RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561685.1

RRN3-204, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5

Gene RRN3, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-204	ENST00000561685	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	GAREM2	Q75VX8	874 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	CLEC14A	Q86T13	490 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	KIF18B	Q86Y91	864 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	PLA2G15	Q8NCC3	412 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	UBXN4	Q92575	508 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	GPHA2	Q96T91	129 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	TCF25	Q9BQ70	676 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	IL23A	Q9NPF7	189 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	CEP72	Q9P209	647 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	MTSS1	O43312	755 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	ASMTL	O95671	621 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	SDS	P20132	328 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	STAT3	P40763	770 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	MAN2A2	P49641	1150 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	ADCY2	Q08462	1091 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	MYBPC3	Q14896	1274 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	TCEA2	Q15560	299 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	KRT40	Q6A162	431 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685		A0A0A6YYJ9	748 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	GAS7	O60861	476 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	TOX4	O94842	621 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	SLC9A1	P19634	815 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	INHBC	P55103	352 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	PASD1	Q8IV76	773 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	GSPT2	Q8IYD1	628 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	MTG2	Q9H4K7	406 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	DNAI1	Q9UI46	699 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	UBE2QL1	A1L167	161 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	OPHN1	O60890	802 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	FSBP	O95073	299 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	CD40	P25942	277 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	KIR2DL3	P43628	341 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	EFHB	Q8N7U6	833 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	CHFR	Q96EP1	664 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	HIST1H2AH	Q96KK5	128 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	DRC1	Q96MC2	740 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	HIST1H2AJ	Q99878	128 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	TOMM22	Q9NS69	142 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	IFT57	Q9NWB7	429 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	OXSM	Q9NWU1	459 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRN3-204	ENST00000561685	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	OVOL3	O00110	214 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	NRP1	O14786	923 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	MFAP3L	O75121	409 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	F2	P00734	622 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	SCNN1G	P51170	649 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	LRRC32	Q14392	662 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	ACAP1	Q15027	740 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685		Q6ZRM9	215 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	HTR3D	Q70Z44	454 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	HOMER1	Q86YM7	354 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	ARL8A	Q96BM9	186 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	UIMC1	Q96RL1	719 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	PRRX2	Q99811	253 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	MYL10	Q9BUA6	226 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	APOL3	O95236	402 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	PTGS2	P35354	604 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	NPEPPS	P55786	919 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	INHBE	P58166	350 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	DSG1	Q02413	1049 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	SPIDR	Q14159	915 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	GPR158	Q5T848	1215 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRN3-204	ENST00000561685	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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