RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641145.1

NFIC-211, Transcript of nuclear factor I C, humanhuman

BASIC

Gene NFIC, Length 8,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIC-211ENST00000641145 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
NFIC-211ENST00000641145 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP19.97■□□□□ 0.79
NFIC-211ENST00000641145 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
NFIC-211ENST00000641145 ST18O60284 1047 aa19.97■□□□□ 0.79
NFIC-211ENST00000641145 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa19.97■□□□□ 0.79
NFIC-211ENST00000641145 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
NFIC-211ENST00000641145 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
NFIC-211ENST00000641145 WWC2Q6AWC2 1192 aa19.96■□□□□ 0.79
NFIC-211ENST00000641145 APPP05067 770 aa19.95■□□□□ 0.78
NFIC-211ENST00000641145 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
NFIC-211ENST00000641145 DCTN1Q14203 1278 aa19.95■□□□□ 0.78
NFIC-211ENST00000641145 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
NFIC-211ENST00000641145 TRIM29Q14134 588 aa19.94■□□□□ 0.78
NFIC-211ENST00000641145 ZNF592Q92610 1267 aa19.94■□□□□ 0.78
NFIC-211ENST00000641145 EPS15P42566 896 aa19.93■□□□□ 0.78
NFIC-211ENST00000641145 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
NFIC-211ENST00000641145 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
NFIC-211ENST00000641145 CCDC173Q0VFZ6 552 aa19.92■□□□□ 0.78
NFIC-211ENST00000641145 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
NFIC-211ENST00000641145 SLC4A10Q6U841 1118 aa19.91■□□□□ 0.78
NFIC-211ENST00000641145 MCTP1Q6DN14 999 aa19.91■□□□□ 0.78
NFIC-211ENST00000641145 MYO6Q9UM54 1294 aa19.9■□□□□ 0.78
NFIC-211ENST00000641145 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa19.9■□□□□ 0.78
NFIC-211ENST00000641145 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.78
NFIC-211ENST00000641145 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.78
NFIC-211ENST00000641145 FBXW7Q969H0 707 aa19.89■□□□□ 0.77
NFIC-211ENST00000641145 VSIG10Q8N0Z9 540 aa19.89■□□□□ 0.77
NFIC-211ENST00000641145 STK26Q9P289 416 aa19.89■□□□□ 0.77
NFIC-211ENST00000641145 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa19.89■□□□□ 0.77
NFIC-211ENST00000641145 HOMER1Q86YM7 354 aa19.88■□□□□ 0.77
NFIC-211ENST00000641145 ACBD3Q9H3P7 528 aa19.88■□□□□ 0.77
NFIC-211ENST00000641145 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
NFIC-211ENST00000641145 FOXD4L1Q9NU39 408 aa19.87■□□□□ 0.77
NFIC-211ENST00000641145 VPS37DQ86XT2 251 aa19.87■□□□□ 0.77
NFIC-211ENST00000641145 TMEM132AQ24JP5 1023 aa19.85■□□□□ 0.77
NFIC-211ENST00000641145 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.77
NFIC-211ENST00000641145 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.77
NFIC-211ENST00000641145 PLCD4Q9BRC7 762 aa19.83■□□□□ 0.76
NFIC-211ENST00000641145 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP19.82■□□□□ 0.76
NFIC-211ENST00000641145 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP19.82■□□□□ 0.76
NFIC-211ENST00000641145 NEXNQ0ZGT2 675 aa19.82■□□□□ 0.76
NFIC-211ENST00000641145 KLHL34Q8N239 644 aa19.81■□□□□ 0.76
NFIC-211ENST00000641145 H0YHG0 523 aa19.81■□□□□ 0.76
NFIC-211ENST00000641145 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa19.81■□□□□ 0.76
NFIC-211ENST00000641145 DDX11L8A8MPP1 907 aa19.81■□□□□ 0.76
NFIC-211ENST00000641145 SMC4Q9NTJ3 1288 aa19.8■□□□□ 0.76
NFIC-211ENST00000641145 NEFHP12036 1026 aa19.8■□□□□ 0.76
NFIC-211ENST00000641145 HSP90B2PQ58FF3 399 aa19.8■□□□□ 0.76
NFIC-211ENST00000641145 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP19.8■□□□□ 0.76
