RNA–Protein interactions for RNA: YMR246W

FAA4, Transcript of Long chain fatty acyl-CoA synthetase, yeast

Gene FAA4, Length 2,085 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
FAA4	YMR246W	MMT1	Q03218	510 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	VPS60	Q03390	229 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	TAF12	Q03761	539 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	ARP10	Q04549	284 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	APC4	Q04601	652 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	NDD1	Q08887	554 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	PFA4	Q12006	378 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	YLR111W	Q12528	110 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	RNQ1	P25367	405 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	ADY2	P25613	283 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	YKR015C	P36111	568 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	CHK1	P38147	527 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	LAG1	P38703	411 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	YHR182W	P38870	785 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	SER33	P40510	469 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	AGE2	P40529	298 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	SNZ3	P43545	298 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	CIS3	P47001	227 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	SNZ2	P53824	298 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	GPI15	P53961	229 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	MPS1	P54199	764 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	YDL218W	Q07629	317 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	DDC1	Q08949	612 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.81	□□□□□ -1.64	not detected
FAA4	YMR246W	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	TOA2	P32774	122 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	ECT1	P33412	323 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	RTC2	P38279	296 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	TAE1	P38340	232 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	YHR045W	P38775	560 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	STE24	P47154	453 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	CMC2	Q3E7A4	109 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	FSH3	Q99369	266 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	CKI1	P20485	582 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	DAL2	P25335	343 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	BUB3	P26449	341 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	RCY1	P39531	840 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	MRK1	P50873	501 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	GIM5	Q04493	163 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	SYO1	Q07395	620 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	PER33	Q12144	273 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	DST1	P07273	309 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	YKL162C	P36052	402 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	FLO10	P36170	1169 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	TCD1	P38756	429 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	SNL1	P40548	159 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	RTT101	P47050	842 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	YPL068C	Q02749	293 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	YLR012C	Q07927	99 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	PET100	P38958	111 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	PCP1	P53259	346 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	YPL062W	Q02781	134 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	VHS1	Q03785	461 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	SPC2	Q04969	178 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	GRS2	Q06817	618 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	AAD15	Q08361	143 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	NRT1	Q08485	598 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	TMS1	Q12116	473 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	SKN1	P33336	771 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	TAF14	P35189	244 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	PHB2	P50085	310 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	PET117	Q02771	107 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	SRL4	Q03085	281 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	ASA1	Q06822	443 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	YDL109C	Q12103	647 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	ATG34	Q12292	412 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	ORT1	Q12375	292 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAA4	YMR246W	YLL053C	P0CD98	152 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAA4	YMR246W	GAT1	P43574	510 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAA4	YMR246W	YJL118W	P47022	219 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAA4	YMR246W	SMP3	Q04174	516 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAA4	YMR246W	PUS9	Q12069	462 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAA4	YMR246W	BI2	P03873	423 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAA4	YMR246W	GPI12	P23797	304 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAA4	YMR246W	MXR2	P25566	168 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAA4	YMR246W	REC114	P32841	428 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAA4	YMR246W	RPC25	P35718	212 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAA4	YMR246W	PCL6	P40038	420 aa		4.77	□□□□□ -1.65

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