RNA–Protein interactions for RNA: YMR196W

YMR196W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YMR196W, Length 3,267 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR196WYMR196W SEC72P39742 193 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W YIL108WP40483 696 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W IRC7P43623 340 aa4.4□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W JHD2P47156 728 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W PUS4P48567 403 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W CWC27Q02770 301 aa4.4□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W MSC1Q03104 513 aa4.4□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W YDR179W-AQ03983 463 aa4.4□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W FMP42Q04991 504 aa4.4□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W YOR114WQ12219 294 aa4.4□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W YDR262WQ12331 272 aa4.4□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W YPR064WQ12492 139 aa4.4□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W Q0144Q9ZZW2 109 aa4.4□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W MDM35O60200 86 aa4.39□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W PPH21P23594 369 aa4.39□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W CNB1P25296 175 aa4.39□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W CTS1P29029 562 aa4.39□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W MRPL6P32904 214 aa4.39□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W YOX1P34161 385 aa4.39□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W ECM8P38246 354 aa4.39□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W TIF11P38912 153 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W SER3P40054 469 aa4.39□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W SDT1P53078 280 aa4.39□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W TNA1P53322 534 aa4.39□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W CSL4P53859 292 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W CTF19Q02732 369 aa4.39□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W ISU1Q03020 165 aa4.39□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W SSY1Q03770 852 aa4.39□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W MTQ2Q03920 221 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W YDR444WQ04093 687 aa4.39□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W YPR127WQ06494 345 aa4.39□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W TEN1Q07921 160 aa4.39□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W RRP40Q08285 240 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W PAA1Q12447 191 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W CNA1P23287 553 aa4.39□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W SRX1P36077 127 aa4.39□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W MAD2P40958 196 aa4.39□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W NIT2P47016 307 aa4.39□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W EMC2P47133 292 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W VID22Q05934 901 aa4.39□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W RAX1Q08760 435 aa4.39□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W PET9P18239 318 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W YIM1P28625 365 aa4.38□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W BNA4P38169 460 aa4.38□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W YHR177WP38867 453 aa4.38□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W MNN10P50108 393 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W RHO3Q00245 231 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W FYV7Q12247 151 aa4.38□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W YPL119C-AQ3E751 87 aa4.38□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W NFT1P0CE68 1218 aa4.38□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W ARO3P14843 370 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W AGP1P25376 633 aa4.38□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W LHP1P33399 275 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W ANR2P36090 516 aaPredicted RBP4.38□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W AHP1P38013 176 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W YBR184WP38299 523 aa4.38□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W YAL037WP39728 267 aa4.38□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W HXT16P47185 567 aa4.38□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W HSV2P50079 448 aaPredicted RBP4.38□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W YGL159WP53110 370 aa4.38□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W SLD3P53135 668 aa4.38□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W FHN1P53279 174 aa4.38□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W HXT15P54854 567 aa4.38□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W MRP51Q02950 344 aa4.38□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W PLM2Q04383 521 aa4.38□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W GPN3Q06543 272 aa4.38□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W YLR036CQ07986 203 aa4.38□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W RIB3Q99258 208 aa4.38□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W PUT2P07275 575 aa4.38□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W RPS1BP23248 255 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W DAL3P32459 195 aa4.38□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W SFC1P33303 322 aa4.38□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W SLC1P33333 303 aa4.38□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W NTR2P36118 322 aaPredicted RBP4.38□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W APT2P36973 181 aa4.38□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W YHR033WP38690 423 aa4.38□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W GOS1P38736 223 aa4.38□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W DAM1P53267 343 aa4.38□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W TMA20P89886 181 aaPredicted RBP4.38□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W YMR210WQ03649 449 aa4.38□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W RQC1Q05468 723 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W DCN1Q12395 269 aa4.38□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W PNO1Q99216 274 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W COX3P00420 269 aa4.37□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W SNF6P18888 332 aa4.37□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W IFM1P25038 676 aa4.37□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W RNQ1P25367 405 aa4.37□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W NRP1P32770 719 aaKnown RBP RIP-Chip data4.37□□□□□ -1.71not detected
YMR196WYMR196W FMP46P36141 133 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W ASC1P38011 319 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W FAT1P38225 669 aa4.37□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W SWS2P53937 143 aa4.37□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W LUC7Q07508 261 aaPredicted RBP4.37□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W YEH1Q07804 573 aa4.37□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W SKI7Q08491 747 aaPredicted RBP4.37□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W FRE5Q08908 694 aa4.37□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W POL2P21951 2222 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W TPK3P05986 398 aa4.37□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W STE7P06784 515 aa4.37□□□□□ -1.71
YMR196WYMR196W CDC4P07834 779 aa4.37□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 92.4 ms