RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028679.10

Ell3-201, Transcript of RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ell3, Length 2,115 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3-201ENSMUST00000028679 Ece1Q4PZA2 769 aa22.35■■□□□ 1.17
Ell3-201ENSMUST00000028679 A1cfQ5YD48 595 aa22.35■■□□□ 1.17
Ell3-201ENSMUST00000028679 Sorbs1Q62417 1290 aa22.35■■□□□ 1.17
Ell3-201ENSMUST00000028679 Lrrc1Q80VQ1 524 aa22.35■■□□□ 1.17
Ell3-201ENSMUST00000028679 AsphQ8BSY0 741 aa22.35■■□□□ 1.17
Ell3-201ENSMUST00000028679 Bpifb6Q8BU51 449 aa22.35■■□□□ 1.17
Ell3-201ENSMUST00000028679 H2-OaQ9QWV1 250 aa22.35■■□□□ 1.17
Ell3-201ENSMUST00000028679 Col4a3Q9QZS0 1669 aa22.35■■□□□ 1.17
Ell3-201ENSMUST00000028679 Fam71aB7XG49 585 aa22.34■■□□□ 1.17
Ell3-201ENSMUST00000028679 Apba3O88888 571 aa22.34■■□□□ 1.17
Ell3-201ENSMUST00000028679 EpoP07321 192 aa22.34■■□□□ 1.17
Ell3-201ENSMUST00000028679 Hmgcs2P54869 508 aa22.34■■□□□ 1.17
Ell3-201ENSMUST00000028679 Cul4aQ3TCH7 759 aa22.34■■□□□ 1.17
Ell3-201ENSMUST00000028679 BC051142Q3V0M8 400 aa22.34■■□□□ 1.17
Ell3-201ENSMUST00000028679 Ddr2Q62371 854 aa22.34■■□□□ 1.17
Ell3-201ENSMUST00000028679 Zcchc2Q69ZB8 1166 aa22.34■■□□□ 1.17
Ell3-201ENSMUST00000028679 Zbtb5Q7TQG0 670 aa22.34■■□□□ 1.17
Ell3-201ENSMUST00000028679 Pop1Q8K205 1045 aa22.34■■□□□ 1.17
Ell3-201ENSMUST00000028679 Ctnnbl1Q9CWL8 563 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
Ell3-201ENSMUST00000028679 Rbm31yQ9D3U4 565 aa22.34■■□□□ 1.17
Ell3-201ENSMUST00000028679 Fmr1P35922 614 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
Ell3-201ENSMUST00000028679 Slc26a6Q8CIW6 758 aa22.34■■□□□ 1.17
Ell3-201ENSMUST00000028679 Fgd4Q91ZT5 766 aa22.34■■□□□ 1.17
Ell3-201ENSMUST00000028679 Sppl3Q9CUS9 384 aa22.34■■□□□ 1.17
Ell3-201ENSMUST00000028679 Nudt5Q9JKX6 218 aa22.34■■□□□ 1.17
Ell3-201ENSMUST00000028679 Ggps1Q9WTN0 300 aa22.34■■□□□ 1.17
Ell3-201ENSMUST00000028679 Wnt7bP28047 349 aa22.33■■□□□ 1.17
Ell3-201ENSMUST00000028679 Gjc1P28229 396 aa22.33■■□□□ 1.17
Ell3-201ENSMUST00000028679 Tbx3P70324 741 aa22.33■■□□□ 1.17
Ell3-201ENSMUST00000028679 Atp8b1Q148W0 1251 aa22.33■■□□□ 1.17
Ell3-201ENSMUST00000028679 Kat5Q8CHK4 513 aa22.33■■□□□ 1.17