NFIC-211ENST00000641145 OFD1O75665 1012 aa19.79■□□□□ 0.76
NFIC-211ENST00000641145 DCAF11Q8TEB1 546 aa19.79■□□□□ 0.76
NFIC-211ENST00000641145 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
NFIC-211ENST00000641145 EVA1CP58658 441 aa19.79■□□□□ 0.76
NFIC-211ENST00000641145 ERICH2A1L162 156 aa19.78■□□□□ 0.76
NFIC-211ENST00000641145 RILPL2Q969X0 211 aa19.78■□□□□ 0.76
NFIC-211ENST00000641145 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
NFIC-211ENST00000641145 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa19.77■□□□□ 0.75
NFIC-211ENST00000641145 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
NFIC-211ENST00000641145 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
NFIC-211ENST00000641145 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
NFIC-211ENST00000641145 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
NFIC-211ENST00000641145 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
NFIC-211ENST00000641145 CAGE1Q8TC20 777 aa19.75■□□□□ 0.75
NFIC-211ENST00000641145 STK11IPQ8N1F8 1099 aa19.75■□□□□ 0.75
NFIC-211ENST00000641145 CPLX1O14810 134 aa19.74■□□□□ 0.75
NFIC-211ENST00000641145 AMPHP49418 695 aa19.74■□□□□ 0.75
NFIC-211ENST00000641145 TRDNQ13061 729 aa19.74■□□□□ 0.75
NFIC-211ENST00000641145 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
NFIC-211ENST00000641145 ANKRD62A6NC57 917 aa19.73■□□□□ 0.75
NFIC-211ENST00000641145 NFXL1Q6ZNB6 911 aa19.73■□□□□ 0.75
NFIC-211ENST00000641145 LMOD3Q0VAK6 560 aa19.73■□□□□ 0.75
NFIC-211ENST00000641145 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
NFIC-211ENST00000641145 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
NFIC-211ENST00000641145 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
NFIC-211ENST00000641145 SYCP1Q15431 976 aa19.71■□□□□ 0.75
NFIC-211ENST00000641145 SCRIBQ14160 1630 aa19.7■□□□□ 0.74
NFIC-211ENST00000641145 SKIDA1Q1XH10 827 aa19.7■□□□□ 0.74
NFIC-211ENST00000641145 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
NFIC-211ENST00000641145 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
NFIC-211ENST00000641145 MNS1Q8NEH6 495 aa19.69■□□□□ 0.74
NFIC-211ENST00000641145 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
NFIC-211ENST00000641145 C1orf141Q5JVX7 400 aa19.68■□□□□ 0.74
NFIC-211ENST00000641145 RSPH6AQ9H0K4 717 aa19.68■□□□□ 0.74
NFIC-211ENST00000641145 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
NFIC-211ENST00000641145 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa19.68■□□□□ 0.74
NFIC-211ENST00000641145 RCAN3Q9UKA8 241 aa19.68■□□□□ 0.74
NFIC-211ENST00000641145 CLIP1P30622 1438 aa19.67■□□□□ 0.74
NFIC-211ENST00000641145 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP19.67■□□□□ 0.74
NFIC-211ENST00000641145 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP19.67■□□□□ 0.74
NFIC-211ENST00000641145 EZRP15311 586 aaKnown RBP19.67■□□□□ 0.74
NFIC-211ENST00000641145 IKQ13123 557 aaPredicted RBP19.67■□□□□ 0.74
NFIC-211ENST00000641145 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
NFIC-211ENST00000641145 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP19.66■□□□□ 0.74
NFIC-211ENST00000641145 BRMS1Q9HCU9 246 aa19.66■□□□□ 0.74
NFIC-211ENST00000641145 BICD2Q8TD16 824 aa19.66■□□□□ 0.74
NFIC-211ENST00000641145 RUFY2Q8WXA3 655 aa19.66■□□□□ 0.74
NFIC-211ENST00000641145 EID1Q9Y6B2 187 aa19.66■□□□□ 0.74
NFIC-211ENST00000641145 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
NFIC-211ENST00000641145 ERLIN2O94905 339 aa19.65■□□□□ 0.74
NFIC-211ENST00000641145 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa19.64■□□□□ 0.74
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