RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615637.2

FOXD1-202, Transcript of forkhead box D1, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene FOXD1, Length 2,272 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1-202ENST00000615637 RRP1P56182 461 aaKnown RBP40.92■■■■■ 4.14
FOXD1-202ENST00000615637 NBR1Q14596 966 aa40.92■■■■■ 4.14
FOXD1-202ENST00000615637 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa40.92■■■■■ 4.14
FOXD1-202ENST00000615637 SYNJ2O15056 1496 aa40.91■■■■■ 4.14
FOXD1-202ENST00000615637 DCAF11Q8TEB1 546 aa40.9■■■■■ 4.14
FOXD1-202ENST00000615637 ABCA8O94911 1581 aa40.9■■■■■ 4.14
FOXD1-202ENST00000615637 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.85■■■■■ 4.13
FOXD1-202ENST00000615637 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa40.85■■■■■ 4.13
FOXD1-202ENST00000615637 ARHGEF5Q12774 1597 aa40.85■■■■■ 4.13
FOXD1-202ENST00000615637 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.84■■■■■ 4.13
FOXD1-202ENST00000615637 PARD3Q8TEW0 1356 aa40.84■■■■■ 4.13
FOXD1-202ENST00000615637 ATP10BO94823 1461 aa40.82■■■■■ 4.13
FOXD1-202ENST00000615637 TSPY4P0CV99 314 aa40.82■■■■■ 4.12
FOXD1-202ENST00000615637 TSPY10P0CW01 314 aa40.82■■■■■ 4.12
FOXD1-202ENST00000615637 RCAN3Q9UKA8 241 aa40.81■■■■■ 4.12
FOXD1-202ENST00000615637 EXOC6Q8TAG9 804 aa40.81■■■■■ 4.12
FOXD1-202ENST00000615637 NLRP13Q86W25 1043 aa40.8■■■■■ 4.12
FOXD1-202ENST00000615637 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP40.8■■■■■ 4.12
FOXD1-202ENST00000615637 NUP160Q12769 1436 aa40.8■■■■■ 4.12
FOXD1-202ENST00000615637 JPH4Q96JJ6 628 aa40.79■■■■■ 4.12
FOXD1-202ENST00000615637 FAM135AQ9P2D6 1515 aa40.77■■■■■ 4.12
FOXD1-202ENST00000615637 PRAG1Q86YV5 1406 aa40.77■■■■■ 4.12
FOXD1-202ENST00000615637 PDE3BQ13370 1112 aa40.73■■■■■ 4.11
FOXD1-202ENST00000615637 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP40.71■■■■■ 4.11
FOXD1-202ENST00000615637 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP40.7■■■■■ 4.11
FOXD1-202ENST00000615637 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP40.68■■■■■ 4.1
FOXD1-202ENST00000615637 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP40.67■■■■■ 4.1
FOXD1-202ENST00000615637 FBLN2P98095 1184 aa40.65■■■■■ 4.1
FOXD1-202ENST00000615637 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa40.65■■■■■ 4.1
FOXD1-202ENST00000615637 CCDC141Q6ZP82 1450 aa40.65■■■■■ 4.1
FOXD1-202ENST00000615637 GPRASP1Q5JY77 1395 aa40.64■■■■■ 4.1
FOXD1-202ENST00000615637 CCDC144AA2RUR9 1427 aa40.64■■■■■ 4.1
FOXD1-202ENST00000615637 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP40.64■■■■■ 4.1
FOXD1-202ENST00000615637 LAMC1P11047 1609 aa40.64■■■■■ 4.1
FOXD1-202ENST00000615637 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa40.61■■■■■ 4.09
FOXD1-202ENST00000615637 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP40.59■■■■■ 4.09
FOXD1-202ENST00000615637 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP40.59■■■■■ 4.09
FOXD1-202ENST00000615637 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa40.59■■■■■ 4.09
FOXD1-202ENST00000615637 INSRP06213 1382 aa40.59■■■■■ 4.09
FOXD1-202ENST00000615637 NBPF1Q3BBV0 1214 aa40.59■■■■■ 4.09
FOXD1-202ENST00000615637 PREX2Q70Z35 1606 aa40.59■■■■■ 4.09
FOXD1-202ENST00000615637 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP40.58■■■■■ 4.09
FOXD1-202ENST00000615637 CDCA7LQ96GN5 454 aa40.58■■■■■ 4.09
FOXD1-202ENST00000615637 PDE4AP27815 886 aa40.58■■■■■ 4.09
FOXD1-202ENST00000615637 A2MP01023 1474 aa40.57■■■■■ 4.08
FOXD1-202ENST00000615637 UNC13BO14795 1591 aa40.56■■■■■ 4.08
FOXD1-202ENST00000615637 PLA2R1Q13018 1463 aa40.56■■■■■ 4.08
FOXD1-202ENST00000615637 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa40.55■■■■■ 4.08
