RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586268.5

NEDD4L-215, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, humanhuman

TSL 3

Gene NEDD4L, Length 830 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4L-215ENST00000586268 AFAP1Q8N556 730 aa20.58■□□□□ 0.89
NEDD4L-215ENST00000586268 TSPOAP1O95153 1857 aa20.56■□□□□ 0.88
NEDD4L-215ENST00000586268 ERBINQ96RT1 1412 aa20.55■□□□□ 0.88
NEDD4L-215ENST00000586268 RICTORQ6R327 1708 aa20.55■□□□□ 0.88
NEDD4L-215ENST00000586268 MLH3Q9UHC1 1453 aa20.54■□□□□ 0.88
NEDD4L-215ENST00000586268 HECW2Q9P2P5 1572 aa20.54■□□□□ 0.88
NEDD4L-215ENST00000586268 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa20.54■□□□□ 0.88
NEDD4L-215ENST00000586268 KDM5DQ9BY66 1539 aa20.53■□□□□ 0.88
NEDD4L-215ENST00000586268 KCNA4P22459 653 aa20.51■□□□□ 0.87
NEDD4L-215ENST00000586268 UNC13BO14795 1591 aa20.51■□□□□ 0.87
NEDD4L-215ENST00000586268 TRIM52Q96A61 297 aa20.5■□□□□ 0.87
NEDD4L-215ENST00000586268 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa20.5■□□□□ 0.87
NEDD4L-215ENST00000586268 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa20.48■□□□□ 0.87
NEDD4L-215ENST00000586268 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
NEDD4L-215ENST00000586268 PZPP20742 1482 aa20.47■□□□□ 0.87
NEDD4L-215ENST00000586268 MAGI2Q86UL8 1455 aa20.46■□□□□ 0.87
NEDD4L-215ENST00000586268 MPHOSPH9Q99550 1183 aa20.44■□□□□ 0.86
NEDD4L-215ENST00000586268 ABCA6Q8N139 1617 aa20.44■□□□□ 0.86
NEDD4L-215ENST00000586268 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
NEDD4L-215ENST00000586268 RAPGEF3O95398 923 aa20.43■□□□□ 0.86
NEDD4L-215ENST00000586268 MYT1LQ9UL68 1186 aa20.42■□□□□ 0.86
NEDD4L-215ENST00000586268 A2MP01023 1474 aa20.42■□□□□ 0.86
NEDD4L-215ENST00000586268 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa20.42■□□□□ 0.86
NEDD4L-215ENST00000586268 DEPDC5O75140 1603 aa20.42■□□□□ 0.86
NEDD4L-215ENST00000586268 NUP155O75694 1391 aa20.41■□□□□ 0.86
NEDD4L-215ENST00000586268 IQGAP3Q86VI3 1631 aa20.41■□□□□ 0.86
NEDD4L-215ENST00000586268 BCORL1Q5H9F3 1711 aa20.39■□□□□ 0.86
NEDD4L-215ENST00000586268 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
NEDD4L-215ENST00000586268 FAM135AQ9P2D6 1515 aa20.38■□□□□ 0.85
NEDD4L-215ENST00000586268 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
NEDD4L-215ENST00000586268 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
NEDD4L-215ENST00000586268 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
NEDD4L-215ENST00000586268 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
NEDD4L-215ENST00000586268 YEATS2Q9ULM3 1422 aa20.34■□□□□ 0.85
NEDD4L-215ENST00000586268 VWDEQ8N2E2 1590 aa20.34■□□□□ 0.85
NEDD4L-215ENST00000586268 MROH1Q8NDA8 1641 aa20.33■□□□□ 0.84
NEDD4L-215ENST00000586268 REREQ9P2R6 1566 aa20.33■□□□□ 0.84
NEDD4L-215ENST00000586268 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa20.32■□□□□ 0.84
NEDD4L-215ENST00000586268 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
NEDD4L-215ENST00000586268 PKD2Q13563 968 aa20.3■□□□□ 0.84
NEDD4L-215ENST00000586268 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa20.3■□□□□ 0.84
NEDD4L-215ENST00000586268 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa20.3■□□□□ 0.84
NEDD4L-215ENST00000586268 ATP10AO60312 1499 aa20.3■□□□□ 0.84
NEDD4L-215ENST00000586268 KIF3BO15066 747 aa20.29■□□□□ 0.84
NEDD4L-215ENST00000586268 KANK1Q14678 1352 aa20.29■□□□□ 0.84
NEDD4L-215ENST00000586268 SIN3AQ96ST3 1273 aa20.28■□□□□ 0.84
NEDD4L-215ENST00000586268 TET3O43151 1660 aa20.27■□□□□ 0.84
NEDD4L-215ENST00000586268 AGLP35573 1532 aa20.26■□□□□ 0.83
NEDD4L-215ENST00000586268 LMTK2Q8IWU2 1503 aa20.26■□□□□ 0.83