Ell3-201ENSMUST00000028679 Chn1Q91V57 459 aa22.33■■□□□ 1.17
Ell3-201ENSMUST00000028679 Cfap57Q9D180 1249 aa22.33■■□□□ 1.17
Ell3-201ENSMUST00000028679 Usp29Q9ES63 869 aa22.33■■□□□ 1.17
Ell3-201ENSMUST00000028679 Znf354bQ9QXT9 601 aa22.33■■□□□ 1.17
Ell3-201ENSMUST00000028679 Clca3bE9PUL3 1044 aa22.33■■□□□ 1.16
Ell3-201ENSMUST00000028679 Clk2O35491 499 aa22.33■■□□□ 1.16
Ell3-201ENSMUST00000028679 Gjd2O54851 321 aa22.33■■□□□ 1.16
Ell3-201ENSMUST00000028679 Alkbh1P0CB42 389 aa22.33■■□□□ 1.16
Ell3-201ENSMUST00000028679 Il2rbP16297 539 aa22.33■■□□□ 1.16
Ell3-201ENSMUST00000028679 Rhox12Q4TU81 186 aa22.33■■□□□ 1.16
Ell3-201ENSMUST00000028679 Abi3bpQ59IW6 1179 aa22.33■■□□□ 1.16
Ell3-201ENSMUST00000028679 Bcs1lQ9CZP5 418 aa22.33■■□□□ 1.16
Ell3-201ENSMUST00000028679 Smco2Q9DA21 347 aa22.33■■□□□ 1.16
Ell3-201ENSMUST00000028679 1700016D06RikQ9DAA5 166 aa22.33■■□□□ 1.16
Ell3-201ENSMUST00000028679 Arih1Q9Z1K5 555 aa22.33■■□□□ 1.16
Ell3-201ENSMUST00000028679 Eif2ak3Q9Z2B5 1114 aa22.33■■□□□ 1.16
Ell3-201ENSMUST00000028679 Serpinb3aG3X9V8 387 aa22.32■■□□□ 1.16
Ell3-201ENSMUST00000028679 Mroh9G5E8L9 891 aa22.32■■□□□ 1.16
Ell3-201ENSMUST00000028679 Kif2aP28740 705 aa22.32■■□□□ 1.16
Ell3-201ENSMUST00000028679 Gm1587Q3UT80 123 aa22.32■■□□□ 1.16
Ell3-201ENSMUST00000028679 Srd5a1Q68FF9 255 aa22.32■■□□□ 1.16
Ell3-201ENSMUST00000028679 Mcph1Q7TT79 822 aa22.32■■□□□ 1.16
Ell3-201ENSMUST00000028679 Ppme1Q8BVQ5 386 aa22.32■■□□□ 1.16
Ell3-201ENSMUST00000028679 Q8C1R3 189 aa22.32■■□□□ 1.16
Ell3-201ENSMUST00000028679 Efcab8Q8C9R9 203 aa22.32■■□□□ 1.16
Ell3-201ENSMUST00000028679 Traf7Q922B6 594 aa22.32■■□□□ 1.16
Ell3-201ENSMUST00000028679 Sv2aQ9JIS5 742 aa22.32■■□□□ 1.16
Ell3-201ENSMUST00000028679 Gyg1Q9R062 333 aa22.32■■□□□ 1.16
Ell3-201ENSMUST00000028679 Thsd7bQ6P4U0 1607 aa22.32■■□□□ 1.16
Ell3-201ENSMUST00000028679 Skor2A7M7C7 1008 aa22.31■■□□□ 1.16
Ell3-201ENSMUST00000028679 Tcp10bE9PYJ0 438 aa22.31■■□□□ 1.16
Ell3-201ENSMUST00000028679 Zfp266E9Q2S7 604 aa22.31■■□□□ 1.16
Ell3-201ENSMUST00000028679 Tnni3P48787 211 aa22.31■■□□□ 1.16
Ell3-201ENSMUST00000028679 PltpP55065 493 aa22.31■■□□□ 1.16
Ell3-201ENSMUST00000028679 Znf367Q0VDT2 340 aa22.31■■□□□ 1.16
Ell3-201ENSMUST00000028679 Ttc39dQ0VF76 604 aa22.31■■□□□ 1.16
