RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587775.1

TMUB2-208, Transcript of transmembrane and ubiquitin like domain containing 2, human

TSL 3

Gene TMUB2, Length 546 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMUB2-208	ENST00000587775	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TMUB2-208	ENST00000587775	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TMUB2-208	ENST00000587775	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
TMUB2-208	ENST00000587775	DEPDC5	O75140	1603 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TMUB2-208	ENST00000587775	ITGAE	P38570	1179 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TMUB2-208	ENST00000587775	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		13.83	□□□□□ -0.19
TMUB2-208	ENST00000587775	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TMUB2-208	ENST00000587775	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
TMUB2-208	ENST00000587775	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TMUB2-208	ENST00000587775	UNC13B	O14795	1591 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TMUB2-208	ENST00000587775	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TMUB2-208	ENST00000587775	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
TMUB2-208	ENST00000587775	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TMUB2-208	ENST00000587775	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TMUB2-208	ENST00000587775	KIF3B	O15066	747 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TMUB2-208	ENST00000587775	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TMUB2-208	ENST00000587775	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMUB2-208	ENST00000587775	PZP	P20742	1482 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMUB2-208	ENST00000587775	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TMUB2-208	ENST00000587775	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMUB2-208	ENST00000587775	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMUB2-208	ENST00000587775	ABCC3	O15438	1527 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TMUB2-208	ENST00000587775	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		13.71	□□□□□ -0.22
TMUB2-208	ENST00000587775	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TMUB2-208	ENST00000587775	GGT6	Q6P531	493 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TMUB2-208	ENST00000587775	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
TMUB2-208	ENST00000587775	NUP155	O75694	1391 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TMUB2-208	ENST00000587775	MROH2A	A6NES4	1674 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TMUB2-208	ENST00000587775	TET3	O43151	1660 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TMUB2-208	ENST00000587775	PLA2R1	Q13018	1463 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TMUB2-208	ENST00000587775	PTPRT	O14522	1441 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TMUB2-208	ENST00000587775	NPAT	Q14207	1427 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TMUB2-208	ENST00000587775	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TMUB2-208	ENST00000587775	MADD	Q8WXG6	1647 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TMUB2-208	ENST00000587775	CEP152	O94986	1710 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TMUB2-208	ENST00000587775	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TMUB2-208	ENST00000587775	ZMYM3	Q14202	1370 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TMUB2-208	ENST00000587775	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TMUB2-208	ENST00000587775		E9PCH4	1651 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TMUB2-208	ENST00000587775	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
TMUB2-208	ENST00000587775	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TMUB2-208	ENST00000587775	NOS1	P29475	1434 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TMUB2-208	ENST00000587775	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TMUB2-208	ENST00000587775	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
TMUB2-208	ENST00000587775	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
TMUB2-208	ENST00000587775	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
TMUB2-208	ENST00000587775	MLEC	Q14165	292 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMUB2-208	ENST00000587775	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMUB2-208	ENST00000587775	KANK1	Q14678	1352 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TMUB2-208	ENST00000587775	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	13.61	□□□□□ -0.23	4e-8	■■□□□ 12.4
TMUB2-208	ENST00000587775	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMUB2-208	ENST00000587775	C3	P01024	1663 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMUB2-208	ENST00000587775	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMUB2-208	ENST00000587775	PTPRM	P28827	1452 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMUB2-208	ENST00000587775	PKD2	Q13563	968 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMUB2-208	ENST00000587775	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TMUB2-208	ENST00000587775	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TMUB2-208	ENST00000587775	TRIM52	Q96A61	297 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TMUB2-208	ENST00000587775	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TMUB2-208	ENST00000587775	ERVK-7	P63135	1459 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TMUB2-208	ENST00000587775	SYNM	O15061	1565 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TMUB2-208	ENST00000587775	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TMUB2-208	ENST00000587775	PIK3C2B	O00750	1634 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TMUB2-208	ENST00000587775	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TMUB2-208	ENST00000587775	TRPM2	O94759	1503 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMUB2-208	ENST00000587775	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TMUB2-208	ENST00000587775	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TMUB2-208	ENST00000587775	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TMUB2-208	ENST00000587775	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TMUB2-208	ENST00000587775	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TMUB2-208	ENST00000587775	IDI1	Q13907	227 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TMUB2-208	ENST00000587775	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TMUB2-208	ENST00000587775	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TMUB2-208	ENST00000587775	CLTCL1	P53675	1640 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TMUB2-208	ENST00000587775	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TMUB2-208	ENST00000587775	TNR	Q92752	1358 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TMUB2-208	ENST00000587775	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TMUB2-208	ENST00000587775	NLRP1	Q9C000	1473 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TMUB2-208	ENST00000587775	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TMUB2-208	ENST00000587775	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		13.46	□□□□□ -0.26
TMUB2-208	ENST00000587775	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
TMUB2-208	ENST00000587775	ADGRB3	O60242	1522 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TMUB2-208	ENST00000587775	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TMUB2-208	ENST00000587775	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TMUB2-208	ENST00000587775	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TMUB2-208	ENST00000587775	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TMUB2-208	ENST00000587775	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TMUB2-208	ENST00000587775	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TMUB2-208	ENST00000587775	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TMUB2-208	ENST00000587775	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TMUB2-208	ENST00000587775	ZFYVE9	O95405	1425 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TMUB2-208	ENST00000587775	SLIT1	O75093	1534 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TMUB2-208	ENST00000587775	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TMUB2-208	ENST00000587775	KIF1B	O60333	1816 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TMUB2-208	ENST00000587775	IFT172	Q9UG01	1749 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TMUB2-208	ENST00000587775	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TMUB2-208	ENST00000587775	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TMUB2-208	ENST00000587775	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TMUB2-208	ENST00000587775	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TMUB2-208	ENST00000587775	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		13.36	□□□□□ -0.27

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms