RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547912.1

CS-210, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 674 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-210ENST00000547912 PTPN23Q9H3S7 1636 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-210ENST00000547912 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CS-210ENST00000547912 TSPY4P0CV99 314 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-210ENST00000547912 TSPY10P0CW01 314 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-210ENST00000547912 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP8.31□□□□□ -1.08
CS-210ENST00000547912 KDM5CP41229 1560 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-210ENST00000547912 ARHGEF5Q12774 1597 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-210ENST00000547912 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-210ENST00000547912 HECW2Q9P2P5 1572 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-210ENST00000547912 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CS-210ENST00000547912 CCDC141Q6ZP82 1450 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-210ENST00000547912 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CS-210ENST00000547912 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-210ENST00000547912 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CS-210ENST00000547912 AFAP1Q8N556 730 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-210ENST00000547912 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CS-210ENST00000547912 MLH3Q9UHC1 1453 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-210ENST00000547912 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-210ENST00000547912 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CS-210ENST00000547912 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
CS-210ENST00000547912 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-210ENST00000547912 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-210ENST00000547912 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-210ENST00000547912 MBD5Q9P267 1494 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-210ENST00000547912 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP8.27□□□□□ -1.09
CS-210ENST00000547912 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
CS-210ENST00000547912 ATP7AQ04656 1500 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-210ENST00000547912 CROCC2H7BZ55 1655 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-210ENST00000547912 C9orf84Q5VXU9 1444 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-210ENST00000547912 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CS-210ENST00000547912 MAST1Q9Y2H9 1570 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-210ENST00000547912 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CS-210ENST00000547912 ATP10AO60312 1499 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-210ENST00000547912 SHANK2Q9UPX8 1470 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-210ENST00000547912 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-210ENST00000547912 ADGBQ8N7X0 1667 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-210ENST00000547912 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CS-210ENST00000547912 LHX8Q68G74 356 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-210ENST00000547912 ZRANB1Q9UGI0 708 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-210ENST00000547912 DAPK1P53355 1430 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-210ENST00000547912 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CS-210ENST00000547912 REREQ9P2R6 1566 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-210ENST00000547912 YEATS2Q9ULM3 1422 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-210ENST00000547912 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-210ENST00000547912 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-210ENST00000547912 ABCC5O15440 1437 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-210ENST00000547912 ABCA6Q8N139 1617 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-210ENST00000547912 PLXNC1O60486 1568 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-210ENST00000547912 A2MP01023 1474 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-210ENST00000547912 PROM2Q8N271 834 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-210ENST00000547912 DCBLD2Q96PD2 775 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-210ENST00000547912 AGLP35573 1532 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-210ENST00000547912 ITGAEP38570 1179 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-210ENST00000547912 DUOX2Q9NRD8 1548 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-210ENST00000547912 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
CS-210ENST00000547912 CHIC2Q9UKJ5 165 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-210ENST00000547912 ROCK1Q13464 1354 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-210ENST00000547912 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
CS-210ENST00000547912 KIF15Q9NS87 1388 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-210ENST00000547912 ADGRL2O95490 1459 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-210ENST00000547912 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-210ENST00000547912 POTEIP0CG38 1075 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-210ENST00000547912 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-210ENST00000547912 ERBINQ96RT1 1412 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-210ENST00000547912 BCORL1Q5H9F3 1711 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-210ENST00000547912 NCOA1Q15788 1441 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-210ENST00000547912 KIF3BO15066 747 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-210ENST00000547912 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
CS-210ENST00000547912 MLECQ14165 292 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-210ENST00000547912 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-210ENST00000547912 GGT6Q6P531 493 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-210ENST00000547912 CNTLNQ9NXG0 1405 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-210ENST00000547912 FAM135AQ9P2D6 1515 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-210ENST00000547912 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
CS-210ENST00000547912 ADAMTSL3P82987 1691 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-210ENST00000547912 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-210ENST00000547912 KANK1Q14678 1352 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-210ENST00000547912 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa8.15□□□□□ -1.11
CS-210ENST00000547912 PTPRKQ15262 1439 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-210ENST00000547912 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
CS-210ENST00000547912 GCC2Q8IWJ2 1684 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-210ENST00000547912 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
CS-210ENST00000547912 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-210ENST00000547912 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
CS-210ENST00000547912 MADDQ8WXG6 1647 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-210ENST00000547912 KDM5DQ9BY66 1539 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-210ENST00000547912 HFM1A2PYH4 1435 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-210ENST00000547912 MROH2AA6NES4 1674 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-210ENST00000547912 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-210ENST00000547912 PLEKHG5O94827 1062 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-210ENST00000547912 DEPDC5O75140 1603 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-210ENST00000547912 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
CS-210ENST00000547912 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
CS-210ENST00000547912 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
CS-210ENST00000547912 NAIPQ13075 1403 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-210ENST00000547912 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
CS-210ENST00000547912 PTPRMP28827 1452 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-210ENST00000547912 UNC13BO14795 1591 aa8.1□□□□□ -1.11
CS-210ENST00000547912 CEP152O94986 1710 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-210ENST00000547912 ZMYM3Q14202 1370 aa8.09□□□□□ -1.12
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