RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 KCNQ5Q9NR82 932 aa8.31□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa8.31□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 KLHL14Q9P2G3 628 aa8.31□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 GTF3C4Q9UKN8 822 aa8.31□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 C15orf41Q9Y2V0 281 aa8.31□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 LTBP1Q14766 1721 aa8.31□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 TAF1LQ8IZX4 1826 aa8.31□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 F8W031 263 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 SMAPO00193 183 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 EDIL3O43854 480 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 CAND2O75155 1236 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 MED24O75448 989 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 VIMP08670 466 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 NQO1P15559 274 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 GTF2H1P32780 548 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 PTGIRP43119 386 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 DNA2P51530 1060 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 PLTPP55058 493 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 MFAP3P55082 362 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 IL9RQ01113 521 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 RASA3Q14644 834 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 TNIP1Q15025 636 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 DIXDC1Q155Q3 683 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 CNGA2Q16280 664 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 AOC3Q16853 763 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 GALNTL6Q49A17 601 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 TLDC1Q6P9B6 456 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 ZDHHC24Q6UX98 284 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM179Q6ZVK1 233 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 FBXO11Q86XK2 927 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF677Q86XU0 584 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 CCDC89Q8N998 374 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 LINC00116Q8NCU8 138 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 SNF8Q96H20 258 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 MAGEB18Q96M61 343 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 TRAIPQ9BWF2 469 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 NEUROG2Q9H2A3 272 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 DPH5Q9H2P9 285 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 GPCPD1Q9NPB8 672 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 GRHL1Q9NZI5 618 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 FETUBQ9UGM5 382 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 SUFUQ9UMX1 484 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 EXOC7Q9UPT5 735 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 ALG6Q9Y672 507 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 FSCN2O14926 492 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 SORBS3O60504 671 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 UFL1O94874 794 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 CYP1A2P05177 515 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 ACTN1P12814 892 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 ITGA4P13612 1032 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 CCNB1P14635 433 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 TMOD1P28289 359 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 COILP38432 576 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 BPIFB4P59827 614 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 BNIP1Q12981 228 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP8.29□□□□□ -1.085e-8■■□□□ 12.3
CAPNS1-202ENST00000586851 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 PTK6Q13882 451 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC29A2Q14542 456 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 ECM1Q16610 540 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 UBE2SQ16763 222 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 QPCTQ16769 361 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 QRICH1Q2TAL8 776 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 RINT1Q6NUQ1 792 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 POTEGQ6S5H5 508 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 TRIM72Q6ZMU5 477 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 MIGA2Q7L4E1 593 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 NIPA1Q7RTP0 329 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF720Q7Z2F6 126 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 SPATA21Q7Z572 469 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 TDRPQ86YL5 185 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 GLYCTKQ8IVS8 523 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM178BQ8IXR5 827 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 CCDC105Q8IYK2 499 aa8.29□□□□□ -1.08
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