RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545663.5

CLSTN3-216, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 533 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-216ENST00000545663 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
CLSTN3-216ENST00000545663 STRCP1A6NGW2 1772 aa25.67■■□□□ 1.7
CLSTN3-216ENST00000545663 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
CLSTN3-216ENST00000545663 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
CLSTN3-216ENST00000545663 MED14O60244 1454 aa25.64■■□□□ 1.69
CLSTN3-216ENST00000545663 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
CLSTN3-216ENST00000545663 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
CLSTN3-216ENST00000545663 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.58■■□□□ 1.69
CLSTN3-216ENST00000545663 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
CLSTN3-216ENST00000545663 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
CLSTN3-216ENST00000545663 DEPDC5O75140 1603 aa25.56■■□□□ 1.68
CLSTN3-216ENST00000545663 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa25.56■■□□□ 1.68
CLSTN3-216ENST00000545663 MIA2Q96PC5 1412 aa25.55■■□□□ 1.68
CLSTN3-216ENST00000545663 IQGAP1P46940 1657 aa25.55■■□□□ 1.68
CLSTN3-216ENST00000545663 PZPP20742 1482 aa25.55■■□□□ 1.68
CLSTN3-216ENST00000545663 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.55■■□□□ 1.68
CLSTN3-216ENST00000545663 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.55■■□□□ 1.68
CLSTN3-216ENST00000545663 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.54■■□□□ 1.68
CLSTN3-216ENST00000545663 KIF3BO15066 747 aa25.53■■□□□ 1.68
CLSTN3-216ENST00000545663 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
CLSTN3-216ENST00000545663 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.53■■□□□ 1.68
CLSTN3-216ENST00000545663 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.52■■□□□ 1.68
CLSTN3-216ENST00000545663 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
CLSTN3-216ENST00000545663 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.5■■□□□ 1.67
CLSTN3-216ENST00000545663 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.5■■□□□ 1.67
CLSTN3-216ENST00000545663 SYNMO15061 1565 aa25.49■■□□□ 1.67
CLSTN3-216ENST00000545663 NLRP1Q9C000 1473 aa25.49■■□□□ 1.67
CLSTN3-216ENST00000545663 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP25.45■■□□□ 1.66
CLSTN3-216ENST00000545663 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.45■■□□□ 1.66
CLSTN3-216ENST00000545663 FAM135BQ49AJ0 1406 aa25.44■■□□□ 1.66
CLSTN3-216ENST00000545663 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.44■■□□□ 1.66
CLSTN3-216ENST00000545663 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
CLSTN3-216ENST00000545663 MBD5Q9P267 1494 aa25.4■■□□□ 1.66
CLSTN3-216ENST00000545663 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.4■■□□□ 1.66
CLSTN3-216ENST00000545663 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
CLSTN3-216ENST00000545663 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.37■■□□□ 1.65
CLSTN3-216ENST00000545663 LTKP29376 864 aa25.37■■□□□ 1.65
CLSTN3-216ENST00000545663 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
CLSTN3-216ENST00000545663 TRIM52Q96A61 297 aa25.32■■□□□ 1.64
CLSTN3-216ENST00000545663 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.32■■□□□ 1.64
CLSTN3-216ENST00000545663 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.31■■□□□ 1.64
CLSTN3-216ENST00000545663 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa25.3■■□□□ 1.64
CLSTN3-216ENST00000545663 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
CLSTN3-216ENST00000545663 TMEM94Q12767 1356 aa25.3■■□□□ 1.64
CLSTN3-216ENST00000545663 NCOA2Q15596 1464 aa25.26■■□□□ 1.63
CLSTN3-216ENST00000545663 ERVK-7P63135 1459 aa25.24■■□□□ 1.63
CLSTN3-216ENST00000545663 UBR1Q8IWV7 1749 aa25.23■■□□□ 1.63
CLSTN3-216ENST00000545663 TIAM1Q13009 1591 aa25.22■■□□□ 1.63
CLSTN3-216ENST00000545663 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.22■■□□□ 1.63
CLSTN3-216ENST00000545663 ABCC3O15438 1527 aa25.21■■□□□ 1.63
CLSTN3-216ENST00000545663 JCADQ9P266 1359 aa25.2■■□□□ 1.63
CLSTN3-216ENST00000545663 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
CLSTN3-216ENST00000545663 ARHGAP23Q9P227 1491 aa25.2■■□□□ 1.62
CLSTN3-216ENST00000545663 MAP3K1Q13233 1512 aa25.18■■□□□ 1.62
CLSTN3-216ENST00000545663 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.17■■□□□ 1.62
CLSTN3-216ENST00000545663 LRP6O75581 1613 aa25.17■■□□□ 1.62
CLSTN3-216ENST00000545663 SLIT1O75093 1534 aa25.17■■□□□ 1.62
CLSTN3-216ENST00000545663 KCNA6P17658 529 aa25.16■■□□□ 1.62
CLSTN3-216ENST00000545663 SLAIN2Q9P270 581 aa25.16■■□□□ 1.62
CLSTN3-216ENST00000545663 EID1Q9Y6B2 187 aa25.16■■□□□ 1.62
CLSTN3-216ENST00000545663 PHLPP1O60346 1717 aa25.15■■□□□ 1.62
CLSTN3-216ENST00000545663 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
CLSTN3-216ENST00000545663 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
CLSTN3-216ENST00000545663 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
CLSTN3-216ENST00000545663 SLC26A8Q96RN1 970 aa25.14■■□□□ 1.62
CLSTN3-216ENST00000545663 RXRBP28702 533 aa25.11■■□□□ 1.61
CLSTN3-216ENST00000545663 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.1■■□□□ 1.61
CLSTN3-216ENST00000545663 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.09■■□□□ 1.61
CLSTN3-216ENST00000545663 TMEM2Q9UHN6 1383 aa25.07■■□□□ 1.6
CLSTN3-216ENST00000545663 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.07■■□□□ 1.6
CLSTN3-216ENST00000545663 TSPY4P0CV99 314 aa25.06■■□□□ 1.6
CLSTN3-216ENST00000545663 TSPY10P0CW01 314 aa25.06■■□□□ 1.6
CLSTN3-216ENST00000545663 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
CLSTN3-216ENST00000545663 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
CLSTN3-216ENST00000545663 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa25.05■■□□□ 1.6
CLSTN3-216ENST00000545663 MSH6P52701 1360 aa25.05■■□□□ 1.6
CLSTN3-216ENST00000545663 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.03■■□□□ 1.6
CLSTN3-216ENST00000545663 CEP152O94986 1710 aa25.02■■□□□ 1.6
CLSTN3-216ENST00000545663 CEP162Q5TB80 1403 aa25.02■■□□□ 1.6
CLSTN3-216ENST00000545663 TET3O43151 1660 aa25.01■■□□□ 1.59
CLSTN3-216ENST00000545663 STAG3Q9UJ98 1225 aa25■■□□□ 1.59
CLSTN3-216ENST00000545663 PIK3C2BO00750 1634 aa24.99■■□□□ 1.59
CLSTN3-216ENST00000545663 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.99■■□□□ 1.59
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CLSTN3-216ENST00000545663 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
CLSTN3-216ENST00000545663 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
CLSTN3-216ENST00000545663 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.96■■□□□ 1.59
CLSTN3-216ENST00000545663 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
CLSTN3-216ENST00000545663 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
CLSTN3-216ENST00000545663 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.94■■□□□ 1.58
CLSTN3-216ENST00000545663 IDI1Q13907 227 aa24.94■■□□□ 1.58
CLSTN3-216ENST00000545663 AFF2P51816 1311 aa24.93■■□□□ 1.58
CLSTN3-216ENST00000545663 BCANQ96GW7 911 aa24.93■■□□□ 1.58
CLSTN3-216ENST00000545663 NWD1Q149M9 1564 aa24.93■■□□□ 1.58
CLSTN3-216ENST00000545663 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa24.91■■□□□ 1.58
CLSTN3-216ENST00000545663 RGS12O14924 1447 aa24.9■■□□□ 1.58
CLSTN3-216ENST00000545663 EFCAB6Q5THR3 1501 aa24.9■■□□□ 1.58
CLSTN3-216ENST00000545663 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
CLSTN3-216ENST00000545663 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
CLSTN3-216ENST00000545663 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.87■■□□□ 1.57
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