RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551483.5

CNOT2-231, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 2, human

TSL 2 BASIC

Gene CNOT2, Length 4,753 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT2-231	ENST00000551483	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CNOT2-231	ENST00000551483	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CNOT2-231	ENST00000551483	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CNOT2-231	ENST00000551483	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CNOT2-231	ENST00000551483	CCDC181	Q5TID7	509 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CNOT2-231	ENST00000551483	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CNOT2-231	ENST00000551483	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CNOT2-231	ENST00000551483	SEMA3F	Q13275	785 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CNOT2-231	ENST00000551483	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CNOT2-231	ENST00000551483	WDR78	Q5VTH9	848 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CNOT2-231	ENST00000551483	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CNOT2-231	ENST00000551483	EVI5L	Q96CN4	794 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CNOT2-231	ENST00000551483	UNCX	A6NJT0	531 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	GOLIM4	O00461	696 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	MMP14	P50281	582 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	MTA3	Q9BTC8	594 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	RAB11FIP3	O75154	756 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	NRDC	O43847	1150 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	MYBPC2	Q14324	1141 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	GET4	Q7L5D6	327 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	NME8	Q8N427	588 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	MORC4	Q8TE76	937 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	PAX3	P23760	479 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	LONRF3	Q496Y0	759 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	RGL3	Q3MIN7	710 aa		5	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	5	□□□□□ -1.61	7e-6	■■■■■ 74.5
CNOT2-231	ENST00000551483	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	CEP120	Q8N960	986 aa		5	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	CCDC96	Q2M329	555 aa		5	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		5	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF280D	Q6N043	979 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	SIRT1	Q96EB6	747 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	SSFA2	P28290	1259 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	ERCC3	P19447	782 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	HS6ST3	Q8IZP7	471 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	KLHL42	Q9P2K6	505 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	TRAK2	O60296	914 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	CREB3	O43889	395 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	P3H3	Q8IVL6	736 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	ATL2	Q8NHH9	583 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	CXorf38	Q8TB03	319 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	ERBB3	P21860	1342 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	PPFIA4	O75335	1185 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	DRC1	Q96MC2	740 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CNOT2-231	ENST00000551483	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CNOT2-231	ENST00000551483	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT2-231	ENST00000551483	TMEM51	Q9NW97	253 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT2-231	ENST00000551483	KCNA1	Q09470	495 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT2-231	ENST00000551483	TAF3	Q5VWG9	929 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT2-231	ENST00000551483	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CNOT2-231	ENST00000551483	PSEN1	P49768	467 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT2-231	ENST00000551483	RHBDL3	P58872	404 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT2-231	ENST00000551483	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT2-231	ENST00000551483	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CNOT2-231	ENST00000551483	IRF6	O14896	467 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT2-231	ENST00000551483	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT2-231	ENST00000551483	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT2-231	ENST00000551483	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CNOT2-231	ENST00000551483	SCP2	P22307	547 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CNOT2-231	ENST00000551483	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CNOT2-231	ENST00000551483	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CNOT2-231	ENST00000551483	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62

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