RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557569.1

CKB-217, Transcript of creatine kinase B, humanhuman

TSL 2

Gene CKB, Length 579 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKB-217ENST00000557569 KIF3BO15066 747 aa42.41■■■■■ 4.38
CKB-217ENST00000557569 TNRQ92752 1358 aa42.4■■■■■ 4.38
CKB-217ENST00000557569 NEURL4Q96JN8 1562 aa42.37■■■■■ 4.37
CKB-217ENST00000557569 PZPP20742 1482 aa42.36■■■■■ 4.37
CKB-217ENST00000557569 CCDC141Q6ZP82 1450 aa42.36■■■■■ 4.37
CKB-217ENST00000557569 KDM5DQ9BY66 1539 aa42.33■■■■■ 4.37
CKB-217ENST00000557569 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa42.31■■■■■ 4.36
CKB-217ENST00000557569 NCOA2Q15596 1464 aa42.3■■■■■ 4.36
CKB-217ENST00000557569 FAM135AQ9P2D6 1515 aa42.27■■■■■ 4.36
CKB-217ENST00000557569 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP42.26■■■■■ 4.36
CKB-217ENST00000557569 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa42.26■■■■■ 4.36
CKB-217ENST00000557569 SHANK2Q9UPX8 1470 aa42.26■■■■■ 4.36
CKB-217ENST00000557569 HSPA1LP34931 641 aa42.25■■■■■ 4.35
CKB-217ENST00000557569 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP42.25■■■■■ 4.35
CKB-217ENST00000557569 CPS1P31327 1500 aa42.24■■■■■ 4.35
CKB-217ENST00000557569 MIA2Q96PC5 1412 aa42.22■■■■■ 4.35
CKB-217ENST00000557569 PIP4K2BP78356 416 aa42.22■■■■■ 4.35
CKB-217ENST00000557569 RSPH4AQ5TD94 716 aa42.21■■■■■ 4.35
CKB-217ENST00000557569 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP42.2■■■■■ 4.35
CKB-217ENST00000557569 ANKLE2Q86XL3 938 aa42.19■■■■■ 4.34
CKB-217ENST00000557569 VWDEQ8N2E2 1590 aa42.17■■■■■ 4.34
CKB-217ENST00000557569 NLRP1Q9C000 1473 aa42.16■■■■■ 4.34
CKB-217ENST00000557569 TOM1O60784 492 aa42.15■■■■■ 4.34
CKB-217ENST00000557569 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP42.15■■■■■ 4.34
CKB-217ENST00000557569 ARHGEF5Q12774 1597 aa42.14■■■■■ 4.34
CKB-217ENST00000557569 UGGT1Q9NYU2 1555 aa42.12■■■■■ 4.33
CKB-217ENST00000557569 MED14O60244 1454 aa42.11■■■■■ 4.33
CKB-217ENST00000557569 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP42.11■■■■■ 4.33
CKB-217ENST00000557569 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP42.09■■■■■ 4.33
CKB-217ENST00000557569 TSPY4P0CV99 314 aa42.08■■■■■ 4.33
CKB-217ENST00000557569 TSPY10P0CW01 314 aa42.08■■■■■ 4.33
CKB-217ENST00000557569 ALKQ9UM73 1620 aa42.07■■■■■ 4.33
CKB-217ENST00000557569 DEPDC5O75140 1603 aa42.06■■■■■ 4.32
CKB-217ENST00000557569 ABCC3O15438 1527 aa42.03■■■■■ 4.32
CKB-217ENST00000557569 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP42.01■■■■■ 4.32
CKB-217ENST00000557569 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa41.95■■■■■ 4.31
CKB-217ENST00000557569 MAST1Q9Y2H9 1570 aa41.95■■■■■ 4.31
CKB-217ENST00000557569 IQGAP1P46940 1657 aa41.95■■■■■ 4.31
CKB-217ENST00000557569 ERVK-7P63135 1459 aa41.94■■■■■ 4.3
CKB-217ENST00000557569 MROH1Q8NDA8 1641 aa41.91■■■■■ 4.3
CKB-217ENST00000557569 STRCP1A6NGW2 1772 aa41.91■■■■■ 4.3
CKB-217ENST00000557569 LRRC7Q96NW7 1537 aa41.9■■■■■ 4.3
CKB-217ENST00000557569 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP41.89■■■■■ 4.3
CKB-217ENST00000557569 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP41.85■■■■■ 4.29
CKB-217ENST00000557569 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP41.84■■■■■ 4.29
CKB-217ENST00000557569 VPS8Q8N3P4 1428 aa41.84■■■■■ 4.29
CKB-217ENST00000557569 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP41.78■■■■■ 4.28
CKB-217ENST00000557569 CEP152O94986 1710 aa41.77■■■■■ 4.28
CKB-217ENST00000557569 UBR1Q8IWV7 1749 aa41.76■■■■■ 4.28
