RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384160.1

RNU6-1008P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1008, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1008P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NLRC3Q7RTR2 1065 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RSPH3Q86UC2 560 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DTX2Q86UW9 622 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 IQCF1Q8N6M8 205 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LINC00612Q8N6U2 182 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NAT16Q8N8M0 369 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ANKRD52Q8NB46 1076 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 XAGE3Q8WTP9 111 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ASPNQ9BXN1 380 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 HDAC8Q9BY41 377 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CHST11Q9NPF2 352 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ANAPC11Q9NYG5 84 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 UTS2RQ9UKP6 389 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CCDC151A5D8V7 595 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FBXO21O94952 628 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 KNG1P01042 644 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 IGLV2-11P01706 119 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TACR1P25103 407 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 UGP2Q16851 508 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 WSCD2Q2TBF2 565 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZNF718Q3SXZ3 478 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 KRT39Q6A163 491 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MFSD5Q6N075 450 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LBX2Q6XYB7 198 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 USP30Q70CQ3 517 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PELI3Q8N2H9 469 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PLPP7Q8NBV4 271 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CFHR4Q92496 578 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RNF181Q9P0P0 153 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 GAB2Q9UQC2 676 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 USP17L3A6NCW0 530 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 USP17L4A6NCW7 530 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 IGKV3-15P01624 115 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 USP17L8P0C7I0 530 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PSG1P11464 419 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PKMP14618 531 aaKnown RBP-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PDE6AP16499 860 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 EN2P19622 333 aaPredicted RBP-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PPP2R3AQ06190 1150 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NKG7Q16617 165 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CR1LQ2VPA4 569 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FAM76BQ5HYJ3 339 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MYSM1Q5VVJ2 828 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 USP17L1Q7RTZ2 530 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 C12orf40Q86WS4 652 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DNAJB8Q8NHS0 232 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ELMO3Q96BJ8 720 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 COQ8BQ96D53 544 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FBXO17Q96EF6 278 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RHOVQ96L33 236 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FBRSQ9HAH7 460 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 KCNMB3Q9NPA1 279 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 IL17RBQ9NRM6 502 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CNTN3Q9P232 1028 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MED16Q9Y2X0 877 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CSADQ9Y600 493 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 EVPLQ92817 2033 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 A0A1W2PRX2 142 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 C2orf71A6NGG8 1288 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 METTL12A8MUP2 240 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DCDC2CA8MYV0 355 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TPP1O14773 563 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 UGDHO60701 494 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TULP3O75386 442 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 AP1G2O75843 785 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 IGKV1D-16P01601 117 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ITGAMP11215 1152 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 L1CAMP32004 1257 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CLK2P49760 499 aaKnown RBP-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 KCNQ1P51787 676 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ETF1P62495 437 aaKnown RBP-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TFF2Q03403 129 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP-0.96□□□□□ -2.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11 ms