RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551155.1

CS-224, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-224ENST00000551155 KIF3BO15066 747 aa14.23□□□□□ -0.13
CS-224ENST00000551155 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa14.23□□□□□ -0.13
CS-224ENST00000551155 ADGRL2O95490 1459 aa14.23□□□□□ -0.13
CS-224ENST00000551155 NCOA1Q15788 1441 aa14.23□□□□□ -0.13
CS-224ENST00000551155 GGT6Q6P531 493 aa14.22□□□□□ -0.13
CS-224ENST00000551155 PTPRMP28827 1452 aa14.22□□□□□ -0.13
CS-224ENST00000551155 CNTLNQ9NXG0 1405 aa14.21□□□□□ -0.13
CS-224ENST00000551155 ITGAEP38570 1179 aa14.2□□□□□ -0.14
CS-224ENST00000551155 ERBINQ96RT1 1412 aa14.2□□□□□ -0.14
CS-224ENST00000551155 ROCK1Q13464 1354 aa14.2□□□□□ -0.14
CS-224ENST00000551155 MROH2AA6NES4 1674 aa14.2□□□□□ -0.14
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CS-224ENST00000551155 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
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CS-224ENST00000551155 PTPRKQ15262 1439 aa14.17□□□□□ -0.14
CS-224ENST00000551155 C3P01024 1663 aa14.16□□□□□ -0.14
CS-224ENST00000551155 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
CS-224ENST00000551155 KDM5DQ9BY66 1539 aa14.15□□□□□ -0.14
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CS-224ENST00000551155 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa14.14□□□□□ -0.15
CS-224ENST00000551155 ZMYM3Q14202 1370 aa14.13□□□□□ -0.15
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CS-224ENST00000551155 KANK1Q14678 1352 aa14.12□□□□□ -0.15
CS-224ENST00000551155 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
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CS-224ENST00000551155 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
CS-224ENST00000551155 MROH1Q8NDA8 1641 aa14.11□□□□□ -0.15
CS-224ENST00000551155 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP14.09□□□□□ -0.156e-9■□□□□ 10
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CS-224ENST00000551155 GCC2Q8IWJ2 1684 aa14.08□□□□□ -0.16
CS-224ENST00000551155 PREX1Q8TCU6 1659 aa14.08□□□□□ -0.16
CS-224ENST00000551155 ABCC3O15438 1527 aa14.08□□□□□ -0.16
CS-224ENST00000551155 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-224ENST00000551155 UNC13BO14795 1591 aa14.06□□□□□ -0.16
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CS-224ENST00000551155 NAIPQ13075 1403 aa14.06□□□□□ -0.16
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CS-224ENST00000551155 VWDEQ8N2E2 1590 aa14.05□□□□□ -0.16
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CS-224ENST00000551155 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa14.04□□□□□ -0.16
CS-224ENST00000551155 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa14.03□□□□□ -0.16
CS-224ENST00000551155 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP14.02□□□□□ -0.16
CS-224ENST00000551155 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP14.02□□□□□ -0.17
CS-224ENST00000551155 IQGAP3Q86VI3 1631 aa14.01□□□□□ -0.17
CS-224ENST00000551155 LMTK3Q96Q04 1460 aa14.01□□□□□ -0.17
CS-224ENST00000551155 TET3O43151 1660 aa14.01□□□□□ -0.17
CS-224ENST00000551155 NUP155O75694 1391 aa14□□□□□ -0.17
CS-224ENST00000551155 EFCAB6Q5THR3 1501 aa14□□□□□ -0.17
CS-224ENST00000551155 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