CKB-217ENST00000557569 MYOM3Q5VTT5 1437 aa41.75■■■■■ 4.27
CKB-217ENST00000557569 SYNMO15061 1565 aa41.75■■■■■ 4.27
CKB-217ENST00000557569 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP41.74■■■■■ 4.27
CKB-217ENST00000557569 LTKP29376 864 aa41.74■■■■■ 4.27
CKB-217ENST00000557569 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP41.73■■■■■ 4.27
CKB-217ENST00000557569 DUOX2Q9NRD8 1548 aa41.72■■■■■ 4.27
CKB-217ENST00000557569 ARHGAP23Q9P227 1491 aa41.71■■■■■ 4.27
CKB-217ENST00000557569 MAP3K1Q13233 1512 aa41.68■■■■■ 4.26
CKB-217ENST00000557569 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.67■■■■■ 4.26
CKB-217ENST00000557569 SLIT1O75093 1534 aa41.67■■■■■ 4.26
CKB-217ENST00000557569 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP41.67■■■■■ 4.26
CKB-217ENST00000557569 TXNDC2Q86VQ3 553 aa41.66■■■■■ 4.26
CKB-217ENST00000557569 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa41.66■■■■■ 4.26
CKB-217ENST00000557569 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP41.64■■■■■ 4.26
CKB-217ENST00000557569 KIF15Q9NS87 1388 aa41.63■■■■■ 4.26
CKB-217ENST00000557569 ABCC5O15440 1437 aa41.6■■■■■ 4.25
CKB-217ENST00000557569 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa41.59■■■■■ 4.25
CKB-217ENST00000557569 ERBINQ96RT1 1412 aa41.57■■■■■ 4.25
CKB-217ENST00000557569 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP41.53■■■■■ 4.241e-7■□□□□ 8.2
CKB-217ENST00000557569 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP41.52■■■■■ 4.24
CKB-217ENST00000557569 PIK3C2BO00750 1634 aa41.51■■■■■ 4.24
CKB-217ENST00000557569 TMEM2Q9UHN6 1383 aa41.51■■■■■ 4.24
CKB-217ENST00000557569 EID1Q9Y6B2 187 aa41.51■■■■■ 4.24
CKB-217ENST00000557569 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP41.5■■■■■ 4.23
CKB-217ENST00000557569 CROCC2H7BZ55 1655 aa41.49■■■■■ 4.23
CKB-217ENST00000557569 PTPN23Q9H3S7 1636 aa41.44■■■■■ 4.22
CKB-217ENST00000557569 DAPK1P53355 1430 aa41.44■■■■■ 4.22
CKB-217ENST00000557569 IDI1Q13907 227 aa41.42■■■■■ 4.22
CKB-217ENST00000557569 TMEM94Q12767 1356 aa41.39■■■■■ 4.22
CKB-217ENST00000557569 FAM135BQ49AJ0 1406 aa41.39■■■■■ 4.22
CKB-217ENST00000557569 STAG3Q9UJ98 1225 aa41.39■■■■■ 4.22
CKB-217ENST00000557569 EFCAB6Q5THR3 1501 aa41.39■■■■■ 4.22
CKB-217ENST00000557569 KANK1Q14678 1352 aa41.38■■■■■ 4.22
CKB-217ENST00000557569 LMTK2Q8IWU2 1503 aa41.37■■■■■ 4.21
CKB-217ENST00000557569 TET3O43151 1660 aa41.33■■■■■ 4.21
CKB-217ENST00000557569 KCNA6P17658 529 aa41.33■■■■■ 4.21
CKB-217ENST00000557569 SLC26A8Q96RN1 970 aa41.33■■■■■ 4.21
CKB-217ENST00000557569 CHIC2Q9UKJ5 165 aa41.33■■■■■ 4.21
CKB-217ENST00000557569 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP41.32■■■■■ 4.21
CKB-217ENST00000557569 FGD6Q6ZV73 1430 aa41.32■■■■■ 4.21
CKB-217ENST00000557569 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP41.32■■■■■ 4.2
CKB-217ENST00000557569 NOS1P29475 1434 aa41.29■■■■■ 4.2
CKB-217ENST00000557569 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa41.28■■■■■ 4.2
CKB-217ENST00000557569 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP41.25■■■■■ 4.19
CKB-217ENST00000557569 ADGRB3O60242 1522 aa41.22■■■■■ 4.19
CKB-217ENST00000557569 POTEAQ6S8J7 498 aa41.21■■■■■ 4.19
CKB-217ENST00000557569 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa41.2■■■■■ 4.19
CKB-217ENST00000557569 NWD1Q149M9 1564 aa41.17■■■■■ 4.18
CKB-217ENST00000557569 APLP2Q06481 763 aa41.17■■■■■ 4.18
CKB-217ENST00000557569 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP41.15■■■■■ 4.18
CKB-217ENST00000557569 SLC52A1Q9NWF4 448 aa41.14■■■■■ 4.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms