RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576955.5

PHF23-212, Transcript of PHD finger protein 23, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PHF23, Length 1,944 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF23-212ENST00000576955 IQGAP3Q86VI3 1631 aa34.86■■■■□ 3.17
PHF23-212ENST00000576955 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP34.85■■■■□ 3.17
PHF23-212ENST00000576955 RAPGEF3O95398 923 aa34.83■■■■□ 3.17
PHF23-212ENST00000576955 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP34.82■■■■□ 3.163e-12■■■□□ 15
PHF23-212ENST00000576955 DEPDC5O75140 1603 aa34.79■■■■□ 3.16
PHF23-212ENST00000576955 A2MP01023 1474 aa34.78■■■■□ 3.16
PHF23-212ENST00000576955 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP34.77■■■■□ 3.16
PHF23-212ENST00000576955 ABCA6Q8N139 1617 aa34.75■■■■□ 3.15
PHF23-212ENST00000576955 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa34.74■■■■□ 3.15
PHF23-212ENST00000576955 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP34.72■■■■□ 3.15
PHF23-212ENST00000576955 KIF3BO15066 747 aa34.71■■■■□ 3.15
PHF23-212ENST00000576955 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa34.7■■■■□ 3.15
PHF23-212ENST00000576955 KANK1Q14678 1352 aa34.69■■■■□ 3.14
PHF23-212ENST00000576955 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa34.67■■■■□ 3.14
PHF23-212ENST00000576955 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP34.67■■■■□ 3.14
PHF23-212ENST00000576955 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP34.65■■■■□ 3.14
PHF23-212ENST00000576955 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.65■■■■□ 3.14
PHF23-212ENST00000576955 VWDEQ8N2E2 1590 aa34.64■■■■□ 3.14
PHF23-212ENST00000576955 BCORL1Q5H9F3 1711 aa34.64■■■■□ 3.14
PHF23-212ENST00000576955 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP34.63■■■■□ 3.13
PHF23-212ENST00000576955 MROH1Q8NDA8 1641 aa34.62■■■■□ 3.13
PHF23-212ENST00000576955 TET3O43151 1660 aa34.59■■■■□ 3.13
PHF23-212ENST00000576955 YEATS2Q9ULM3 1422 aa34.58■■■■□ 3.13
PHF23-212ENST00000576955 L3MBTL2Q969R5 705 aa34.56■■■■□ 3.12
PHF23-212ENST00000576955 E9PCH4 1651 aa34.54■■■■□ 3.12
PHF23-212ENST00000576955 ATP10AO60312 1499 aa34.54■■■■□ 3.12
PHF23-212ENST00000576955 CCDC144AA2RUR9 1427 aa34.51■■■■□ 3.12
PHF23-212ENST00000576955 PLA2R1Q13018 1463 aa34.5■■■■□ 3.11
PHF23-212ENST00000576955 LMTK2Q8IWU2 1503 aa34.49■■■■□ 3.11
PHF23-212ENST00000576955 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP34.48■■■■□ 3.11
PHF23-212ENST00000576955 GGT6Q6P531 493 aa34.45■■■■□ 3.11
PHF23-212ENST00000576955 REREQ9P2R6 1566 aa34.44■■■■□ 3.1
PHF23-212ENST00000576955 CEP152O94986 1710 aa34.44■■■■□ 3.1
PHF23-212ENST00000576955 EFCAB6Q5THR3 1501 aa34.43■■■■□ 3.1
PHF23-212ENST00000576955 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa34.42■■■■□ 3.1
PHF23-212ENST00000576955 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.4■■■■□ 3.1
PHF23-212ENST00000576955 PTPRTO14522 1441 aa34.4■■■■□ 3.1
PHF23-212ENST00000576955 TRPM2O94759 1503 aa34.39■■■■□ 3.1
PHF23-212ENST00000576955 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa34.37■■■■□ 3.09
PHF23-212ENST00000576955 ABCC3O15438 1527 aa34.36■■■■□ 3.09
PHF23-212ENST00000576955 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa34.35■■■■□ 3.09
PHF23-212ENST00000576955 AGLP35573 1532 aa34.34■■■■□ 3.09
PHF23-212ENST00000576955 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP34.33■■■■□ 3.09
PHF23-212ENST00000576955 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa34.28■■■■□ 3.08
PHF23-212ENST00000576955 NBPF8Q3BBV2 869 aa34.27■■■■□ 3.08
PHF23-212ENST00000576955 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP34.26■■■■□ 3.07
PHF23-212ENST00000576955 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa34.25■■■■□ 3.07
PHF23-212ENST00000576955 CLTCL1P53675 1640 aa34.25■■■■□ 3.07
PHF23-212ENST00000576955 NPATQ14207 1427 aa34.24■■■■□ 3.07
PHF23-212ENST00000576955 DCAF11Q8TEB1 546 aa34.22■■■■□ 3.07
PHF23-212ENST00000576955 PPP6R1Q9UPN7 881 aa34.2■■■■□ 3.07
PHF23-212ENST00000576955 RGL3Q3MIN7 710 aa34.2■■■■□ 3.06
PHF23-212ENST00000576955 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa34.19■■■■□ 3.06
PHF23-212ENST00000576955 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa34.19■■■■□ 3.06
PHF23-212ENST00000576955 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa34.18■■■■□ 3.06
PHF23-212ENST00000576955 CNTLNQ9NXG0 1405 aa34.16■■■■□ 3.06
PHF23-212ENST00000576955 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP34.16■■■■□ 3.06
PHF23-212ENST00000576955 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa34.16■■■■□ 3.06
PHF23-212ENST00000576955 NEURL4Q96JN8 1562 aa34.16■■■■□ 3.06
PHF23-212ENST00000576955 KIF1BO60333 1816 aa34.12■■■■□ 3.05
PHF23-212ENST00000576955 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP34.11■■■■□ 3.05
PHF23-212ENST00000576955 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP34.1■■■■□ 3.059e-6■□□□□ 10.1
PHF23-212ENST00000576955 UGGT1Q9NYU2 1555 aa34.1■■■■□ 3.05
PHF23-212ENST00000576955 RALGAPBQ86X10 1494 aa34.1■■■■□ 3.05
PHF23-212ENST00000576955 NOS1P29475 1434 aa34.09■■■■□ 3.05
PHF23-212ENST00000576955 PRAG1Q86YV5 1406 aa34.08■■■■□ 3.05
PHF23-212ENST00000576955 STAC3Q96MF2 364 aa34.06■■■■□ 3.04
PHF23-212ENST00000576955 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP34.06■■■■□ 3.04
PHF23-212ENST00000576955 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP34.04■■■■□ 3.04
PHF23-212ENST00000576955 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP34.04■■■■□ 3.04
PHF23-212ENST00000576955 MLECQ14165 292 aa34.02■■■■□ 3.04
PHF23-212ENST00000576955 PREX1Q8TCU6 1659 aa34.01■■■■□ 3.03
PHF23-212ENST00000576955 SYNMO15061 1565 aa34■■■■□ 3.03
PHF23-212ENST00000576955 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa34■■■■□ 3.03
PHF23-212ENST00000576955 PIK3C2BO00750 1634 aa33.99■■■■□ 3.03
PHF23-212ENST00000576955 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP33.99■■■■□ 3.03
PHF23-212ENST00000576955 ADGRB3O60242 1522 aa33.98■■■■□ 3.03
PHF23-212ENST00000576955 MROH2AA6NES4 1674 aa33.97■■■■□ 3.03
PHF23-212ENST00000576955 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP33.95■■■■□ 3.03
PHF23-212ENST00000576955 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP33.93■■■■□ 3.02
PHF23-212ENST00000576955 CARD11Q9BXL7 1154 aa33.93■■■■□ 3.02
PHF23-212ENST00000576955 SLC52A1Q9NWF4 448 aa33.93■■■■□ 3.02
PHF23-212ENST00000576955 MADDQ8WXG6 1647 aa33.92■■■■□ 3.02
PHF23-212ENST00000576955 USP47Q96K76 1375 aa33.91■■■■□ 3.02
PHF23-212ENST00000576955 ERVK-7P63135 1459 aa33.91■■■■□ 3.02
PHF23-212ENST00000576955 IFT172Q9UG01 1749 aa33.91■■■■□ 3.02
PHF23-212ENST00000576955 CHGAP10645 457 aaKnown RBP33.9■■■■□ 3.02
PHF23-212ENST00000576955 MYOM2P54296 1465 aa33.89■■■■□ 3.02
PHF23-212ENST00000576955 LAMC1P11047 1609 aa33.87■■■■□ 3.01
PHF23-212ENST00000576955 GPRASP1Q5JY77 1395 aa33.87■■■■□ 3.01
PHF23-212ENST00000576955 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP33.85■■■■□ 3.01
PHF23-212ENST00000576955 IDI1Q13907 227 aa33.84■■■■□ 3.01
PHF23-212ENST00000576955 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa33.84■■■■□ 3.01
PHF23-212ENST00000576955 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa33.84■■■■□ 3.01
PHF23-212ENST00000576955 ZMYM3Q14202 1370 aa33.82■■■■□ 3
PHF23-212ENST00000576955 PPLO60437 1756 aa33.81■■■■□ 3
PHF23-212ENST00000576955 NBPF1Q3BBV0 1214 aa33.8■■■■□ 3
PHF23-212ENST00000576955 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa33.79■■■■□ 3
PHF23-212ENST00000576955 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP33.78■■■■□ 3
PHF23-212ENST00000576955 NRXN1Q9ULB1 1477 aa33.76■■■■□ 3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 100.2 ms