RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 MYBL1P10243 752 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 CHN1P15882 459 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 VCAM1P19320 739 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC9A1P19634 815 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 ALDH3A1P30838 453 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 CETN2P41208 172 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC1A1P43005 524 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 MYL7Q01449 175 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 CENPCQ03188 943 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 SPIRE1Q08AE8 756 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 STRN3Q13033 797 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 RASA2Q15283 850 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 PPP1R7Q15435 360 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 PARP6Q2NL67 630 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 CRY2Q49AN0 593 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 ARSHQ5FYA8 562 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 RNF43Q68DV7 783 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 POTEBQ6S5H4 581 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 HHIPL2Q6UWX4 724 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 SFR1Q86XK3 245 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 CATSPER3Q86XQ3 398 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 ANKRD35Q8N283 1001 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 ATP8B4Q8TF62 1192 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 DYDC1Q8WWB3 177 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 TCP11Q8WWU5 503 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 KIFAP3Q92845 792 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 ART4Q93070 314 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 COA7Q96BR5 231 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 MIEF2Q96C03 454 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 TTC25Q96NG3 672 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 NACC1Q96RE7 527 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 CRAMP1Q96RY5 1269 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 REEP2Q9BRK0 252 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 TUBB6Q9BUF5 446 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 AP1M1Q9BXS5 423 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 LRRC19Q9H756 370 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 RXFP1Q9HBX9 757 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 NOD2Q9HC29 1040 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 DMAC2Q9NW81 257 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 TBC1D7Q9P0N9 293 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 LGALS13Q9UHV8 139 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 KCNG1Q9UIX4 513 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 DNAJC12Q9UKB3 198 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 PNMA2Q9UL42 364 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 LY75O60449 1722 aa8.32□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 DNM1LO00429 736 aa8.31□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 RIPK2O43353 540 aa8.31□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 CDH16O75309 829 aa8.31□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 DCTN3O75935 186 aa8.31□□□□□ -1.08
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CAPNS1-202ENST00000586851 KLRK1P26718 216 aa8.31□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
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CAPNS1-202ENST00000586851 COPS2P61201 443 aa8.31□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 ATP2B2Q01814 1243 aa8.31□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 ICA1Q05084 483 aa8.31□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 BFSP1Q12934 665 aa8.31□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 PTP4A2Q12974 167 aa8.31□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 PPP2R5CQ13362 524 aa8.31□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 STAT4Q14765 748 aa8.31□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 SETDB1Q15047 1291 aa8.31□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 MFSD14BQ5SR56 506 aa8.31□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 RGS9BPQ6ZS82 235 aa8.31□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 C3orf67Q6ZVT6 689 aa8.31□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 CEP57Q86XR8 500 aa8.31□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP8.31□□□□□ -1.08
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CAPNS1-202ENST00000586851 SAMD3Q8N6K7 520 aa8.31□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 CNBD1Q8NA66 436 aa8.31□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC44A5Q8NCS7 719 aa8.31□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 TBC1D16Q8TBP0 767 aa8.31□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF398Q8TD17 642 aa8.31□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 INPP5DQ92835 1189 aa8.31□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 SCLT1Q96NL6 688 aa8.31□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM237Q96Q45 408 aa8.31□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 AGPAT1Q99943 283 aa8.31□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 SELENOSQ9BQE4 189 aa8.31□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 NUDT12Q9BQG2 462 aa8.31□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 UBA5Q9GZZ9 404 aa8.31□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa8.31□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 ZHX3Q9H4I2 956 aa8.31□□□□□ -1.08
CAPNS1-202ENST00000586851 GOPCQ9HD26 462 aa8.31□□□□□ -1.08
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