RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000603043.1

CDCA3-211, Transcript of cell division cycle associated 3, humanhuman

TSL 2

Gene CDCA3, Length 1,995 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3-211ENST00000603043 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.52■■□□□ 1.36
CDCA3-211ENST00000603043 DEPDC5O75140 1603 aa23.51■■□□□ 1.35
CDCA3-211ENST00000603043 MROH1Q8NDA8 1641 aa23.51■■□□□ 1.35
CDCA3-211ENST00000603043 PTPRMP28827 1452 aa23.51■■□□□ 1.35
CDCA3-211ENST00000603043 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
CDCA3-211ENST00000603043 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.5■■□□□ 1.35
CDCA3-211ENST00000603043 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.5■■□□□ 1.35
CDCA3-211ENST00000603043 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
CDCA3-211ENST00000603043 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.48■■□□□ 1.35
CDCA3-211ENST00000603043 MROH2AA6NES4 1674 aa23.48■■□□□ 1.35
CDCA3-211ENST00000603043 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.48■■□□□ 1.35
CDCA3-211ENST00000603043 HFM1A2PYH4 1435 aa23.47■■□□□ 1.35
CDCA3-211ENST00000603043 NAIPQ13075 1403 aa23.47■■□□□ 1.35
CDCA3-211ENST00000603043 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
CDCA3-211ENST00000603043 C3P01024 1663 aa23.44■■□□□ 1.34
CDCA3-211ENST00000603043 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23.44■■□□□ 1.34
CDCA3-211ENST00000603043 CEP152O94986 1710 aa23.44■■□□□ 1.34
CDCA3-211ENST00000603043 UNC13BO14795 1591 aa23.43■■□□□ 1.34
CDCA3-211ENST00000603043 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
CDCA3-211ENST00000603043 ABCC3O15438 1527 aa23.42■■□□□ 1.34
CDCA3-211ENST00000603043 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.42■■□□□ 1.34
CDCA3-211ENST00000603043 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.41■■□□□ 1.34
CDCA3-211ENST00000603043 KANK1Q14678 1352 aa23.41■■□□□ 1.34
CDCA3-211ENST00000603043 ZMYM3Q14202 1370 aa23.4■■□□□ 1.34
CDCA3-211ENST00000603043 VWDEQ8N2E2 1590 aa23.39■■□□□ 1.34
CDCA3-211ENST00000603043 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
CDCA3-211ENST00000603043 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa23.38■■□□□ 1.33
CDCA3-211ENST00000603043 LMTK2Q8IWU2 1503 aa23.34■■□□□ 1.33
CDCA3-211ENST00000603043 IQGAP3Q86VI3 1631 aa23.34■■□□□ 1.33
CDCA3-211ENST00000603043 PZPP20742 1482 aa23.33■■□□□ 1.32
CDCA3-211ENST00000603043 NUP155O75694 1391 aa23.31■■□□□ 1.32
CDCA3-211ENST00000603043 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.31■■□□□ 1.32
CDCA3-211ENST00000603043 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
CDCA3-211ENST00000603043 TET3O43151 1660 aa23.3■■□□□ 1.32
CDCA3-211ENST00000603043 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
CDCA3-211ENST00000603043 EFCAB6Q5THR3 1501 aa23.3■■□□□ 1.32
CDCA3-211ENST00000603043 NPATQ14207 1427 aa23.29■■□□□ 1.32
CDCA3-211ENST00000603043 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
CDCA3-211ENST00000603043 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa23.28■■□□□ 1.32
CDCA3-211ENST00000603043 PREX1Q8TCU6 1659 aa23.26■■□□□ 1.31
CDCA3-211ENST00000603043 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.24■■□□□ 1.31
CDCA3-211ENST00000603043 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
CDCA3-211ENST00000603043 TRIM52Q96A61 297 aa23.24■■□□□ 1.31
CDCA3-211ENST00000603043 ERVK-7P63135 1459 aa23.23■■□□□ 1.31
CDCA3-211ENST00000603043 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa23.22■■□□□ 1.31
CDCA3-211ENST00000603043 E9PCH4 1651 aa23.22■■□□□ 1.31
CDCA3-211ENST00000603043 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
CDCA3-211ENST00000603043 MYO3AQ8NEV4 1616 aa23.21■■□□□ 1.31