Ell3-201ENSMUST00000028679 Wdr18Q4VBE8 431 aa22.31■■□□□ 1.16
Ell3-201ENSMUST00000028679 Kif2bQ8C0N1 668 aa22.31■■□□□ 1.16
Ell3-201ENSMUST00000028679 Ttc16Q8C1F5 767 aa22.31■■□□□ 1.16
Ell3-201ENSMUST00000028679 Spata2Q8K004 515 aa22.31■■□□□ 1.16
Ell3-201ENSMUST00000028679 Angel2Q8K1C0 544 aa22.31■■□□□ 1.16
Ell3-201ENSMUST00000028679 Ctage5Q8R311 779 aa22.31■■□□□ 1.16
Ell3-201ENSMUST00000028679 Atp2a1Q8R429 994 aa22.31■■□□□ 1.16
Ell3-201ENSMUST00000028679 Zfp623Q9CY99 499 aa22.31■■□□□ 1.16
Ell3-201ENSMUST00000028679 Mmrn2A6H6E2 943 aa22.31■■□□□ 1.16
Ell3-201ENSMUST00000028679 Ccdc34Q3UI66 367 aa22.31■■□□□ 1.16
Ell3-201ENSMUST00000028679 Rnpc3Q3UZ01 514 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
Ell3-201ENSMUST00000028679 Ecm1Q61508 559 aa22.31■■□□□ 1.16
Ell3-201ENSMUST00000028679 SugctQ7TNE1 436 aa22.31■■□□□ 1.16
Ell3-201ENSMUST00000028679 Tcaf1Q8BNE1 924 aa22.31■■□□□ 1.16
Ell3-201ENSMUST00000028679 Ago2Q8CJG0 860 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
Ell3-201ENSMUST00000028679 Golph3Q9CRA5 298 aa22.31■■□□□ 1.16
Ell3-201ENSMUST00000028679 Tnfsf13bQ9WU72 309 aa22.31■■□□□ 1.16
Ell3-201ENSMUST00000028679 Astn1Q61137 1302 aa22.3■■□□□ 1.16
Ell3-201ENSMUST00000028679 Gm2030D3Z7C4 212 aa22.3■■□□□ 1.16
Ell3-201ENSMUST00000028679 DgkkE9Q7N4 1118 aa22.3■■□□□ 1.16
Ell3-201ENSMUST00000028679 MafP54843 370 aa22.3■■□□□ 1.16
Ell3-201ENSMUST00000028679 AdkP55264 361 aa22.3■■□□□ 1.16
Ell3-201ENSMUST00000028679 Tatdn3Q3U1C6 294 aa22.3■■□□□ 1.16
Ell3-201ENSMUST00000028679 FancbQ5XJY6 703 aa22.3■■□□□ 1.16
Ell3-201ENSMUST00000028679 Lrrc24Q8BHA1 521 aa22.3■■□□□ 1.16
Ell3-201ENSMUST00000028679 Hook3Q8BUK6 718 aa22.3■■□□□ 1.16
Ell3-201ENSMUST00000028679 Lrrc45Q8CIM1 670 aa22.3■■□□□ 1.16
Ell3-201ENSMUST00000028679 Matr3Q8K310 846 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
Ell3-201ENSMUST00000028679 Zcchc18Q8VD24 393 aa22.3■■□□□ 1.16
Ell3-201ENSMUST00000028679 Slc12a9Q99MR3 914 aa22.3■■□□□ 1.16
Ell3-201ENSMUST00000028679 Gtf3c6Q9D8P7 227 aa22.3■■□□□ 1.16
Ell3-201ENSMUST00000028679 Spock2Q9ER58 423 aa22.3■■□□□ 1.16
Ell3-201ENSMUST00000028679 Peg12Q9WVA7 283 aa22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27.6 ms