RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588358.5

ZNF444-208, Transcript of zinc finger protein 444, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF444, Length 642 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF444-208ENST00000588358 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP35.2■■■■□ 3.23
ZNF444-208ENST00000588358 KIF3BO15066 747 aa35.15■■■■□ 3.22
ZNF444-208ENST00000588358 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa35.15■■■■□ 3.22
ZNF444-208ENST00000588358 TNRQ92752 1358 aa35.13■■■■□ 3.21
ZNF444-208ENST00000588358 NEURL4Q96JN8 1562 aa35.09■■■■□ 3.21
ZNF444-208ENST00000588358 MAP3K1Q13233 1512 aa35.08■■■■□ 3.21
ZNF444-208ENST00000588358 HSPA1LP34931 641 aa35.07■■■■□ 3.2
ZNF444-208ENST00000588358 PZPP20742 1482 aa35.07■■■■□ 3.2
ZNF444-208ENST00000588358 PIP4K2BP78356 416 aa35.06■■■■□ 3.2
ZNF444-208ENST00000588358 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP35.06■■■■□ 3.2
ZNF444-208ENST00000588358 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa35.06■■■■□ 3.2
ZNF444-208ENST00000588358 SHANK2Q9UPX8 1470 aa35.05■■■■□ 3.2
ZNF444-208ENST00000588358 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP35.05■■■■□ 3.2
ZNF444-208ENST00000588358 CCDC141Q6ZP82 1450 aa35.04■■■■□ 3.2
ZNF444-208ENST00000588358 KDM5DQ9BY66 1539 aa35.04■■■■□ 3.2
ZNF444-208ENST00000588358 CPS1P31327 1500 aa35.03■■■■□ 3.2
ZNF444-208ENST00000588358 TOM1O60784 492 aa35.03■■■■□ 3.2
ZNF444-208ENST00000588358 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP35.02■■■■□ 3.22e-7■■■□□ 14.9
ZNF444-208ENST00000588358 RSPH4AQ5TD94 716 aa35.02■■■■□ 3.2
ZNF444-208ENST00000588358 ANKLE2Q86XL3 938 aa35.02■■■■□ 3.2
ZNF444-208ENST00000588358 APLP2Q06481 763 aa35.01■■■■□ 3.2
ZNF444-208ENST00000588358 FAM135AQ9P2D6 1515 aa35■■■■□ 3.19
ZNF444-208ENST00000588358 MIA2Q96PC5 1412 aa34.99■■■■□ 3.19
ZNF444-208ENST00000588358 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa34.99■■■■□ 3.19
ZNF444-208ENST00000588358 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP34.99■■■■□ 3.19
ZNF444-208ENST00000588358 NCOA2Q15596 1464 aa34.97■■■■□ 3.19
ZNF444-208ENST00000588358 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa34.97■■■■□ 3.19
ZNF444-208ENST00000588358 VWDEQ8N2E2 1590 aa34.94■■■■□ 3.18
ZNF444-208ENST00000588358 NLRP1Q9C000 1473 aa34.93■■■■□ 3.18
ZNF444-208ENST00000588358 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP34.91■■■■□ 3.18
ZNF444-208ENST00000588358 UGGT1Q9NYU2 1555 aa34.91■■■■□ 3.18
ZNF444-208ENST00000588358 MED14O60244 1454 aa34.9■■■■□ 3.18
ZNF444-208ENST00000588358 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP34.9■■■■□ 3.18
ZNF444-208ENST00000588358 TSPY4P0CV99 314 aa34.89■■■■□ 3.18
ZNF444-208ENST00000588358 TSPY10P0CW01 314 aa34.89■■■■□ 3.18
ZNF444-208ENST00000588358 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP34.87■■■■□ 3.17
ZNF444-208ENST00000588358 DEPDC5O75140 1603 aa34.86■■■■□ 3.17
ZNF444-208ENST00000588358 ARHGEF5Q12774 1597 aa34.86■■■■□ 3.17
ZNF444-208ENST00000588358 ALKQ9UM73 1620 aa34.85■■■■□ 3.17
ZNF444-208ENST00000588358 IQGAP1P46940 1657 aa34.78■■■■□ 3.16
ZNF444-208ENST00000588358 ABCC3O15438 1527 aa34.77■■■■□ 3.16
ZNF444-208ENST00000588358 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP34.77■■■■□ 3.16
ZNF444-208ENST00000588358 STRCP1A6NGW2 1772 aa34.75■■■■□ 3.15
ZNF444-208ENST00000588358 LRRC7Q96NW7 1537 aa34.73■■■■□ 3.15
ZNF444-208ENST00000588358 ERVK-7P63135 1459 aa34.71■■■■□ 3.15
ZNF444-208ENST00000588358 MAST1Q9Y2H9 1570 aa34.7■■■■□ 3.15
ZNF444-208ENST00000588358 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP34.7■■■■□ 3.14
ZNF444-208ENST00000588358 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP34.68■■■■□ 3.14
ZNF444-208ENST00000588358 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP34.67■■■■□ 3.14
