RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439830.5

ANKRD28-203, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 5

Gene ANKRD28, Length 592 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-203ENST00000439830 CYP4A11Q02928 519 aa28.19■■■□□ 2.1
ANKRD28-203ENST00000439830 EMC2Q15006 297 aa28.19■■■□□ 2.1
ANKRD28-203ENST00000439830 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
ANKRD28-203ENST00000439830 SLC39A11Q8N1S5 342 aa28.19■■■□□ 2.1
ANKRD28-203ENST00000439830 TMEM143Q96AN5 459 aa28.19■■■□□ 2.1
ANKRD28-203ENST00000439830 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
ANKRD28-203ENST00000439830 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
ANKRD28-203ENST00000439830 FAM105AQ9NUU6 356 aa28.19■■■□□ 2.1
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ANKRD28-203ENST00000439830 XKR9Q5GH70 373 aa28.18■■■□□ 2.1
ANKRD28-203ENST00000439830 TCP11Q8WWU5 503 aa28.18■■■□□ 2.1
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ANKRD28-203ENST00000439830 TRIOO75962 3097 aa28.18■■■□□ 2.1
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ANKRD28-203ENST00000439830 GLB1LQ6UWU2 654 aa28.17■■■□□ 2.1
ANKRD28-203ENST00000439830 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa28.17■■■□□ 2.1
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ANKRD28-203ENST00000439830 LPPQ93052 612 aa28.17■■■□□ 2.1
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ANKRD28-203ENST00000439830 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
ANKRD28-203ENST00000439830 PRR33A8MZF0 331 aa28.16■■■□□ 2.1
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ANKRD28-203ENST00000439830 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa28.16■■■□□ 2.1
ANKRD28-203ENST00000439830 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
ANKRD28-203ENST00000439830 BCAR1P56945 870 aa28.16■■■□□ 2.1
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ANKRD28-203ENST00000439830 TPH2Q8IWU9 490 aa28.16■■■□□ 2.1
ANKRD28-203ENST00000439830 MTRQ99707 1265 aa28.16■■■□□ 2.1
ANKRD28-203ENST00000439830 CARNS1A5YM72 827 aa28.15■■■□□ 2.1
ANKRD28-203ENST00000439830 ZNF623O75123 536 aa28.15■■■□□ 2.1
ANKRD28-203ENST00000439830 LONRF3Q496Y0 759 aa28.15■■■□□ 2.1
ANKRD28-203ENST00000439830 TMEM169Q96HH4 297 aa28.15■■■□□ 2.1
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ANKRD28-203ENST00000439830 HIDE1A8MVS5 230 aa28.14■■■□□ 2.1
ANKRD28-203ENST00000439830 ASAP2O43150 1006 aa28.14■■■□□ 2.1
ANKRD28-203ENST00000439830 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP28.14■■■□□ 2.1
ANKRD28-203ENST00000439830 SLITRK3O94933 977 aa28.14■■■□□ 2.1
ANKRD28-203ENST00000439830 SEC24BO95487 1268 aa28.14■■■□□ 2.1
ANKRD28-203ENST00000439830 ST3GAL1Q11201 340 aa28.14■■■□□ 2.1
ANKRD28-203ENST00000439830 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
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ANKRD28-203ENST00000439830 PGBD4Q96DM1 585 aa28.14■■■□□ 2.1
ANKRD28-203ENST00000439830 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
ANKRD28-203ENST00000439830 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa28.14■■■□□ 2.1
ANKRD28-203ENST00000439830 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa28.14■■■□□ 2.1
ANKRD28-203ENST00000439830 ZBTB39O15060 712 aa28.13■■■□□ 2.09
ANKRD28-203ENST00000439830 KCNC3Q14003 757 aa28.13■■■□□ 2.09
ANKRD28-203ENST00000439830 NOMO2Q5JPE7 1267 aa28.13■■■□□ 2.09
ANKRD28-203ENST00000439830 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa28.13■■■□□ 2.09
ANKRD28-203ENST00000439830 RNF149Q8NC42 400 aa28.13■■■□□ 2.09
ANKRD28-203ENST00000439830 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
ANKRD28-203ENST00000439830 MINDY3Q9H8M7 445 aa28.13■■■□□ 2.09
ANKRD28-203ENST00000439830 TBC1D13Q9NVG8 400 aa28.13■■■□□ 2.09
ANKRD28-203ENST00000439830 MUC6Q6W4X9 2439 aa28.13■■■□□ 2.09
ANKRD28-203ENST00000439830 TECTAO75443 2155 aa28.12■■■□□ 2.09
ANKRD28-203ENST00000439830 MEIS3P2A8K0S8 358 aa28.12■■■□□ 2.09
ANKRD28-203ENST00000439830 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa28.12■■■□□ 2.09
ANKRD28-203ENST00000439830 WNT7AO00755 349 aa28.12■■■□□ 2.09
ANKRD28-203ENST00000439830 LYPLA2O95372 231 aa28.12■■■□□ 2.09
ANKRD28-203ENST00000439830 PLA2G5P39877 138 aa28.12■■■□□ 2.09
ANKRD28-203ENST00000439830 TXKP42681 527 aa28.12■■■□□ 2.09
ANKRD28-203ENST00000439830 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
ANKRD28-203ENST00000439830 RNF135Q8IUD6 432 aa28.12■■■□□ 2.09
ANKRD28-203ENST00000439830 HSD17B14Q9BPX1 270 aa28.12■■■□□ 2.09
ANKRD28-203ENST00000439830 MUTYHQ9UIF7 546 aa28.12■■■□□ 2.09
ANKRD28-203ENST00000439830 ZNF318Q5VUA4 2279 aa28.11■■■□□ 2.09
ANKRD28-203ENST00000439830 OFD1O75665 1012 aa28.11■■■□□ 2.09
ANKRD28-203ENST00000439830 ERLIN2O94905 339 aa28.11■■■□□ 2.09
ANKRD28-203ENST00000439830 TECP42680 631 aa28.11■■■□□ 2.09
ANKRD28-203ENST00000439830 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
ANKRD28-203ENST00000439830 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
ANKRD28-203ENST00000439830 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP28.11■■■□□ 2.09
ANKRD28-203ENST00000439830 ANKRD54Q6NXT1 300 aa28.11■■■□□ 2.09
ANKRD28-203ENST00000439830 LLGL2Q6P1M3 1020 aa28.11■■■□□ 2.09
ANKRD28-203ENST00000439830 URGCPQ8TCY9 931 aa28.11■■■□□ 2.09
ANKRD28-203ENST00000439830 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa28.11■■■□□ 2.09
ANKRD28-203ENST00000439830 ANKEF1Q9NU02 776 aa28.11■■■□□ 2.09
ANKRD28-203ENST00000439830 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa28.11■■■□□ 2.09
ANKRD28-203ENST00000439830 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
ANKRD28-203ENST00000439830 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
ANKRD28-203ENST00000439830 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
ANKRD28-203ENST00000439830 SUSD6Q92537 303 aa28.1■■■□□ 2.09
ANKRD28-203ENST00000439830 FAM122AQ96E09 287 aa28.1■■■□□ 2.09
ANKRD28-203ENST00000439830 MTMR9Q96QG7 549 aa28.1■■■□□ 2.09
ANKRD28-203ENST00000439830 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
ANKRD28-203ENST00000439830 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa28.1■■■□□ 2.09
ANKRD28-203ENST00000439830 C2orf71A6NGG8 1288 aa28.09■■■□□ 2.09
ANKRD28-203ENST00000439830 LOC730098B7Z3J9 87 aa28.09■■■□□ 2.09
ANKRD28-203ENST00000439830 DGAT1O75907 488 aa28.09■■■□□ 2.09
ANKRD28-203ENST00000439830 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
ANKRD28-203ENST00000439830 CA8P35219 290 aa28.09■■■□□ 2.09
ANKRD28-203ENST00000439830 TFDP1Q14186 410 aa28.09■■■□□ 2.09
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ANKRD28-203ENST00000439830 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
ANKRD28-203ENST00000439830 CASP10Q92851 521 aa28.09■■■□□ 2.09
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