RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
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CS-215ENST00000549143 POGZQ7Z3K3 1410 aa11.85□□□□□ -0.51
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CS-215ENST00000549143 POLR3GLQ9BT43 218 aa11.85□□□□□ -0.51
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CS-215ENST00000549143 PLA2R1Q13018 1463 aa11.84□□□□□ -0.51
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CS-215ENST00000549143 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa11.71□□□□□ -0.54
CS-215ENST00000549143 CCDC7Q96M83 1385 aa11.71□□□□□ -0.54
CS-215ENST00000549143 E9PCH4 1651 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-215ENST00000549143 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
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CS-215ENST00000549143 CFAP70Q5T0N1 1121 aa11.67□□□□□ -0.54
CS-215ENST00000549143 VWDEQ8N2E2 1590 aa11.67□□□□□ -0.54
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CS-215ENST00000549143 RICTORQ6R327 1708 aa11.66□□□□□ -0.54
CS-215ENST00000549143 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
CS-215ENST00000549143 IDI1Q13907 227 aa11.66□□□□□ -0.54
CS-215ENST00000549143 EFCAB6Q5THR3 1501 aa11.65□□□□□ -0.54
CS-215ENST00000549143 STAG3Q9UJ98 1225 aa11.65□□□□□ -0.54
CS-215ENST00000549143 CLTCL1P53675 1640 aa11.64□□□□□ -0.55
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CS-215ENST00000549143 ABCC3O15438 1527 aa11.64□□□□□ -0.55
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CS-215ENST00000549143 CNTLNQ9NXG0 1405 aa11.61□□□□□ -0.55
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CS-215ENST00000549143 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
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CS-215ENST00000549143 STAC3Q96MF2 364 aa11.6□□□□□ -0.55
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CS-215ENST00000549143 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
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CS-215ENST00000549143 CCDC184Q52MB2 194 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-215ENST00000549143 SLC52A1Q9NWF4 448 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-215ENST00000549143 TMF1P82094 1093 aa11.59□□□□□ -0.55
CS-215ENST00000549143 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa11.58□□□□□ -0.55
CS-215ENST00000549143 CCER2I3L3R5 266 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-215ENST00000549143 BCORL1Q5H9F3 1711 aa11.58□□□□□ -0.56
CS-215ENST00000549143 DISP3Q9P2K9 1392 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-215ENST00000549143 VGFO15240 615 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
CS-215ENST00000549143 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa11.57□□□□□ -0.56
CS-215ENST00000549143 MRS2Q9HD23 443 aa11.56□□□□□ -0.56
CS-215ENST00000549143 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
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