RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557667.5

RBM23-233, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 1 (best)

Gene RBM23, Length 4,240 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-233	ENST00000557667	FANCA	O15360	1455 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RBM23-233	ENST00000557667	DEPDC5	O75140	1603 aa		11.79	□□□□□ -0.52
RBM23-233	ENST00000557667	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		11.79	□□□□□ -0.52
RBM23-233	ENST00000557667	TET3	O43151	1660 aa		11.79	□□□□□ -0.52
RBM23-233	ENST00000557667	ATP7A	Q04656	1500 aa		11.79	□□□□□ -0.52
RBM23-233	ENST00000557667	CDCA8	Q53HL2	280 aa		11.79	□□□□□ -0.52
RBM23-233	ENST00000557667	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.52
RBM23-233	ENST00000557667	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		11.77	□□□□□ -0.52
RBM23-233	ENST00000557667	ADGRL1	O94910	1474 aa		11.77	□□□□□ -0.52
RBM23-233	ENST00000557667	ASXL2	Q76L83	1435 aa		11.77	□□□□□ -0.52
RBM23-233	ENST00000557667	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		11.77	□□□□□ -0.53
RBM23-233	ENST00000557667	PKD2	Q13563	968 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM23-233	ENST00000557667	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
RBM23-233	ENST00000557667	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
RBM23-233	ENST00000557667	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
RBM23-233	ENST00000557667	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM23-233	ENST00000557667	TRPM2	O94759	1503 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM23-233	ENST00000557667	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
RBM23-233	ENST00000557667	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM23-233	ENST00000557667	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM23-233	ENST00000557667	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RBM23-233	ENST00000557667	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM23-233	ENST00000557667	KDM6B	O15054	1643 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM23-233	ENST00000557667	KDM5C	P41229	1560 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM23-233	ENST00000557667	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	11.73	□□□□□ -0.53
RBM23-233	ENST00000557667	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
RBM23-233	ENST00000557667	ARID3C	A6NKF2	412 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM23-233	ENST00000557667	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM23-233	ENST00000557667	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM23-233	ENST00000557667	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM23-233	ENST00000557667	CD109	Q6YHK3	1445 aa		11.71	□□□□□ -0.53
RBM23-233	ENST00000557667	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		11.71	□□□□□ -0.54
RBM23-233	ENST00000557667	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		11.71	□□□□□ -0.54
RBM23-233	ENST00000557667	PTPRT	O14522	1441 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RBM23-233	ENST00000557667	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
RBM23-233	ENST00000557667	INSR	P06213	1382 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RBM23-233	ENST00000557667	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RBM23-233	ENST00000557667	RERE	Q9P2R6	1566 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RBM23-233	ENST00000557667	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
RBM23-233	ENST00000557667	CEP152	O94986	1710 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RBM23-233	ENST00000557667	MYOM2	P54296	1465 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RBM23-233	ENST00000557667	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RBM23-233	ENST00000557667	CCDC7	Q96M83	1385 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RBM23-233	ENST00000557667	A2M	P01023	1474 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RBM23-233	ENST00000557667	KCNH8	Q96L42	1107 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RBM23-233	ENST00000557667	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RBM23-233	ENST00000557667	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RBM23-233	ENST00000557667	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
RBM23-233	ENST00000557667	MIER1	Q8N108	512 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RBM23-233	ENST00000557667	MYT1	Q01538	1121 aa		11.66	□□□□□ -0.54
RBM23-233	ENST00000557667	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM23-233	ENST00000557667	USP47	Q96K76	1375 aa		11.65	□□□□□ -0.55
RBM23-233	ENST00000557667	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		11.65	□□□□□ -0.55
RBM23-233	ENST00000557667	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RBM23-233	ENST00000557667	RALBP1	Q15311	655 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RBM23-233	ENST00000557667	NEFL	P07196	543 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RBM23-233	ENST00000557667	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RBM23-233	ENST00000557667	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RBM23-233	ENST00000557667	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RBM23-233	ENST00000557667	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RBM23-233	ENST00000557667	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RBM23-233	ENST00000557667	ARX	Q96QS3	562 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM23-233	ENST00000557667	AGL	P35573	1532 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM23-233	ENST00000557667	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RBM23-233	ENST00000557667	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM23-233	ENST00000557667	KIF1B	O60333	1816 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RBM23-233	ENST00000557667	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RBM23-233	ENST00000557667	TMF1	P82094	1093 aa		11.6	□□□□□ -0.55
RBM23-233	ENST00000557667	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		11.6	□□□□□ -0.55
RBM23-233	ENST00000557667	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	11.59	□□□□□ -0.55
RBM23-233	ENST00000557667	NGEF	Q8N5V2	710 aa		11.58	□□□□□ -0.56
RBM23-233	ENST00000557667	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		11.58	□□□□□ -0.56
RBM23-233	ENST00000557667		E9PCH4	1651 aa		11.58	□□□□□ -0.56
RBM23-233	ENST00000557667	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		11.58	□□□□□ -0.56
RBM23-233	ENST00000557667	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	11.57	□□□□□ -0.56
RBM23-233	ENST00000557667	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	11.56	□□□□□ -0.56
RBM23-233	ENST00000557667	ZFYVE9	O95405	1425 aa		11.56	□□□□□ -0.56
RBM23-233	ENST00000557667	SYNM	O15061	1565 aa		11.56	□□□□□ -0.56
RBM23-233	ENST00000557667	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		11.56	□□□□□ -0.56
RBM23-233	ENST00000557667	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		11.56	□□□□□ -0.56
RBM23-233	ENST00000557667	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		11.55	□□□□□ -0.56
RBM23-233	ENST00000557667	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	11.55	□□□□□ -0.56
RBM23-233	ENST00000557667	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		11.55	□□□□□ -0.56
RBM23-233	ENST00000557667	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		11.54	□□□□□ -0.56
RBM23-233	ENST00000557667	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		11.54	□□□□□ -0.56
RBM23-233	ENST00000557667	MADD	Q8WXG6	1647 aa		11.54	□□□□□ -0.56
RBM23-233	ENST00000557667	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	11.53	□□□□□ -0.56
RBM23-233	ENST00000557667	ADGRB3	O60242	1522 aa		11.53	□□□□□ -0.56
RBM23-233	ENST00000557667	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		11.52	□□□□□ -0.56
RBM23-233	ENST00000557667	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		11.52	□□□□□ -0.56
RBM23-233	ENST00000557667	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		11.52	□□□□□ -0.56
RBM23-233	ENST00000557667	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		11.52	□□□□□ -0.56
RBM23-233	ENST00000557667	KIF3B	O15066	747 aa		11.52	□□□□□ -0.56
RBM23-233	ENST00000557667	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	11.52	□□□□□ -0.56
RBM23-233	ENST00000557667	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		11.52	□□□□□ -0.57
RBM23-233	ENST00000557667	RICTOR	Q6R327	1708 aa		11.52	□□□□□ -0.57
RBM23-233	ENST00000557667	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		11.51	□□□□□ -0.57
RBM23-233	ENST00000557667	ABCC3	O15438	1527 aa		11.51	□□□□□ -0.57
RBM23-233	ENST00000557667	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		11.51	□□□□□ -0.57

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