RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 NUF2Q9BZD4 464 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 Q9H521 79 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 ANKEF1Q9NU02 776 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 HSPBP1Q9NZL4 362 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 APEX2Q9UBZ4 518 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 CAPN7Q9Y6W3 813 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 FAM170AA1A519 330 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 TEX33O43247 280 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 RPA1P27694 616 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 STAT5BP51692 787 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 ARID5BQ14865 1188 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 RASGRP2Q7LDG7 609 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 PLCD3Q8N3E9 789 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 DNAAF3Q8N9W5 541 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 GPRASP2Q96D09 838 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 REEP2Q9BRK0 252 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 HACL1Q9UJ83 578 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa6.91□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 HMGCS2P54868 508 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF710Q8N1W2 664 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 RABEP2Q9H5N1 569 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 FAM96AQ9H5X1 160 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 C17orf75Q9HAS0 396 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 TXLNGQ9NUQ3 528 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 TLK1Q9UKI8 766 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 MAGEB2O15479 319 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 GSTA1P08263 222 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 GSTA2P09210 222 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 KIAA1841Q6NSI8 718 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 FAF2Q96CS3 445 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 STAP1Q9ULZ2 295 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 GAS2O43903 313 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 PRKCBP05771 671 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 CASP7P55210 303 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 KCTD16Q68DU8 428 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 CFAP36Q96G28 342 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 TRPV6Q9H1D0 765 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 SPON1Q9HCB6 807 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 PLAAQ9Y263 795 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-228ENST00000636120 M0QYV0 167 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 GH1P01241 217 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 FTLP02792 175 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 SLC15A2Q16348 729 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 NDUFAF2Q8N183 169 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 EFCC1Q9HA90 598 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 UVRAGQ9P2Y5 699 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 NFU1Q9UMS0 254 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 ICAM1P05362 532 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 PPP2R5CQ13362 524 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 SLC18A3Q16572 532 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 Q3C1V9 767 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 Q4G0T1 1027 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF677Q86XU0 584 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 SNF8Q96H20 258 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 GMCL1Q96IK5 515 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 SLC8A2Q9UPR5 921 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 AK9Q5TCS8 1911 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 A0A0G2JLW4 131 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 MYMKA6NI61 221 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 ZMYND10O75800 440 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 GYS1P13807 737 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 STX1BP61266 288 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 TGFB2P61812 414 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 SLC7A5Q01650 507 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 CCDC38Q502W7 563 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 KLC3Q6P597 504 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF449Q6P9G9 518 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 OR6J1Q8NGC5 347 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 ACAP3Q96P50 834 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 PPP1R16BQ96T49 567 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 WDR35Q9P2L0 1181 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 STK38LQ9Y2H1 464 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 ARHGAP42A6NI28 874 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 SDC4P31431 198 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 FMO5P49326 533 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 NAA25Q14CX7 972 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 SNCBQ16143 134 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 CYP4F22Q6NT55 531 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 AGXT2Q9BYV1 514 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 GRIN3BO60391 1043 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-228ENST00000636120 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP6.89□□□□□ -1.31
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