ZNF444-208ENST00000588358 MROH1Q8NDA8 1641 aa34.66■■■■□ 3.14
ZNF444-208ENST00000588358 MYOM3Q5VTT5 1437 aa34.65■■■■□ 3.14
ZNF444-208ENST00000588358 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP34.65■■■■□ 3.14
ZNF444-208ENST00000588358 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP34.64■■■■□ 3.14
ZNF444-208ENST00000588358 UBR1Q8IWV7 1749 aa34.61■■■■□ 3.13
ZNF444-208ENST00000588358 LTKP29376 864 aa34.6■■■■□ 3.13
ZNF444-208ENST00000588358 SYNMO15061 1565 aa34.6■■■■□ 3.13
ZNF444-208ENST00000588358 CEP152O94986 1710 aa34.59■■■■□ 3.13
ZNF444-208ENST00000588358 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP34.57■■■■□ 3.12
ZNF444-208ENST00000588358 TXNDC2Q86VQ3 553 aa34.56■■■■□ 3.12
ZNF444-208ENST00000588358 ARHGAP23Q9P227 1491 aa34.54■■■■□ 3.12
ZNF444-208ENST00000588358 DUOX2Q9NRD8 1548 aa34.53■■■■□ 3.12
ZNF444-208ENST00000588358 SLIT1O75093 1534 aa34.51■■■■□ 3.12
ZNF444-208ENST00000588358 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa34.5■■■■□ 3.11
ZNF444-208ENST00000588358 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP34.47■■■■□ 3.11
ZNF444-208ENST00000588358 EID1Q9Y6B2 187 aa34.45■■■■□ 3.11
ZNF444-208ENST00000588358 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP34.45■■■■□ 3.11
ZNF444-208ENST00000588358 KIF15Q9NS87 1388 aa34.44■■■■□ 3.1
ZNF444-208ENST00000588358 FGD6Q6ZV73 1430 aa34.44■■■■□ 3.1
ZNF444-208ENST00000588358 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa34.43■■■■□ 3.1
ZNF444-208ENST00000588358 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP34.43■■■■□ 3.1
ZNF444-208ENST00000588358 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP34.41■■■■□ 3.1
ZNF444-208ENST00000588358 PTPN23Q9H3S7 1636 aa34.41■■■■□ 3.1
ZNF444-208ENST00000588358 ABCC5O15440 1437 aa34.39■■■■□ 3.1
ZNF444-208ENST00000588358 TMEM2Q9UHN6 1383 aa34.39■■■■□ 3.1
ZNF444-208ENST00000588358 ERBINQ96RT1 1412 aa34.38■■■■□ 3.09
ZNF444-208ENST00000588358 PIK3C2BO00750 1634 aa34.38■■■■□ 3.09
ZNF444-208ENST00000588358 FAM135BQ49AJ0 1406 aa34.35■■■■□ 3.09
ZNF444-208ENST00000588358 STAG3Q9UJ98 1225 aa34.34■■■■□ 3.09
ZNF444-208ENST00000588358 IDI1Q13907 227 aa34.33■■■■□ 3.09
ZNF444-208ENST00000588358 TMEM94Q12767 1356 aa34.31■■■■□ 3.08
ZNF444-208ENST00000588358 CROCC2H7BZ55 1655 aa34.31■■■■□ 3.08
ZNF444-208ENST00000588358 KCNA6P17658 529 aa34.29■■■■□ 3.08
ZNF444-208ENST00000588358 KANK1Q14678 1352 aa34.28■■■■□ 3.08
ZNF444-208ENST00000588358 SLC26A8Q96RN1 970 aa34.27■■■■□ 3.08
ZNF444-208ENST00000588358 EFCAB6Q5THR3 1501 aa34.26■■■■□ 3.08
ZNF444-208ENST00000588358 DAPK1P53355 1430 aa34.26■■■■□ 3.07
ZNF444-208ENST00000588358 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP34.25■■■■□ 3.07
ZNF444-208ENST00000588358 TET3O43151 1660 aa34.25■■■■□ 3.07
ZNF444-208ENST00000588358 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP34.24■■■■□ 3.07
ZNF444-208ENST00000588358 LMTK2Q8IWU2 1503 aa34.24■■■■□ 3.07
ZNF444-208ENST00000588358 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP34.23■■■■□ 3.07
ZNF444-208ENST00000588358 POTEAQ6S8J7 498 aa34.22■■■■□ 3.07
ZNF444-208ENST00000588358 CHIC2Q9UKJ5 165 aa34.22■■■■□ 3.07
ZNF444-208ENST00000588358 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP34.21■■■■□ 3.07
ZNF444-208ENST00000588358 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP34.21■■■■□ 3.07
ZNF444-208ENST00000588358 NOS1P29475 1434 aa34.17■■■■□ 3.06
ZNF444-208ENST00000588358 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa34.17■■■■□ 3.06
ZNF444-208ENST00000588358 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa34.16■■■■□ 3.06
ZNF444-208ENST00000588358 SLC52A1Q9NWF4 448 aa34.11■■■■□ 3.05
ZNF444-208ENST00000588358 ADGRB3O60242 1522 aa34.1■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.2 ms