87 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	ATR1	P13090	542 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	POL4	P25615	582 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	PUP2	P32379	260 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	SEF1	P34228	1148 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	LHS1	P36016	881 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	NSG1	P38837	291 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	ALP1	P38971	573 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	YEL068C	P39977	110 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	SPO73	P40031	143 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	SLZ1	P40167	298 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	INN1	P53901	409 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	YSA1	Q01976	231 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	YPL068C	Q02749	293 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	YDR541C	Q03049	344 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	PFA5	Q03289	374 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	YDR209C	Q03480	137 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	SEI1	Q06058	285 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	ARV1	Q06541	321 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	not detected
YLL059C	YLL059C	HNT3	Q08702	217 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	NFI1	Q12216	726 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	RIB3	Q99258	208 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	TRA1	P38811	3744 aa		4.96	□□□□□ -1.61
YLL059C	YLL059C	CHO1	P08456	276 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YLL059C	YLL059C	ERD1	P16151	362 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YLL059C	YLL059C	FAR1	P21268	830 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YLL059C	YLL059C	ITR2	P30606	609 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YLL059C	YLL059C	HIR2	P32480	875 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YLL059C	YLL059C	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YLL059C	YLL059C	ECM15	P35195	104 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YLL059C	YLL059C	SLM4	P38247	162 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YLL059C	YLL059C	OM14	P38325	134 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YLL059C	YLL059C	ECM34	P38728	170 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YLL059C	YLL059C	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YLL059C	YLL059C	SOK1	P40317	901 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YLL059C	YLL059C	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YLL059C	YLL059C	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YLL059C	YLL059C	TOS2	P50078	622 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YLL059C	YLL059C	PRM8	P53174	237 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YLL059C	YLL059C	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YLL059C	YLL059C	COG5	P53951	403 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YLL059C	YLL059C	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YLL059C	YLL059C	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YLL059C	YLL059C	INP1	Q03694	420 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YLL059C	YLL059C	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YLL059C	YLL059C	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YLL059C	YLL059C	MCH4	Q08268	501 aa		4.96	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 41.1 ms