CDCA3-211ENST00000603043 TNRQ92752 1358 aa23.2■■□□□ 1.3
CDCA3-211ENST00000603043 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.19■■□□□ 1.3
CDCA3-211ENST00000603043 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
CDCA3-211ENST00000603043 LMTK3Q96Q04 1460 aa23.18■■□□□ 1.3
CDCA3-211ENST00000603043 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
CDCA3-211ENST00000603043 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.3
CDCA3-211ENST00000603043 NOS1P29475 1434 aa23.13■■□□□ 1.29
CDCA3-211ENST00000603043 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
CDCA3-211ENST00000603043 SYNMO15061 1565 aa23.13■■□□□ 1.29
CDCA3-211ENST00000603043 HRCP23327 699 aa23.12■■□□□ 1.29
CDCA3-211ENST00000603043 NLRP1Q9C000 1473 aa23.12■■□□□ 1.29
CDCA3-211ENST00000603043 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa23.11■■□□□ 1.29
CDCA3-211ENST00000603043 A2ML1A8K2U0 1454 aa23.1■■□□□ 1.29
CDCA3-211ENST00000603043 PKD2Q13563 968 aa23.09■■□□□ 1.29
CDCA3-211ENST00000603043 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.09■■□□□ 1.29
CDCA3-211ENST00000603043 HSPA2P54652 639 aa23.05■■□□□ 1.28
CDCA3-211ENST00000603043 PIK3C2BO00750 1634 aa23.05■■□□□ 1.28
CDCA3-211ENST00000603043 UGGT1Q9NYU2 1555 aa23.05■■□□□ 1.28
CDCA3-211ENST00000603043 PTPRTO14522 1441 aa23.04■■□□□ 1.28
CDCA3-211ENST00000603043 UBR1Q8IWV7 1749 aa23.03■■□□□ 1.28
CDCA3-211ENST00000603043 SLC52A1Q9NWF4 448 aa23.03■■□□□ 1.28
CDCA3-211ENST00000603043 TRPM2O94759 1503 aa23.02■■□□□ 1.28
CDCA3-211ENST00000603043 IDI1Q13907 227 aa23.01■■□□□ 1.27
CDCA3-211ENST00000603043 FOXD1Q16676 465 aa23.01■■□□□ 1.27
CDCA3-211ENST00000603043 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
CDCA3-211ENST00000603043 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.99■■□□□ 1.27
CDCA3-211ENST00000603043 PLA2R1Q13018 1463 aa22.99■■□□□ 1.27
CDCA3-211ENST00000603043 ADGRB3O60242 1522 aa22.98■■□□□ 1.27
CDCA3-211ENST00000603043 CLTCL1P53675 1640 aa22.97■■□□□ 1.27
CDCA3-211ENST00000603043 MYO5BQ9ULV0 1848 aa22.97■■□□□ 1.27
CDCA3-211ENST00000603043 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
CDCA3-211ENST00000603043 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.96■■□□□ 1.27
CDCA3-211ENST00000603043 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa22.95■■□□□ 1.26
CDCA3-211ENST00000603043 STRCQ7RTU9 1775 aa22.94■■□□□ 1.26
CDCA3-211ENST00000603043 KIF1BO60333 1816 aa22.93■■□□□ 1.26
CDCA3-211ENST00000603043 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
CDCA3-211ENST00000603043 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
CDCA3-211ENST00000603043 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.9■■□□□ 1.26
CDCA3-211ENST00000603043 SLIT1O75093 1534 aa22.89■■□□□ 1.25
CDCA3-211ENST00000603043 ARHGAP23Q9P227 1491 aa22.87■■□□□ 1.25
CDCA3-211ENST00000603043 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.87■■□□□ 1.25
CDCA3-211ENST00000603043 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.86■■□□□ 1.25
CDCA3-211ENST00000603043 ANKLE2Q86XL3 938 aa22.85■■□□□ 1.25
CDCA3-211ENST00000603043 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.85■■□□□ 1.25
CDCA3-211ENST00000603043 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.83■■□□□ 1.25
CDCA3-211ENST00000603043 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
CDCA3-211ENST00000603043 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
CDCA3-211ENST00000603043 EID1Q9Y6B2 187 aa22.81■■□□□ 1.24
CDCA3-211ENST00000603043 ZFYVE9O95405 1425 aa22.8■■□□□ 1.24
CDCA3-211ENST00000603043 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.8■■□□□ 1.24
CDCA3-211ENST00000603043 RIMS2Q9UQ26 1411 aa22.8■■□□□ 1.24
CDCA3-211ENST00000603043 LTKP29376 864 aa22.8■■□□□ 1.24
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