RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366607.4

TOMM20-201, Transcript of translocase of outer mitochondrial membrane 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOMM20, Length 3,387 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM20-201ENST00000366607 PAEPP09466 180 aa12.35□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 GHRP10912 638 aa12.35□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 PCK1P35558 622 aa12.35□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 STAT1P42224 750 aa12.35□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 MMP13P45452 471 aa12.35□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 KCTD1Q719H9 257 aa12.35□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 FITM2Q8N6M3 262 aa12.35□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 USP40Q9NVE5 1235 aa12.35□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 SNX3O60493 162 aa12.35□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 CYP2J2P51589 502 aa12.35□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa12.35□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa12.35□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa12.35□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 RNF217Q8TC41 542 aa12.35□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 MYH3P11055 1940 aa12.35□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 CYP11B2P19099 503 aa12.35□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 TNFAIP3P21580 790 aa12.35□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 KLRC3Q07444 240 aa12.35□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 ZDHHC24Q6UX98 284 aa12.35□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 NSMFQ6X4W1 530 aa12.35□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 EXOC3L1Q86VI1 746 aa12.35□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 MED24O75448 989 aa12.34□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 MSH2P43246 934 aa12.34□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 PSMD2Q13200 908 aa12.34□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 CNGA2Q16280 664 aa12.34□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 PRUNE1Q86TP1 453 aa12.34□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 C1orf54Q8WWF1 131 aa12.34□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 KCTD10Q9H3F6 313 aa12.34□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 EBF2Q9HAK2 575 aa12.34□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa12.34□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa12.34□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa12.34□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 RPTORQ8N122 1335 aa12.34□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 TIAM2Q8IVF5 1701 aa12.34□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 SUN1O94901 812 aa12.34□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 BTDP43251 543 aa12.34□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 AUHQ13825 339 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 COG2Q14746 738 aa12.34□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 DUPD1Q68J44 220 aa12.34□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 TTC27Q6P3X3 843 aa12.34□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 SYCE1Q8N0S2 351 aa12.34□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 C3orf20Q8ND61 904 aa12.34□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 CEP63Q96MT8 703 aa12.34□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 ASAP2O43150 1006 aa12.33□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 SERPINB2P05120 415 aa12.33□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP12.33□□□□□ -0.431e-6■□□□□ 9.9
TOMM20-201ENST00000366607 PDE6CP51160 858 aa12.33□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 COPS2P61201 443 aa12.33□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 ATP11AP98196 1134 aa12.33□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 KYNUQ16719 465 aa12.33□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 PRR16Q569H4 304 aa12.33□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 ARSHQ5FYA8 562 aa12.33□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 ARMC3Q5W041 872 aa12.33□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 FBXO33Q7Z6M2 555 aa12.33□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 LONP2Q86WA8 852 aa12.33□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 VSIG1Q86XK7 387 aa12.33□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa12.33□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 PIGOQ8TEQ8 1089 aa12.33□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa12.33□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 KCNQ5Q9NR82 932 aa12.33□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 LRRC4BQ9NT99 713 aa12.33□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 ADAM22Q9P0K1 906 aa12.33□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 DNAJC12Q9UKB3 198 aa12.33□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 COG5Q9UP83 839 aa12.33□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 ALG6Q9Y672 507 aa12.33□□□□□ -0.43
TOMM20-201ENST00000366607 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
TOMM20-201ENST00000366607 GNA14O95837 355 aa12.33□□□□□ -0.44
TOMM20-201ENST00000366607 TARSP26639 723 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
TOMM20-201ENST00000366607 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
TOMM20-201ENST00000366607 PTENP60484 403 aa12.33□□□□□ -0.44
TOMM20-201ENST00000366607 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
TOMM20-201ENST00000366607 SBK1Q52WX2 424 aa12.33□□□□□ -0.44
TOMM20-201ENST00000366607 C6orf118Q5T5N4 469 aa12.33□□□□□ -0.44
TOMM20-201ENST00000366607 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
TOMM20-201ENST00000366607 MAGEC3Q8TD91 643 aa12.33□□□□□ -0.44
TOMM20-201ENST00000366607 SLC20A1Q8WUM9 679 aa12.33□□□□□ -0.44
TOMM20-201ENST00000366607 HES6Q96HZ4 224 aa12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 184.6 ms