RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569573.1

E2F4-213, Transcript of E2F transcription factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene E2F4, Length 849 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4-213ENST00000569573 A2ML1A8K2U0 1454 aa40.64■■■■■ 4.1
E2F4-213ENST00000569573 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa40.62■■■■■ 4.09
E2F4-213ENST00000569573 KDM5DQ9BY66 1539 aa40.62■■■■■ 4.09
E2F4-213ENST00000569573 VPS8Q8N3P4 1428 aa40.59■■■■■ 4.09
E2F4-213ENST00000569573 FAM135AQ9P2D6 1515 aa40.59■■■■■ 4.09
E2F4-213ENST00000569573 TNRQ92752 1358 aa40.59■■■■■ 4.09
E2F4-213ENST00000569573 ARHGEF5Q12774 1597 aa40.58■■■■■ 4.09
E2F4-213ENST00000569573 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP40.57■■■■■ 4.09
E2F4-213ENST00000569573 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP40.56■■■■■ 4.08
E2F4-213ENST00000569573 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa40.56■■■■■ 4.08
E2F4-213ENST00000569573 PZPP20742 1482 aa40.55■■■■■ 4.08
E2F4-213ENST00000569573 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.53■■■■■ 4.08
E2F4-213ENST00000569573 UBAP1LF5GYI3 381 aa40.5■■■■■ 4.07
E2F4-213ENST00000569573 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa40.41■■■■■ 4.06
E2F4-213ENST00000569573 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP40.41■■■■■ 4.06
E2F4-213ENST00000569573 MIA2Q96PC5 1412 aa40.41■■■■■ 4.06
E2F4-213ENST00000569573 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP40.39■■■■■ 4.06
E2F4-213ENST00000569573 ANKLE2Q86XL3 938 aa40.39■■■■■ 4.06
E2F4-213ENST00000569573 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP40.39■■■■■ 4.06
E2F4-213ENST00000569573 NLRP1Q9C000 1473 aa40.39■■■■■ 4.06
E2F4-213ENST00000569573 MAST1Q9Y2H9 1570 aa40.38■■■■■ 4.05
E2F4-213ENST00000569573 MAP3K1Q13233 1512 aa40.37■■■■■ 4.05
E2F4-213ENST00000569573 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP40.36■■■■■ 4.05
E2F4-213ENST00000569573 MYOM3Q5VTT5 1437 aa40.35■■■■■ 4.05
E2F4-213ENST00000569573 ILDR2Q71H61 639 aa40.35■■■■■ 4.05
E2F4-213ENST00000569573 UGGT1Q9NYU2 1555 aa40.34■■■■■ 4.05
E2F4-213ENST00000569573 NEURL4Q96JN8 1562 aa40.33■■■■■ 4.05
E2F4-213ENST00000569573 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP40.33■■■■■ 4.05
E2F4-213ENST00000569573 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP40.3■■■■■ 4.04
E2F4-213ENST00000569573 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP40.29■■■■■ 4.04
E2F4-213ENST00000569573 ABCC3O15438 1527 aa40.28■■■■■ 4.04
E2F4-213ENST00000569573 CPS1P31327 1500 aa40.27■■■■■ 4.04
E2F4-213ENST00000569573 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP40.26■■■■■ 4.04
E2F4-213ENST00000569573 APLP2Q06481 763 aa40.26■■■■■ 4.04
E2F4-213ENST00000569573 SHANK2Q9UPX8 1470 aa40.26■■■■■ 4.03
E2F4-213ENST00000569573 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP40.23■■■■■ 4.03
E2F4-213ENST00000569573 DUOX2Q9NRD8 1548 aa40.2■■■■■ 4.03
E2F4-213ENST00000569573 SOCS7O14512 581 aa40.19■■■■■ 4.02
E2F4-213ENST00000569573 TOM1O60784 492 aa40.19■■■■■ 4.02
E2F4-213ENST00000569573 DEPDC5O75140 1603 aa40.18■■■■■ 4.02
E2F4-213ENST00000569573 ERVK-7P63135 1459 aa40.18■■■■■ 4.02
E2F4-213ENST00000569573 PIP4K2BP78356 416 aa40.17■■■■■ 4.02
E2F4-213ENST00000569573 MED14O60244 1454 aa40.16■■■■■ 4.02
E2F4-213ENST00000569573 MROH1Q8NDA8 1641 aa40.14■■■■■ 4.02
E2F4-213ENST00000569573 CEP152O94986 1710 aa40.13■■■■■ 4.02
E2F4-213ENST00000569573 KIF15Q9NS87 1388 aa40.12■■■■■ 4.01
E2F4-213ENST00000569573 VWDEQ8N2E2 1590 aa40.11■■■■■ 4.01
E2F4-213ENST00000569573 IQGAP1P46940 1657 aa40.11■■■■■ 4.01
E2F4-213ENST00000569573 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa40.09■■■■■ 4.01
E2F4-213ENST00000569573 PTPN23Q9H3S7 1636 aa40.07■■■■■ 4.01
E2F4-213ENST00000569573 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP40.06■■■■■ 4
E2F4-213ENST00000569573 ABCC5O15440 1437 aa40.06■■■■■ 4
E2F4-213ENST00000569573 ERBINQ96RT1 1412 aa40.06■■■■■ 4
E2F4-213ENST00000569573 CROCC2H7BZ55 1655 aa40.05■■■■■ 4
E2F4-213ENST00000569573 HSPA1LP34931 641 aa40.04■■■■■ 4
E2F4-213ENST00000569573 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP40.03■■■■■ 45e-7■■■□□ 15.1
E2F4-213ENST00000569573 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP40.01■■■■■ 4
E2F4-213ENST00000569573 DAPK1P53355 1430 aa39.99■■■■□ 3.99
E2F4-213ENST00000569573 KANK1Q14678 1352 aa39.98■■■■□ 3.99
E2F4-213ENST00000569573 UBR1Q8IWV7 1749 aa39.98■■■■□ 3.99
E2F4-213ENST00000569573 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa39.97■■■■□ 3.99
E2F4-213ENST00000569573 FGD6Q6ZV73 1430 aa39.96■■■■□ 3.99
E2F4-213ENST00000569573 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP39.94■■■■□ 3.98
E2F4-213ENST00000569573 CHIC2Q9UKJ5 165 aa39.92■■■■□ 3.98
E2F4-213ENST00000569573 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa39.92■■■■□ 3.98
E2F4-213ENST00000569573 TXNDC2Q86VQ3 553 aa39.91■■■■□ 3.98
E2F4-213ENST00000569573 STAG3Q9UJ98 1225 aa39.9■■■■□ 3.98
E2F4-213ENST00000569573 EID1Q9Y6B2 187 aa39.9■■■■□ 3.98
E2F4-213ENST00000569573 LRRC7Q96NW7 1537 aa39.88■■■■□ 3.97
E2F4-213ENST00000569573 SYNMO15061 1565 aa39.87■■■■□ 3.97
E2F4-213ENST00000569573 STRCP1A6NGW2 1772 aa39.86■■■■□ 3.97
E2F4-213ENST00000569573 SLIT1O75093 1534 aa39.86■■■■□ 3.97
E2F4-213ENST00000569573 LTKP29376 864 aa39.85■■■■□ 3.97
E2F4-213ENST00000569573 ARHGAP23Q9P227 1491 aa39.84■■■■□ 3.97
E2F4-213ENST00000569573 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP39.81■■■■□ 3.96
E2F4-213ENST00000569573 PIK3C2BO00750 1634 aa39.8■■■■□ 3.96
E2F4-213ENST00000569573 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP39.79■■■■□ 3.96
E2F4-213ENST00000569573 ALKQ9UM73 1620 aa39.78■■■■□ 3.96
E2F4-213ENST00000569573 TMEM2Q9UHN6 1383 aa39.75■■■■□ 3.95
E2F4-213ENST00000569573 LMTK2Q8IWU2 1503 aa39.75■■■■□ 3.95
E2F4-213ENST00000569573 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP39.73■■■■□ 3.95
E2F4-213ENST00000569573 EFCAB6Q5THR3 1501 aa39.71■■■■□ 3.95
E2F4-213ENST00000569573 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP39.71■■■■□ 3.95
E2F4-213ENST00000569573 IDI1Q13907 227 aa39.7■■■■□ 3.95
E2F4-213ENST00000569573 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP39.65■■■■□ 3.94
E2F4-213ENST00000569573 ADGRL2O95490 1459 aa39.65■■■■□ 3.94
E2F4-213ENST00000569573 NOS1P29475 1434 aa39.6■■■■□ 3.93
E2F4-213ENST00000569573 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa39.58■■■■□ 3.93
E2F4-213ENST00000569573 SLC52A1Q9NWF4 448 aa39.58■■■■□ 3.93
E2F4-213ENST00000569573 BCANQ96GW7 911 aa39.57■■■■□ 3.93
E2F4-213ENST00000569573 ADGRB3O60242 1522 aa39.56■■■■□ 3.92
E2F4-213ENST00000569573 SLC26A8Q96RN1 970 aa39.55■■■■□ 3.92
E2F4-213ENST00000569573 KCNA6P17658 529 aa39.53■■■■□ 3.92
E2F4-213ENST00000569573 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP39.53■■■■□ 3.92
E2F4-213ENST00000569573 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP39.51■■■■□ 3.92
E2F4-213ENST00000569573 TMEM94Q12767 1356 aa39.51■■■■□ 3.92
E2F4-213ENST00000569573 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP39.49■■■■□ 3.91
E2F4-213ENST00000569573 TET3O43151 1660 aa39.46■■■■□ 3.91
E2F4-213ENST00000569573 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP39.43■■■■□ 3.9
E2F4-213ENST00000569573 HDGFP51858 240 aaKnown RBP39.42■■■■□ 3.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.7 ms