RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576390.5

P4HB-223, Transcript of prolyl 4-hydroxylase subunit beta, human

TSL 4 BASIC

Gene P4HB, Length 439 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
P4HB-223	ENST00000576390	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	30.07	■■■□□ 2.4
P4HB-223	ENST00000576390	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	30.05	■■■□□ 2.4
P4HB-223	ENST00000576390	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	30.05	■■■□□ 2.4
P4HB-223	ENST00000576390	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		30.05	■■■□□ 2.4
P4HB-223	ENST00000576390	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		30.05	■■■□□ 2.4
P4HB-223	ENST00000576390	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		30.04	■■■□□ 2.4
P4HB-223	ENST00000576390	PZP	P20742	1482 aa		30.03	■■■□□ 2.4
P4HB-223	ENST00000576390	TSPY4	P0CV99	314 aa		30.02	■■■□□ 2.4
P4HB-223	ENST00000576390	TSPY10	P0CW01	314 aa		30.02	■■■□□ 2.4
P4HB-223	ENST00000576390	PKD2	Q13563	968 aa		30.02	■■■□□ 2.4
P4HB-223	ENST00000576390	MIA2	Q96PC5	1412 aa		30.02	■■■□□ 2.4
P4HB-223	ENST00000576390	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	30.01	■■■□□ 2.39
P4HB-223	ENST00000576390	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		30	■■■□□ 2.39
P4HB-223	ENST00000576390	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	29.97	■■■□□ 2.39
P4HB-223	ENST00000576390	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	29.96	■■■□□ 2.39
P4HB-223	ENST00000576390	TNR	Q92752	1358 aa		29.96	■■■□□ 2.39
P4HB-223	ENST00000576390	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	29.96	■■■□□ 2.39
P4HB-223	ENST00000576390	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		29.96	■■■□□ 2.39
P4HB-223	ENST00000576390	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	29.95	■■■□□ 2.38
P4HB-223	ENST00000576390	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	29.92	■■■□□ 2.38
P4HB-223	ENST00000576390	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		29.9	■■■□□ 2.38
P4HB-223	ENST00000576390	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		29.9	■■■□□ 2.38
P4HB-223	ENST00000576390	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		29.89	■■■□□ 2.38
P4HB-223	ENST00000576390	ABCC3	O15438	1527 aa		29.89	■■■□□ 2.38
P4HB-223	ENST00000576390	NLRP1	Q9C000	1473 aa		29.87	■■■□□ 2.37
P4HB-223	ENST00000576390	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		29.85	■■■□□ 2.37
P4HB-223	ENST00000576390	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		29.85	■■■□□ 2.37
P4HB-223	ENST00000576390	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		29.85	■■■□□ 2.37
P4HB-223	ENST00000576390	CEP152	O94986	1710 aa		29.85	■■■□□ 2.37
P4HB-223	ENST00000576390	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		29.82	■■■□□ 2.36
P4HB-223	ENST00000576390	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		29.81	■■■□□ 2.36
P4HB-223	ENST00000576390	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	29.81	■■■□□ 2.36
P4HB-223	ENST00000576390	ABCC5	O15440	1437 aa		29.79	■■■□□ 2.36
P4HB-223	ENST00000576390	DEPDC5	O75140	1603 aa		29.79	■■■□□ 2.36
P4HB-223	ENST00000576390	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	29.77	■■■□□ 2.36
P4HB-223	ENST00000576390	ERVK-7	P63135	1459 aa		29.77	■■■□□ 2.36
P4HB-223	ENST00000576390	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	29.76	■■■□□ 2.35
P4HB-223	ENST00000576390	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	29.75	■■■□□ 2.35
P4HB-223	ENST00000576390	MED14	O60244	1454 aa		29.74	■■■□□ 2.35
P4HB-223	ENST00000576390	APLP2	Q06481	763 aa		29.74	■■■□□ 2.35
P4HB-223	ENST00000576390	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		29.73	■■■□□ 2.35
P4HB-223	ENST00000576390	KIF15	Q9NS87	1388 aa		29.73	■■■□□ 2.35
P4HB-223	ENST00000576390	DAPK1	P53355	1430 aa		29.72	■■■□□ 2.35
P4HB-223	ENST00000576390	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		29.72	■■■□□ 2.35
P4HB-223	ENST00000576390	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		29.72	■■■□□ 2.35
P4HB-223	ENST00000576390	CPS1	P31327	1500 aa		29.71	■■■□□ 2.35
P4HB-223	ENST00000576390	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		29.7	■■■□□ 2.35
P4HB-223	ENST00000576390	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		29.7	■■■□□ 2.34
P4HB-223	ENST00000576390	IQGAP1	P46940	1657 aa		29.69	■■■□□ 2.34
P4HB-223	ENST00000576390	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	29.68	■■■□□ 2.34
P4HB-223	ENST00000576390	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		29.68	■■■□□ 2.34
P4HB-223	ENST00000576390	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		29.66	■■■□□ 2.34
P4HB-223	ENST00000576390	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		29.65	■■■□□ 2.34
P4HB-223	ENST00000576390	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		29.64	■■■□□ 2.33
P4HB-223	ENST00000576390	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		29.61	■■■□□ 2.33
P4HB-223	ENST00000576390	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		29.57	■■■□□ 2.32
P4HB-223	ENST00000576390	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		29.57	■■■□□ 2.32
P4HB-223	ENST00000576390	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		29.56	■■■□□ 2.32
P4HB-223	ENST00000576390	SLIT1	O75093	1534 aa		29.55	■■■□□ 2.32
P4HB-223	ENST00000576390	ADGRL2	O95490	1459 aa		29.55	■■■□□ 2.32
P4HB-223	ENST00000576390	PIK3C2B	O00750	1634 aa		29.54	■■■□□ 2.32
P4HB-223	ENST00000576390	ILDR2	Q71H61	639 aa		29.52	■■■□□ 2.32
P4HB-223	ENST00000576390	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		29.52	■■■□□ 2.32
P4HB-223	ENST00000576390	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	29.52	■■■□□ 2.32
P4HB-223	ENST00000576390	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	29.52	■■■□□ 2.32
P4HB-223	ENST00000576390	KANK1	Q14678	1352 aa		29.52	■■■□□ 2.32
P4HB-223	ENST00000576390	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	29.51	■■■□□ 2.31	8e-33	■□□□□ 11
P4HB-223	ENST00000576390	ALK	Q9UM73	1620 aa		29.51	■■■□□ 2.31
P4HB-223	ENST00000576390	SYNM	O15061	1565 aa		29.49	■■■□□ 2.31
P4HB-223	ENST00000576390	TOM1	O60784	492 aa		29.48	■■■□□ 2.31
P4HB-223	ENST00000576390	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		29.45	■■■□□ 2.31
P4HB-223	ENST00000576390	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		29.45	■■■□□ 2.31
P4HB-223	ENST00000576390	LTK	P29376	864 aa		29.45	■■■□□ 2.31
P4HB-223	ENST00000576390	NOS1	P29475	1434 aa		29.42	■■■□□ 2.3
P4HB-223	ENST00000576390	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		29.41	■■■□□ 2.3
P4HB-223	ENST00000576390	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		29.4	■■■□□ 2.3
P4HB-223	ENST00000576390	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	29.4	■■■□□ 2.3
P4HB-223	ENST00000576390	PIP4K2B	P78356	416 aa		29.39	■■■□□ 2.3
P4HB-223	ENST00000576390	HSPA1L	P34931	641 aa		29.38	■■■□□ 2.29
P4HB-223	ENST00000576390	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	29.38	■■■□□ 2.29
P4HB-223	ENST00000576390	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		29.37	■■■□□ 2.29
P4HB-223	ENST00000576390	IDI1	Q13907	227 aa		29.37	■■■□□ 2.29
P4HB-223	ENST00000576390	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	29.37	■■■□□ 2.29
P4HB-223	ENST00000576390	EID1	Q9Y6B2	187 aa		29.35	■■■□□ 2.29
P4HB-223	ENST00000576390	TET3	O43151	1660 aa		29.34	■■■□□ 2.29
P4HB-223	ENST00000576390	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	29.34	■■■□□ 2.29
P4HB-223	ENST00000576390	ADGRB3	O60242	1522 aa		29.34	■■■□□ 2.29
P4HB-223	ENST00000576390	SOCS7	O14512	581 aa		29.33	■■■□□ 2.29
P4HB-223	ENST00000576390	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		29.32	■■■□□ 2.28
P4HB-223	ENST00000576390	UNC13B	O14795	1591 aa		29.31	■■■□□ 2.28
P4HB-223	ENST00000576390	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		29.31	■■■□□ 2.28
P4HB-223	ENST00000576390	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		29.31	■■■□□ 2.28
P4HB-223	ENST00000576390	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	29.29	■■■□□ 2.28
P4HB-223	ENST00000576390	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		29.27	■■■□□ 2.28
P4HB-223	ENST00000576390	ROCK1	Q13464	1354 aa		29.24	■■■□□ 2.27
P4HB-223	ENST00000576390		E9PCH4	1651 aa		29.22	■■■□□ 2.27
P4HB-223	ENST00000576390	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		29.2	■■■□□ 2.27
P4HB-223	ENST00000576390	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		29.2	■■■□□ 2.26
P4HB-223	ENST00000576390	NWD1	Q149M9	1564 aa		29.19	■■■□□ 2.26
P4HB-223	ENST00000576390	ZFYVE9	O95405	1425 aa		29.18	■■■□□ 2.26

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.2 ms