RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554716.5

PRMT5-215, Transcript of protein arginine methyltransferase 5, human

TSL 4

Gene PRMT5, Length 561 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRMT5-215	ENST00000554716	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		33.28	■■■□□ 2.92
PRMT5-215	ENST00000554716	MAP3K1	Q13233	1512 aa		33.26	■■■□□ 2.91
PRMT5-215	ENST00000554716	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		33.25	■■■□□ 2.91
PRMT5-215	ENST00000554716	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		33.25	■■■□□ 2.91
PRMT5-215	ENST00000554716	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	33.25	■■■□□ 2.91
PRMT5-215	ENST00000554716	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		33.24	■■■□□ 2.91
PRMT5-215	ENST00000554716	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		33.24	■■■□□ 2.91
PRMT5-215	ENST00000554716	PZP	P20742	1482 aa		33.2	■■■□□ 2.91
PRMT5-215	ENST00000554716	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	33.2	■■■□□ 2.91
PRMT5-215	ENST00000554716	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	33.19	■■■□□ 2.9
PRMT5-215	ENST00000554716	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	33.18	■■■□□ 2.9
PRMT5-215	ENST00000554716	TNR	Q92752	1358 aa		33.18	■■■□□ 2.9
PRMT5-215	ENST00000554716	MIA2	Q96PC5	1412 aa		33.17	■■■□□ 2.9
PRMT5-215	ENST00000554716	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		33.17	■■■□□ 2.9
PRMT5-215	ENST00000554716	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	33.16	■■■□□ 2.9
PRMT5-215	ENST00000554716	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		33.14	■■■□□ 2.9
PRMT5-215	ENST00000554716	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	33.08	■■■□□ 2.89
PRMT5-215	ENST00000554716	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	33.06	■■■□□ 2.88
PRMT5-215	ENST00000554716	NLRP1	Q9C000	1473 aa		33.05	■■■□□ 2.88
PRMT5-215	ENST00000554716	APLP2	Q06481	763 aa		33.05	■■■□□ 2.88
PRMT5-215	ENST00000554716	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	33.04	■■■□□ 2.88
PRMT5-215	ENST00000554716	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	33.03	■■■□□ 2.88
PRMT5-215	ENST00000554716	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	33.03	■■■□□ 2.88
PRMT5-215	ENST00000554716	ABCC3	O15438	1527 aa		33.01	■■■□□ 2.87
PRMT5-215	ENST00000554716	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		33	■■■□□ 2.87
PRMT5-215	ENST00000554716	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		33	■■■□□ 2.87
PRMT5-215	ENST00000554716	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	32.98	■■■□□ 2.87
PRMT5-215	ENST00000554716	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		32.98	■■■□□ 2.87
PRMT5-215	ENST00000554716	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		32.97	■■■□□ 2.87
PRMT5-215	ENST00000554716	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		32.97	■■■□□ 2.87
PRMT5-215	ENST00000554716	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		32.96	■■■□□ 2.87
PRMT5-215	ENST00000554716	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		32.94	■■■□□ 2.86
PRMT5-215	ENST00000554716	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		32.94	■■■□□ 2.86
PRMT5-215	ENST00000554716	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		32.93	■■■□□ 2.86
PRMT5-215	ENST00000554716	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		32.91	■■■□□ 2.86
PRMT5-215	ENST00000554716	KIF15	Q9NS87	1388 aa		32.9	■■■□□ 2.86
PRMT5-215	ENST00000554716	ABCC5	O15440	1437 aa		32.9	■■■□□ 2.86
PRMT5-215	ENST00000554716	ERVK-7	P63135	1459 aa		32.9	■■■□□ 2.86
PRMT5-215	ENST00000554716	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		32.89	■■■□□ 2.86
PRMT5-215	ENST00000554716	DEPDC5	O75140	1603 aa		32.89	■■■□□ 2.86
PRMT5-215	ENST00000554716	CPS1	P31327	1500 aa		32.89	■■■□□ 2.86
PRMT5-215	ENST00000554716	MED14	O60244	1454 aa		32.88	■■■□□ 2.85
PRMT5-215	ENST00000554716	CEP152	O94986	1710 aa		32.88	■■■□□ 2.85
PRMT5-215	ENST00000554716	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		32.87	■■■□□ 2.85
PRMT5-215	ENST00000554716	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	32.86	■■■□□ 2.85
PRMT5-215	ENST00000554716	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		32.85	■■■□□ 2.85
PRMT5-215	ENST00000554716	DAPK1	P53355	1430 aa		32.84	■■■□□ 2.85
PRMT5-215	ENST00000554716	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		32.83	■■■□□ 2.85
PRMT5-215	ENST00000554716	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	32.82	■■■□□ 2.85
PRMT5-215	ENST00000554716	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		32.8	■■■□□ 2.84
PRMT5-215	ENST00000554716	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	32.8	■■■□□ 2.84
PRMT5-215	ENST00000554716	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		32.79	■■■□□ 2.84
PRMT5-215	ENST00000554716	IQGAP1	P46940	1657 aa		32.78	■■■□□ 2.84
PRMT5-215	ENST00000554716	TOM1	O60784	492 aa		32.77	■■■□□ 2.84
PRMT5-215	ENST00000554716	ILDR2	Q71H61	639 aa		32.76	■■■□□ 2.83
PRMT5-215	ENST00000554716	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	32.75	■■■□□ 2.83	4e-7	■□□□□ 9.4
PRMT5-215	ENST00000554716	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		32.74	■■■□□ 2.83
PRMT5-215	ENST00000554716	KANK1	Q14678	1352 aa		32.74	■■■□□ 2.83
PRMT5-215	ENST00000554716	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		32.74	■■■□□ 2.83
PRMT5-215	ENST00000554716	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		32.71	■■■□□ 2.83
PRMT5-215	ENST00000554716	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	32.71	■■■□□ 2.83
PRMT5-215	ENST00000554716	PIP4K2B	P78356	416 aa		32.68	■■■□□ 2.82
PRMT5-215	ENST00000554716	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	32.67	■■■□□ 2.82
PRMT5-215	ENST00000554716	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		32.65	■■■□□ 2.82
PRMT5-215	ENST00000554716	SLIT1	O75093	1534 aa		32.65	■■■□□ 2.82
PRMT5-215	ENST00000554716	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		32.64	■■■□□ 2.82
PRMT5-215	ENST00000554716	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		32.63	■■■□□ 2.81
PRMT5-215	ENST00000554716	SOCS7	O14512	581 aa		32.61	■■■□□ 2.81
PRMT5-215	ENST00000554716	LTK	P29376	864 aa		32.61	■■■□□ 2.81
PRMT5-215	ENST00000554716	HSPA1L	P34931	641 aa		32.61	■■■□□ 2.81
PRMT5-215	ENST00000554716	EID1	Q9Y6B2	187 aa		32.61	■■■□□ 2.81
PRMT5-215	ENST00000554716	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		32.6	■■■□□ 2.81
PRMT5-215	ENST00000554716	ADGRL2	O95490	1459 aa		32.6	■■■□□ 2.81
PRMT5-215	ENST00000554716	PIK3C2B	O00750	1634 aa		32.59	■■■□□ 2.81
PRMT5-215	ENST00000554716	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		32.59	■■■□□ 2.81
PRMT5-215	ENST00000554716	SYNM	O15061	1565 aa		32.58	■■■□□ 2.81
PRMT5-215	ENST00000554716	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		32.58	■■■□□ 2.81
PRMT5-215	ENST00000554716	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	32.58	■■■□□ 2.81
PRMT5-215	ENST00000554716	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		32.55	■■■□□ 2.8
PRMT5-215	ENST00000554716	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	32.54	■■■□□ 2.8
PRMT5-215	ENST00000554716	IDI1	Q13907	227 aa		32.53	■■■□□ 2.8
PRMT5-215	ENST00000554716	ALK	Q9UM73	1620 aa		32.52	■■■□□ 2.8
PRMT5-215	ENST00000554716	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		32.51	■■■□□ 2.79
PRMT5-215	ENST00000554716	NOS1	P29475	1434 aa		32.49	■■■□□ 2.79
PRMT5-215	ENST00000554716	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		32.49	■■■□□ 2.79
PRMT5-215	ENST00000554716	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		32.45	■■■□□ 2.79
PRMT5-215	ENST00000554716	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
PRMT5-215	ENST00000554716	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	32.41	■■■□□ 2.78
PRMT5-215	ENST00000554716	ADGRB3	O60242	1522 aa		32.4	■■■□□ 2.78
PRMT5-215	ENST00000554716	TET3	O43151	1660 aa		32.35	■■■□□ 2.77
PRMT5-215	ENST00000554716	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	32.35	■■■□□ 2.77
PRMT5-215	ENST00000554716	KCNA6	P17658	529 aa		32.34	■■■□□ 2.77
PRMT5-215	ENST00000554716	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		32.33	■■■□□ 2.77
PRMT5-215	ENST00000554716	ROCK1	Q13464	1354 aa		32.31	■■■□□ 2.76
PRMT5-215	ENST00000554716	UNC13B	O14795	1591 aa		32.3	■■■□□ 2.76
PRMT5-215	ENST00000554716	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	32.3	■■■□□ 2.76
PRMT5-215	ENST00000554716	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		32.29	■■■□□ 2.76
PRMT5-215	ENST00000554716	TMEM94	Q12767	1356 aa		32.28	■■■□□ 2.76
PRMT5-215	ENST00000554716	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	32.27	■■■□□ 2.76
PRMT5-215	ENST00000554716	BCAN	Q96GW7	911 aa		32.27	■■■□□ 2.76

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