FOXD1-202ENST00000615637 MS4A1P11836 297 aa40.55■■■■■ 4.08
FOXD1-202ENST00000615637 BACH2Q9BYV9 841 aa40.54■■■■■ 4.08
FOXD1-202ENST00000615637 DISP3Q9P2K9 1392 aa40.54■■■■■ 4.08
FOXD1-202ENST00000615637 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP40.53■■■■■ 4.08
FOXD1-202ENST00000615637 MYO5CQ9NQX4 1742 aa40.52■■■■■ 4.08
FOXD1-202ENST00000615637 TESK2Q96S53 571 aa40.51■■■■■ 4.08
FOXD1-202ENST00000615637 RGL3Q3MIN7 710 aa40.48■■■■■ 4.07
FOXD1-202ENST00000615637 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP40.46■■■■■ 4.07
FOXD1-202ENST00000615637 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP40.46■■■■■ 4.07
FOXD1-202ENST00000615637 MAST1Q9Y2H9 1570 aa40.45■■■■■ 4.07
FOXD1-202ENST00000615637 ERBINQ96RT1 1412 aa40.44■■■■■ 4.06
FOXD1-202ENST00000615637 RSPH4AQ5TD94 716 aa40.44■■■■■ 4.06
FOXD1-202ENST00000615637 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa40.43■■■■■ 4.06
FOXD1-202ENST00000615637 SYCP2Q9BX26 1530 aa40.42■■■■■ 4.06
FOXD1-202ENST00000615637 IQGAP3Q86VI3 1631 aa40.42■■■■■ 4.06
FOXD1-202ENST00000615637 PLIN1O60240 522 aa40.41■■■■■ 4.06
FOXD1-202ENST00000615637 PANK3Q9H999 370 aa40.4■■■■■ 4.06
FOXD1-202ENST00000615637 CRBNQ96SW2 442 aa40.36■■■■■ 4.05
FOXD1-202ENST00000615637 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP40.33■■■■■ 4.05
FOXD1-202ENST00000615637 PLXNC1O60486 1568 aa40.32■■■■■ 4.05
FOXD1-202ENST00000615637 TMF1P82094 1093 aa40.3■■■■■ 4.04
FOXD1-202ENST00000615637 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.29■■■■■ 4.04
FOXD1-202ENST00000615637 ATP10AO60312 1499 aa40.29■■■■■ 4.04
FOXD1-202ENST00000615637 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP40.29■■■■■ 4.04
FOXD1-202ENST00000615637 ARHGAP5Q13017 1502 aa40.26■■■■■ 4.04
FOXD1-202ENST00000615637 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP40.26■■■■■ 4.04
FOXD1-202ENST00000615637 SKAP1Q86WV1 359 aa40.24■■■■■ 4.03
FOXD1-202ENST00000615637 USP35Q9P2H5 1018 aa40.23■■■■■ 4.03
FOXD1-202ENST00000615637 MAGI2Q86UL8 1455 aa40.23■■■■■ 4.03
FOXD1-202ENST00000615637 NEFMP07197 916 aa40.21■■■■■ 4.03
FOXD1-202ENST00000615637 ADAMTS8Q9UP79 889 aa40.2■■■■■ 4.03
FOXD1-202ENST00000615637 C20orf194Q5TEA3 1177 aa40.19■■■■■ 4.03
FOXD1-202ENST00000615637 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.19■■■■■ 4.03
FOXD1-202ENST00000615637 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.19■■■■■ 4.02
FOXD1-202ENST00000615637 KDM2BQ8NHM5 1336 aa40.17■■■■■ 4.02
FOXD1-202ENST00000615637 DUOX2Q9NRD8 1548 aa40.17■■■■■ 4.02
FOXD1-202ENST00000615637 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa40.14■■■■■ 4.02
FOXD1-202ENST00000615637 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP40.14■■■■■ 4.02
FOXD1-202ENST00000615637 IQGAP1P46940 1657 aa40.13■■■■■ 4.01
FOXD1-202ENST00000615637 DDRGK1Q96HY6 314 aa40.12■■■■■ 4.01
FOXD1-202ENST00000615637 MADDQ8WXG6 1647 aa40.1■■■■■ 4.01
FOXD1-202ENST00000615637 DUSP27Q5VZP5 1158 aa40.09■■■■■ 4.01
FOXD1-202ENST00000615637 PPP2R1AP30153 589 aa40.09■■■■■ 4.01
FOXD1-202ENST00000615637 ZNF521Q96K83 1311 aa40.07■■■■■ 4.01
FOXD1-202ENST00000615637 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.05■■■■■ 4
FOXD1-202ENST00000615637 SYNMO15061 1565 aa40.05■■■■■ 4
FOXD1-202ENST00000615637 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP40.04■■■■■ 4
FOXD1-202ENST00000615637 KNSTRNQ9Y448 316 aa40.04■■■■■ 4
FOXD1-202ENST00000615637 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP40.03■■■■■ 4
FOXD1-202ENST00000615637 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP40.03■■■■■ 4
FOXD1-202ENST00000615637 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa39.97■■■■□ 3.99
FOXD1-202ENST00000615637 GOLGA2Q08379 1002 aa39.96■■■■□ 3.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms