RNA–Protein interactions for RNA: YMR309C

NIP1, Transcript of eIF3c subunit of the eukaryotic translation initiation factor 3 (eIF3), yeast

Gene NIP1, Length 2,439 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NIP1	YMR309C	YER084W	P40057	128 aa		0.27	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	YIL012W	P40551	113 aa		0.27	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	PMT4	P46971	762 aa		0.27	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	SDS23	P53172	527 aa		0.27	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	TPC1	P53257	314 aa		0.27	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	RSM27	P53305	110 aa		0.27	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	YNL095C	P53932	642 aa		0.27	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	CSM3	Q04659	317 aa		0.27	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	SPH1	Q06160	661 aa		0.27	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	RPN6	Q12377	434 aa		0.27	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	TRM10	Q12400	293 aa		0.27	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	ERP3	Q12403	225 aa		0.27	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	0.27	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	0.27	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	YOL163W	P0CF20	169 aa		0.26	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	PHO80	P20052	293 aa		0.26	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	ERG9	P29704	444 aa		0.26	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	MRPL6	P32904	214 aa		0.26	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	0.26	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	YFR054C	P43622	192 aa		0.26	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	YHC3	P47040	408 aa		0.26	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	MIG2	P53035	382 aa		0.26	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	0.26	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	SUE1	Q06524	206 aa		0.26	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	YPR078C	Q06813	372 aa		0.26	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	TIM22	Q12328	207 aa		0.26	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	RAD1	P06777	1100 aa		0.26	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	UTR1	P21373	530 aa		0.26	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	GRR1	P24814	1151 aa		0.26	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	CIN8	P27895	1000 aa		0.26	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	YEL043W	P32618	956 aa		0.26	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	MDL1	P33310	695 aa		0.26	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	MYO3	P36006	1272 aa		0.26	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	AIM29	P36154	155 aa		0.26	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	PCL7	P40186	285 aa		0.26	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	MLC1	P53141	149 aa		0.26	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	YGR016W	P53209	190 aa		0.26	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	VPS9	P54787	451 aa		0.26	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	UBX2	Q04228	584 aa		0.26	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	NNT1	Q05874	261 aa		0.26	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	BUR2	Q05949	395 aa		0.26	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	MIM1	Q08176	113 aa		0.26	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	YPL278C	Q08990	100 aa		0.26	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	YPL150W	Q12152	901 aa		0.26	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	PRR2	Q12310	699 aa		0.26	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	CDC42	P19073	191 aa		0.25	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	IMP1	P28627	190 aa		0.25	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	CLB6	P32943	380 aa		0.25	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	SWE1	P32944	819 aa		0.25	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	MMS21	P38632	267 aa		0.25	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	0.25	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	YML6	P51998	286 aa		0.25	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	0.25	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	BIO4	P53630	237 aa		0.25	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	YNR066C	P53752	436 aa		0.25	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	YNR068C	P53754	272 aa		0.25	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	YNL146W	P53906	100 aa		0.25	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	YMR166C	Q03829	368 aa		0.25	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	SPO77	Q06134	477 aa		0.25	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	YOR012W	Q12351	137 aa		0.25	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	SFG1	Q12507	346 aa		0.25	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	YHR086W-A	Q3E746	53 aa		0.25	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	REP1	P03871	373 aa		0.25	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	HXT2	P23585	541 aa		0.25	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	DCC1	P25559	380 aa		0.25	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	PUP2	P32379	260 aa		0.25	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	NRG2	P38082	220 aa		0.25	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	ALP1	P38971	573 aa		0.25	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	0.25	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	DAN1	P47178	298 aa		0.25	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	EOS1	P53938	366 aa		0.25	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	PRM4	Q12498	284 aa		0.25	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	LAG2	Q92325	660 aa		0.25	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	PET8	P38921	284 aa		0.24	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	KRE29	P40026	464 aa		0.24	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	0.24	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	RPE1	P46969	238 aa		0.24	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	PIR5	P46999	287 aa		0.24	□□□□□ -2.37
NIP1	YMR309C	UFD1	P53044	361 aa		0.24	□□□□□ -2.37

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