CS-224ENST00000551155 MYO3AQ8NEV4 1616 aa13.99□□□□□ -0.17
CS-224ENST00000551155 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa13.99□□□□□ -0.17
CS-224ENST00000551155 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
CS-224ENST00000551155 TNRQ92752 1358 aa13.98□□□□□ -0.17
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CS-224ENST00000551155 ERVK-7P63135 1459 aa13.97□□□□□ -0.17
CS-224ENST00000551155 NLRP1Q9C000 1473 aa13.97□□□□□ -0.17
CS-224ENST00000551155 TRIM52Q96A61 297 aa13.96□□□□□ -0.17
CS-224ENST00000551155 SETD5Q9C0A6 1442 aa13.96□□□□□ -0.18
CS-224ENST00000551155 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.18
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CS-224ENST00000551155 A2ML1A8K2U0 1454 aa13.94□□□□□ -0.18
CS-224ENST00000551155 HSPA2P54652 639 aa13.93□□□□□ -0.18
CS-224ENST00000551155 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP13.92□□□□□ -0.18
CS-224ENST00000551155 NOS1P29475 1434 aa13.91□□□□□ -0.18
CS-224ENST00000551155 SLC52A1Q9NWF4 448 aa13.91□□□□□ -0.18
CS-224ENST00000551155 UGGT1Q9NYU2 1555 aa13.91□□□□□ -0.18
CS-224ENST00000551155 HRCP23327 699 aa13.9□□□□□ -0.18
CS-224ENST00000551155 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
CS-224ENST00000551155 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
CS-224ENST00000551155 SYNMO15061 1565 aa13.89□□□□□ -0.19
CS-224ENST00000551155 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa13.89□□□□□ -0.19
CS-224ENST00000551155 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa13.88□□□□□ -0.19
CS-224ENST00000551155 UBR1Q8IWV7 1749 aa13.88□□□□□ -0.19
CS-224ENST00000551155 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP13.88□□□□□ -0.19
CS-224ENST00000551155 STAG3Q9UJ98 1225 aa13.88□□□□□ -0.19
CS-224ENST00000551155 DMRT2Q9Y5R5 561 aa13.88□□□□□ -0.19
CS-224ENST00000551155 STRCQ7RTU9 1775 aa13.88□□□□□ -0.19
CS-224ENST00000551155 PLA2R1Q13018 1463 aa13.87□□□□□ -0.19
CS-224ENST00000551155 PIK3C2BO00750 1634 aa13.87□□□□□ -0.19
CS-224ENST00000551155 IDI1Q13907 227 aa13.87□□□□□ -0.19
CS-224ENST00000551155 PKD2Q13563 968 aa13.86□□□□□ -0.19
CS-224ENST00000551155 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP13.85□□□□□ -0.19
CS-224ENST00000551155 MPHOSPH9Q99550 1183 aa13.85□□□□□ -0.19
CS-224ENST00000551155 PTPRTO14522 1441 aa13.84□□□□□ -0.19
CS-224ENST00000551155 ANKLE2Q86XL3 938 aa13.84□□□□□ -0.19
CS-224ENST00000551155 ADGRB3O60242 1522 aa13.83□□□□□ -0.2
CS-224ENST00000551155 KIF1BO60333 1816 aa13.81□□□□□ -0.2
CS-224ENST00000551155 TRPM2O94759 1503 aa13.81□□□□□ -0.2
CS-224ENST00000551155 HDGFP51858 240 aaKnown RBP13.81□□□□□ -0.2
CS-224ENST00000551155 EID1Q9Y6B2 187 aa13.81□□□□□ -0.2
CS-224ENST00000551155 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa13.81□□□□□ -0.2
CS-224ENST00000551155 MYO5BQ9ULV0 1848 aa13.8□□□□□ -0.2
CS-224ENST00000551155 SLIT1O75093 1534 aa13.8□□□□□ -0.2
CS-224ENST00000551155 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa13.8□□□□□ -0.2
CS-224ENST00000551155 CHGAP10645 457 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
CS-224ENST00000551155 TMEM2Q9UHN6 1383 aa13.79□□□□□ -0.2
CS-224ENST00000551155 ARHGAP23Q9P227 1491 aa13.79□□□□□ -0.2
CS-224ENST00000551155 TXNDC2Q86VQ3 553 aa13.78□□□□□ -0.2
CS-224ENST00000551155 CLTCL1P53675 1640 aa13.78□□□□□ -0.2
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