RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471759.5

RABGGTB-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 2,137 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-208ENST00000471759 PCGF5Q86SE9 256 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 OSTM1Q86WC4 334 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP7.08□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP7.08□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 OSCP1Q8WVF1 389 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 ZFPM2Q8WW38 1151 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 GPATCH3Q96I76 525 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 MS4A4AQ96JQ5 239 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 NEUROD6Q96NK8 337 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 NUDCD1Q96RS6 583 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 FNBP1Q96RU3 617 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 TESK2Q96S53 571 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 CNNM2Q9H8M5 875 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 GPR108Q9NPR9 543 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 PLCB1Q9NQ66 1216 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 TXLNGQ9NUQ3 528 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 KLF15Q9UIH9 416 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 A0A088AWK7 358 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 ARHGAP10A1A4S6 786 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF233A6NK53 670 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP7.07□□□□□ -1.281e-11■■■□□ 15.7
RABGGTB-208ENST00000471759 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 KRT16P08779 473 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 M6PRP20645 277 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 EPS15P42566 896 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 MAEAQ7L5Y9 396 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 FERMT3Q86UX7 667 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 SIRT2Q8IXJ6 389 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 CYP4X1Q8N118 509 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 ENGASEQ8NFI3 743 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 FRS2Q8WU20 508 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 UCMAQ8WVF2 138 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 RUFY2Q8WXA3 655 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 SGCDQ92629 289 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 EME1Q96AY2 570 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 ASIC4Q96FT7 647 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 MMS19Q96T76 1030 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 MUC3BQ9H195 1237 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 PLGRKTQ9HBL7 147 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 STAP2Q9UGK3 403 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 PASKQ96RG2 1323 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 ANO9A1A5B4 782 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 TTLL13PA6NNM8 815 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 CENPBD1B2RD01 187 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 GOLGA8MH3BSY2 632 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 O00370 1275 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 NDC80O14777 642 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 LYNP07948 512 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 GLI1P08151 1106 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 CES1P23141 567 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 TXKP42681 527 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 RASSF2P50749 326 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 ADKP55263 362 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 DPCR1Q3MIW9 517 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 GALNTL6Q49A17 601 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 C9orf131Q5VYM1 1079 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 KLHL35Q6PF15 583 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC51BQ86UW2 128 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 CNGA4Q8IV77 575 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 CARNMT1Q8N4J0 409 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 LSMEM1Q8N8F7 131 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 FSIP1Q8NA03 581 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 LRRC8CQ8TDW0 803 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 GAB3Q8WWW8 586 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 PEX13Q92968 403 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 BRF1Q92994 677 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 FERMT2Q96AC1 680 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 PHOX2BQ99453 314 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 TM6SF1Q9BZW5 370 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 GLT8D2Q9H1C3 349 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 HAUS4Q9H6D7 363 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 CYLDQ9NQC7 956 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 NDFIP2Q9NV92 336 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 TRIM10Q9UDY6 481 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 BCS1LQ9Y276 419 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 ANKRD34BA5PLL1 514 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGGTB-208ENST00000471759 PHF20L1A8MW92 1017 aa7.06□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms