RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566637.5

CTU2-208, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 2

Gene CTU2, Length 1,619 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-208ENST00000566637 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa29.86■■■□□ 2.37
CTU2-208ENST00000566637 A2MP01023 1474 aa29.86■■■□□ 2.37
CTU2-208ENST00000566637 ABCA6Q8N139 1617 aa29.85■■■□□ 2.37
CTU2-208ENST00000566637 PKD2Q13563 968 aa29.84■■■□□ 2.37
CTU2-208ENST00000566637 FOXD1Q16676 465 aa29.84■■■□□ 2.37
CTU2-208ENST00000566637 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP29.84■■■□□ 2.37
CTU2-208ENST00000566637 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa29.83■■■□□ 2.37
CTU2-208ENST00000566637 DEPDC5O75140 1603 aa29.83■■■□□ 2.37
CTU2-208ENST00000566637 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa29.83■■■□□ 2.37
CTU2-208ENST00000566637 TONSLQ96HA7 1378 aa29.8■■■□□ 2.36
CTU2-208ENST00000566637 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa29.8■■■□□ 2.36
CTU2-208ENST00000566637 KIF3BO15066 747 aa29.77■■■□□ 2.36
CTU2-208ENST00000566637 KANK1Q14678 1352 aa29.76■■■□□ 2.35
CTU2-208ENST00000566637 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
CTU2-208ENST00000566637 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
CTU2-208ENST00000566637 BCORL1Q5H9F3 1711 aa29.73■■■□□ 2.35
CTU2-208ENST00000566637 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
CTU2-208ENST00000566637 YEATS2Q9ULM3 1422 aa29.7■■■□□ 2.35
CTU2-208ENST00000566637 MROH1Q8NDA8 1641 aa29.7■■■□□ 2.34
CTU2-208ENST00000566637 VWDEQ8N2E2 1590 aa29.69■■■□□ 2.34
CTU2-208ENST00000566637 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
CTU2-208ENST00000566637 TET3O43151 1660 aa29.67■■■□□ 2.34
CTU2-208ENST00000566637 ATP10AO60312 1499 aa29.63■■■□□ 2.33
CTU2-208ENST00000566637 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.63■■■□□ 2.33
CTU2-208ENST00000566637 E9PCH4 1651 aa29.6■■■□□ 2.33
CTU2-208ENST00000566637 REREQ9P2R6 1566 aa29.6■■■□□ 2.33
CTU2-208ENST00000566637 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
CTU2-208ENST00000566637 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa29.59■■■□□ 2.33
CTU2-208ENST00000566637 LMTK2Q8IWU2 1503 aa29.58■■■□□ 2.33
CTU2-208ENST00000566637 CEP152O94986 1710 aa29.57■■■□□ 2.32
CTU2-208ENST00000566637 GGT6Q6P531 493 aa29.55■■■□□ 2.32
CTU2-208ENST00000566637 CCDC144AA2RUR9 1427 aa29.55■■■□□ 2.32
CTU2-208ENST00000566637 EFCAB6Q5THR3 1501 aa29.54■■■□□ 2.32
CTU2-208ENST00000566637 PLA2R1Q13018 1463 aa29.52■■■□□ 2.32
CTU2-208ENST00000566637 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa29.51■■■□□ 2.32
CTU2-208ENST00000566637 L3MBTL2Q969R5 705 aa29.51■■■□□ 2.31
CTU2-208ENST00000566637 AGLP35573 1532 aa29.51■■■□□ 2.31
CTU2-208ENST00000566637 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
CTU2-208ENST00000566637 ABCC3O15438 1527 aa29.49■■■□□ 2.31
CTU2-208ENST00000566637 TRPM2O94759 1503 aa29.48■■■□□ 2.31
CTU2-208ENST00000566637 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
CTU2-208ENST00000566637 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa29.45■■■□□ 2.31
CTU2-208ENST00000566637 PTPRTO14522 1441 aa29.45■■■□□ 2.3
CTU2-208ENST00000566637 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa29.45■■■□□ 2.3
CTU2-208ENST00000566637 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa29.37■■■□□ 2.29
CTU2-208ENST00000566637 CLTCL1P53675 1640 aa29.37■■■□□ 2.29
CTU2-208ENST00000566637 NPATQ14207 1427 aa29.35■■■□□ 2.29
CTU2-208ENST00000566637 PPP6R1Q9UPN7 881 aa29.34■■■□□ 2.29
CTU2-208ENST00000566637 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa29.32■■■□□ 2.28
CTU2-208ENST00000566637 CNTLNQ9NXG0 1405 aa29.3■■■□□ 2.28
CTU2-208ENST00000566637 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa29.27■■■□□ 2.28
CTU2-208ENST00000566637 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa29.27■■■□□ 2.28
CTU2-208ENST00000566637 NBPF8Q3BBV2 869 aa29.27■■■□□ 2.28
CTU2-208ENST00000566637 RGL3Q3MIN7 710 aa29.26■■■□□ 2.27
CTU2-208ENST00000566637 DCAF11Q8TEB1 546 aa29.26■■■□□ 2.27
CTU2-208ENST00000566637 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
CTU2-208ENST00000566637 KIF1BO60333 1816 aa29.25■■■□□ 2.27
CTU2-208ENST00000566637 NEURL4Q96JN8 1562 aa29.25■■■□□ 2.27
CTU2-208ENST00000566637 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
CTU2-208ENST00000566637 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
CTU2-208ENST00000566637 UGGT1Q9NYU2 1555 aa29.24■■■□□ 2.27
CTU2-208ENST00000566637 MLECQ14165 292 aa29.23■■■□□ 2.27
CTU2-208ENST00000566637 NOS1P29475 1434 aa29.23■■■□□ 2.27
CTU2-208ENST00000566637 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
CTU2-208ENST00000566637 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa29.22■■■□□ 2.27
CTU2-208ENST00000566637 PREX1Q8TCU6 1659 aa29.2■■■□□ 2.26
CTU2-208ENST00000566637 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
CTU2-208ENST00000566637 SYNMO15061 1565 aa29.17■■■□□ 2.26
CTU2-208ENST00000566637 RALGAPBQ86X10 1494 aa29.17■■■□□ 2.26
CTU2-208ENST00000566637 PIK3C2BO00750 1634 aa29.15■■■□□ 2.26
CTU2-208ENST00000566637 PRAG1Q86YV5 1406 aa29.15■■■□□ 2.26
CTU2-208ENST00000566637 ADGRB3O60242 1522 aa29.14■■■□□ 2.26
CTU2-208ENST00000566637 MROH2AA6NES4 1674 aa29.13■■■□□ 2.25
CTU2-208ENST00000566637 STAC3Q96MF2 364 aa29.12■■■□□ 2.25
CTU2-208ENST00000566637 ERVK-7P63135 1459 aa29.12■■■□□ 2.25
CTU2-208ENST00000566637 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP29.11■■■□□ 2.25
CTU2-208ENST00000566637 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
CTU2-208ENST00000566637 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa29.09■■■□□ 2.25
CTU2-208ENST00000566637 CHGAP10645 457 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
CTU2-208ENST00000566637 SLC52A1Q9NWF4 448 aa29.07■■■□□ 2.24
CTU2-208ENST00000566637 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
CTU2-208ENST00000566637 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa29.06■■■□□ 2.24
CTU2-208ENST00000566637 MADDQ8WXG6 1647 aa29.06■■■□□ 2.24
CTU2-208ENST00000566637 IFT172Q9UG01 1749 aa29.05■■■□□ 2.24
CTU2-208ENST00000566637 MYOM2P54296 1465 aa29.03■■■□□ 2.24
CTU2-208ENST00000566637 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
CTU2-208ENST00000566637 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
CTU2-208ENST00000566637 ZMYM3Q14202 1370 aa29.03■■■□□ 2.24
CTU2-208ENST00000566637 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
CTU2-208ENST00000566637 CARD11Q9BXL7 1154 aa29■■■□□ 2.23
CTU2-208ENST00000566637 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa28.99■■■□□ 2.23
CTU2-208ENST00000566637 IDI1Q13907 227 aa28.99■■■□□ 2.23
CTU2-208ENST00000566637 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa28.99■■■□□ 2.23
CTU2-208ENST00000566637 PPLO60437 1756 aa28.99■■■□□ 2.23
CTU2-208ENST00000566637 LAMC1P11047 1609 aa28.98■■■□□ 2.23
CTU2-208ENST00000566637 USP47Q96K76 1375 aa28.98■■■□□ 2.23
CTU2-208ENST00000566637 GPRASP1Q5JY77 1395 aa28.95■■■□□ 2.22
CTU2-208ENST00000566637 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa28.95■■■□□ 2.22
CTU2-208ENST00000566637 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa28.94■■■□□ 2.22
CTU2-208ENST00000566637 MYO5BQ9ULV0 1848 aa28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 185.9 ms