RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561685.1

RRN3-204, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5

Gene RRN3, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-204	ENST00000561685	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	CEP89	Q96ST8	783 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	GPR87	Q9BY21	358 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	POFUT1	Q9H488	388 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	ZMAT4	Q9H898	229 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685		A0A087X1B8	175 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	NEK4	P51957	841 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	RABGGTB	P53611	331 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	OCRL	Q01968	901 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	ESPNL	Q6ZVH7	1005 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	CDYL2	Q8N8U2	506 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	NINJ1	Q92982	152 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	CLIP3	Q96DZ5	547 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	NCDN	Q9UBB6	729 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	XDH	P47989	1333 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	KPNA6	O60684	536 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	PPFIA4	O75335	1185 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	GAA	P10253	952 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	GNAT2	P19087	354 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	GPR15	P49685	360 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	PHC1	P78364	1004 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	METTL24	Q5JXM2	366 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	ULK2	Q8IYT8	1036 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	AHI1	Q8N157	1196 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	ST8SIA2	Q92186	375 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	APPBP2	Q92624	585 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	FERMT2	Q96AC1	680 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	MNT	Q99583	582 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	MYPN	Q86TC9	1320 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	NRP2	O60462	931 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	SLC25A3	Q00325	362 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	RABL3	Q5HYI8	236 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	CHTF18	Q8WVB6	975 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	SOX7	Q9BT81	388 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	PLAA	Q9Y263	795 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	PCDH8	O95206	1070 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	WNT3A	P56704	352 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	NIM1K	Q8IY84	436 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	NXPE1	Q8N323	547 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	MB21D1	Q8N884	522 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	HAS1	Q92839	578 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	MTFR1L	Q9H019	292 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	FANCL	Q9NW38	375 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	MSRA	Q9UJ68	235 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	FAM83G	A6ND36	823 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	RAMP2	O60895	175 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	ALDH1A2	O94788	518 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	PFKM	P08237	780 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	LSP1	P33241	339 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	SCNN1B	P51168	640 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	NRG3	P56975	720 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	ZNF627	Q7L945	461 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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