NEDD4L-215ENST00000586268 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
NEDD4L-215ENST00000586268 NEUROD1Q13562 356 aa20.23■□□□□ 0.83
NEDD4L-215ENST00000586268 E9PCH4 1651 aa20.21■□□□□ 0.83
NEDD4L-215ENST00000586268 TONSLQ96HA7 1378 aa20.21■□□□□ 0.83
NEDD4L-215ENST00000586268 EFCAB6Q5THR3 1501 aa20.19■□□□□ 0.82
NEDD4L-215ENST00000586268 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
NEDD4L-215ENST00000586268 CEP152O94986 1710 aa20.19■□□□□ 0.82
NEDD4L-215ENST00000586268 ABCC3O15438 1527 aa20.17■□□□□ 0.82
NEDD4L-215ENST00000586268 PLA2R1Q13018 1463 aa20.16■□□□□ 0.82
NEDD4L-215ENST00000586268 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa20.14■□□□□ 0.81
NEDD4L-215ENST00000586268 PTPRTO14522 1441 aa20.14■□□□□ 0.81
NEDD4L-215ENST00000586268 GGT6Q6P531 493 aa20.14■□□□□ 0.81
NEDD4L-215ENST00000586268 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa20.13■□□□□ 0.81
NEDD4L-215ENST00000586268 TRPM2O94759 1503 aa20.13■□□□□ 0.81
NEDD4L-215ENST00000586268 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa20.13■□□□□ 0.81
NEDD4L-215ENST00000586268 CCDC144AA2RUR9 1427 aa20.11■□□□□ 0.81
NEDD4L-215ENST00000586268 CAPN15O75808 1086 aa20.1■□□□□ 0.81
NEDD4L-215ENST00000586268 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
NEDD4L-215ENST00000586268 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa20.09■□□□□ 0.81
NEDD4L-215ENST00000586268 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa20.08■□□□□ 0.81
NEDD4L-215ENST00000586268 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
NEDD4L-215ENST00000586268 SLC4A2P04920 1241 aa20.07■□□□□ 0.8
NEDD4L-215ENST00000586268 NPATQ14207 1427 aa20.07■□□□□ 0.8
NEDD4L-215ENST00000586268 L3MBTL2Q969R5 705 aa20.05■□□□□ 0.8
NEDD4L-215ENST00000586268 CLTCL1P53675 1640 aa20.04■□□□□ 0.8
NEDD4L-215ENST00000586268 CNTLNQ9NXG0 1405 aa20.02■□□□□ 0.8
NEDD4L-215ENST00000586268 NEURL4Q96JN8 1562 aa20.02■□□□□ 0.8
NEDD4L-215ENST00000586268 NOS1P29475 1434 aa20.01■□□□□ 0.79
NEDD4L-215ENST00000586268 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
NEDD4L-215ENST00000586268 DSG3P32926 999 aa19.98■□□□□ 0.79
NEDD4L-215ENST00000586268 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa19.98■□□□□ 0.79
NEDD4L-215ENST00000586268 PREX1Q8TCU6 1659 aa19.97■□□□□ 0.79
NEDD4L-215ENST00000586268 SYNMO15061 1565 aa19.95■□□□□ 0.78
NEDD4L-215ENST00000586268 PIK3C2BO00750 1634 aa19.95■□□□□ 0.78
NEDD4L-215ENST00000586268 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa19.95■□□□□ 0.78
NEDD4L-215ENST00000586268 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
NEDD4L-215ENST00000586268 KIF1BO60333 1816 aa19.95■□□□□ 0.78
NEDD4L-215ENST00000586268 UGGT1Q9NYU2 1555 aa19.94■□□□□ 0.78
NEDD4L-215ENST00000586268 MROH2AA6NES4 1674 aa19.94■□□□□ 0.78
NEDD4L-215ENST00000586268 ERVK-7P63135 1459 aa19.93■□□□□ 0.78
NEDD4L-215ENST00000586268 MLECQ14165 292 aa19.93■□□□□ 0.78
NEDD4L-215ENST00000586268 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
NEDD4L-215ENST00000586268 ADGRB3O60242 1522 aa19.92■□□□□ 0.78
NEDD4L-215ENST00000586268 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa19.91■□□□□ 0.78
NEDD4L-215ENST00000586268 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
NEDD4L-215ENST00000586268 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
NEDD4L-215ENST00000586268 NBPF8Q3BBV2 869 aa19.88■□□□□ 0.77
NEDD4L-215ENST00000586268 STAC3Q96MF2 364 aa19.88■□□□□ 0.77
NEDD4L-215ENST00000586268 DCAF11Q8TEB1 546 aa19.87■□□□□ 0.77
NEDD4L-215ENST00000586268 RALGAPBQ86X10 1494 aa19.86■□□□□ 0.77
NEDD4L-215ENST00000586268 ZMYM3Q14202 1370 aa19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms