RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552296.6

PCBP2-222, Transcript of poly(rC) binding protein 2, human

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene PCBP2, Length 1,342 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCBP2-222	ENST00000552296	VPS52	Q8N1B4	723 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	LPP	Q93052	612 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	PHKB	Q93100	1093 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	MBOAT7	Q96N66	472 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	DACT1	Q9NYF0	836 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296		A0A087WZ62	844 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	10.04	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	OFD1	O75665	1012 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	PAPLN	O95428	1278 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	CYP3A7	P24462	503 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	GNA11	P29992	359 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	SFN	P31947	248 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	CLCN5	P51795	746 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	KRT32	Q14532	448 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	PTPN14	Q15678	1187 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296		Q4G0T1	1027 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	RNF169	Q8NCN4	708 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	BRF1	Q92994	677 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	TMEM169	Q96HH4	297 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	SAMM50	Q9Y512	469 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	NOTCH4	Q99466	2003 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	VWA8	A3KMH1	1905 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	PATJ	Q8NI35	1801 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	CDC45	O75419	566 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	DDHD2	O94830	711 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	IFNAR1	P17181	557 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	SLC11A1	P49279	550 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	CLCN4	P51793	760 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	JAK3	P52333	1124 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	GIT2	Q14161	759 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	XKR3	Q5GH77	459 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296		Q6ZUG5	572 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	ANO5	Q75V66	913 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	GPR149	Q86SP6	731 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	ZBTB33	Q86T24	672 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	ZNF410	Q86VK4	478 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	RDM1	Q8NG50	284 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	NLRP7	Q8WX94	980 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	TRIP11	Q15643	1979 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PCBP2-222	ENST00000552296	CHMP2A	O43633	222 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PCBP2-222	ENST00000552296	PI15	O43692	258 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PCBP2-222	ENST00000552296	GAS7	O60861	476 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PCBP2-222	ENST00000552296	TDP2	O95551	362 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PCBP2-222	ENST00000552296	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
PCBP2-222	ENST00000552296	CDC42EP1	Q00587	391 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PCBP2-222	ENST00000552296	LONRF3	Q496Y0	759 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PCBP2-222	ENST00000552296	MTERF2	Q49AM1	385 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PCBP2-222	ENST00000552296	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PCBP2-222	ENST00000552296	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PCBP2-222	ENST00000552296	UBXN11	Q5T124	520 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PCBP2-222	ENST00000552296	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PCBP2-222	ENST00000552296	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PCBP2-222	ENST00000552296	KSR1	Q8IVT5	923 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PCBP2-222	ENST00000552296	BICD2	Q8TD16	824 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PCBP2-222	ENST00000552296	TBCK	Q8TEA7	893 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PCBP2-222	ENST00000552296	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PCBP2-222	ENST00000552296	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PCBP2-222	ENST00000552296	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
PCBP2-222	ENST00000552296	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PCBP2-222	ENST00000552296	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PCBP2-222	ENST00000552296	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PCBP2-222	ENST00000552296	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PCBP2-222	ENST00000552296	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81

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