RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592576.5

EFTUD2-223, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-223	ENST00000592576	GGT6	Q6P531	493 aa		13.51	□□□□□ -0.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	RERE	Q9P2R6	1566 aa		13.51	□□□□□ -0.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		13.51	□□□□□ -0.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	UNC13B	O14795	1591 aa		13.51	□□□□□ -0.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		13.5	□□□□□ -0.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	PZP	P20742	1482 aa		13.5	□□□□□ -0.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	DEPDC5	O75140	1603 aa		13.49	□□□□□ -0.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		13.48	□□□□□ -0.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		13.48	□□□□□ -0.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	AGL	P35573	1532 aa		13.48	□□□□□ -0.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		13.48	□□□□□ -0.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		13.48	□□□□□ -0.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	KANK1	Q14678	1352 aa		13.47	□□□□□ -0.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	MLEC	Q14165	292 aa		13.46	□□□□□ -0.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	FOXD1	Q16676	465 aa		13.46	□□□□□ -0.25
EFTUD2-223	ENST00000592576	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		13.46	□□□□□ -0.26
EFTUD2-223	ENST00000592576	PKD2	Q13563	968 aa		13.46	□□□□□ -0.26
EFTUD2-223	ENST00000592576	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		13.45	□□□□□ -0.26
EFTUD2-223	ENST00000592576	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		13.44	□□□□□ -0.26
EFTUD2-223	ENST00000592576	ABCC3	O15438	1527 aa		13.41	□□□□□ -0.26
EFTUD2-223	ENST00000592576	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		13.41	□□□□□ -0.26
EFTUD2-223	ENST00000592576	CEP152	O94986	1710 aa		13.4	□□□□□ -0.26
EFTUD2-223	ENST00000592576	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		13.4	□□□□□ -0.26
EFTUD2-223	ENST00000592576	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		13.4	□□□□□ -0.26
EFTUD2-223	ENST00000592576	TET3	O43151	1660 aa		13.39	□□□□□ -0.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		13.39	□□□□□ -0.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		13.38	□□□□□ -0.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		13.38	□□□□□ -0.27
EFTUD2-223	ENST00000592576		E9PCH4	1651 aa		13.37	□□□□□ -0.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	NPAT	Q14207	1427 aa		13.37	□□□□□ -0.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	NEUROD1	Q13562	356 aa		13.35	□□□□□ -0.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		13.35	□□□□□ -0.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	PLA2R1	Q13018	1463 aa		13.35	□□□□□ -0.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		13.33	□□□□□ -0.27
EFTUD2-223	ENST00000592576	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZMYM3	Q14202	1370 aa		13.33	□□□□□ -0.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	PTPRT	O14522	1441 aa		13.32	□□□□□ -0.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		13.32	□□□□□ -0.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		13.3	□□□□□ -0.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		13.3	□□□□□ -0.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		13.3	□□□□□ -0.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRPM2	O94759	1503 aa		13.29	□□□□□ -0.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	NOS1	P29475	1434 aa		13.29	□□□□□ -0.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	MADD	Q8WXG6	1647 aa		13.29	□□□□□ -0.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		13.28	□□□□□ -0.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		13.27	□□□□□ -0.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		13.27	□□□□□ -0.28
EFTUD2-223	ENST00000592576	ERVK-7	P63135	1459 aa		13.27	□□□□□ -0.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	MROH2A	A6NES4	1674 aa		13.27	□□□□□ -0.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		13.26	□□□□□ -0.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	SYNM	O15061	1565 aa		13.25	□□□□□ -0.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	TONSL	Q96HA7	1378 aa		13.25	□□□□□ -0.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	CLTCL1	P53675	1640 aa		13.25	□□□□□ -0.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		13.24	□□□□□ -0.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	C3	P01024	1663 aa		13.24	□□□□□ -0.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	IDI1	Q13907	227 aa		13.23	□□□□□ -0.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	RGL3	Q3MIN7	710 aa		13.23	□□□□□ -0.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		13.23	□□□□□ -0.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		13.23	□□□□□ -0.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		13.23	□□□□□ -0.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	TNR	Q92752	1358 aa		13.21	□□□□□ -0.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		13.21	□□□□□ -0.29
EFTUD2-223	ENST00000592576	PIK3C2B	O00750	1634 aa		13.21	□□□□□ -0.3
EFTUD2-223	ENST00000592576	PTPRM	P28827	1452 aa		13.19	□□□□□ -0.3
EFTUD2-223	ENST00000592576	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		13.19	□□□□□ -0.3
EFTUD2-223	ENST00000592576	KIF1B	O60333	1816 aa		13.18	□□□□□ -0.3
EFTUD2-223	ENST00000592576	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
EFTUD2-223	ENST00000592576	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		13.17	□□□□□ -0.3
EFTUD2-223	ENST00000592576	ADGRB3	O60242	1522 aa		13.17	□□□□□ -0.3
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
EFTUD2-223	ENST00000592576	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		13.17	□□□□□ -0.3
EFTUD2-223	ENST00000592576	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		13.17	□□□□□ -0.3
EFTUD2-223	ENST00000592576	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		13.15	□□□□□ -0.3
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		13.15	□□□□□ -0.31
EFTUD2-223	ENST00000592576	NLRP1	Q9C000	1473 aa		13.14	□□□□□ -0.31
EFTUD2-223	ENST00000592576	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		13.13	□□□□□ -0.31
EFTUD2-223	ENST00000592576	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		13.12	□□□□□ -0.31
EFTUD2-223	ENST00000592576	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
EFTUD2-223	ENST00000592576	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		13.12	□□□□□ -0.31
EFTUD2-223	ENST00000592576	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		13.11	□□□□□ -0.31
EFTUD2-223	ENST00000592576	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
EFTUD2-223	ENST00000592576	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		13.11	□□□□□ -0.31
EFTUD2-223	ENST00000592576	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		13.09	□□□□□ -0.31
EFTUD2-223	ENST00000592576	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		13.09	□□□□□ -0.31
EFTUD2-223	ENST00000592576	STAC3	Q96MF2	364 aa		13.09	□□□□□ -0.31
EFTUD2-223	ENST00000592576	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		13.09	□□□□□ -0.31
EFTUD2-223	ENST00000592576	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		13.08	□□□□□ -0.31

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms