RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534967.1

GOLGA3-204, Transcript of golgin A3, humanhuman

TSL 3

Gene GOLGA3, Length 484 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3-204ENST00000534967 CCDC141Q6ZP82 1450 aa42.34■■■■■ 4.37
GOLGA3-204ENST00000534967 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP42.31■■■■■ 4.36
GOLGA3-204ENST00000534967 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa42.3■■■■■ 4.36
GOLGA3-204ENST00000534967 NCOA2Q15596 1464 aa42.3■■■■■ 4.36
GOLGA3-204ENST00000534967 TNRQ92752 1358 aa42.28■■■■■ 4.36
GOLGA3-204ENST00000534967 KDM5DQ9BY66 1539 aa42.26■■■■■ 4.36
GOLGA3-204ENST00000534967 PZPP20742 1482 aa42.24■■■■■ 4.35
GOLGA3-204ENST00000534967 RSPH4AQ5TD94 716 aa42.21■■■■■ 4.35
GOLGA3-204ENST00000534967 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa42.2■■■■■ 4.35
GOLGA3-204ENST00000534967 FAM135AQ9P2D6 1515 aa42.2■■■■■ 4.35
GOLGA3-204ENST00000534967 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP42.19■■■■■ 4.34
GOLGA3-204ENST00000534967 NEURL4Q96JN8 1562 aa42.18■■■■■ 4.34
GOLGA3-204ENST00000534967 ARHGEF5Q12774 1597 aa42.13■■■■■ 4.33
GOLGA3-204ENST00000534967 TSPY4P0CV99 314 aa42.1■■■■■ 4.33
GOLGA3-204ENST00000534967 TSPY10P0CW01 314 aa42.1■■■■■ 4.33
GOLGA3-204ENST00000534967 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP42.1■■■■■ 4.332e-6■■□□□ 13.2
GOLGA3-204ENST00000534967 MIA2Q96PC5 1412 aa42.09■■■■■ 4.33
GOLGA3-204ENST00000534967 CPS1P31327 1500 aa42.07■■■■■ 4.33
GOLGA3-204ENST00000534967 SHANK2Q9UPX8 1470 aa42.07■■■■■ 4.33
GOLGA3-204ENST00000534967 ANKLE2Q86XL3 938 aa42.06■■■■■ 4.32
GOLGA3-204ENST00000534967 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP42.05■■■■■ 4.32
GOLGA3-204ENST00000534967 NLRP1Q9C000 1473 aa42.04■■■■■ 4.32
GOLGA3-204ENST00000534967 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP42.04■■■■■ 4.32
GOLGA3-204ENST00000534967 UGGT1Q9NYU2 1555 aa42.02■■■■■ 4.32
GOLGA3-204ENST00000534967 PIP4K2BP78356 416 aa42.02■■■■■ 4.32
GOLGA3-204ENST00000534967 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa41.98■■■■■ 4.31
GOLGA3-204ENST00000534967 TOM1O60784 492 aa41.97■■■■■ 4.31
GOLGA3-204ENST00000534967 HSPA1LP34931 641 aa41.97■■■■■ 4.31
GOLGA3-204ENST00000534967 VWDEQ8N2E2 1590 aa41.97■■■■■ 4.31
GOLGA3-204ENST00000534967 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP41.96■■■■■ 4.31
GOLGA3-204ENST00000534967 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP41.96■■■■■ 4.31
GOLGA3-204ENST00000534967 ABCC3O15438 1527 aa41.94■■■■■ 4.3
GOLGA3-204ENST00000534967 MAST1Q9Y2H9 1570 aa41.93■■■■■ 4.3
GOLGA3-204ENST00000534967 MED14O60244 1454 aa41.93■■■■■ 4.3
GOLGA3-204ENST00000534967 DEPDC5O75140 1603 aa41.93■■■■■ 4.3
GOLGA3-204ENST00000534967 VPS8Q8N3P4 1428 aa41.93■■■■■ 4.3
GOLGA3-204ENST00000534967 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP41.88■■■■■ 4.29
GOLGA3-204ENST00000534967 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP41.85■■■■■ 4.29
GOLGA3-204ENST00000534967 IQGAP1P46940 1657 aa41.85■■■■■ 4.29
GOLGA3-204ENST00000534967 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP41.84■■■■■ 4.29
GOLGA3-204ENST00000534967 ERVK-7P63135 1459 aa41.84■■■■■ 4.29
GOLGA3-204ENST00000534967 MROH1Q8NDA8 1641 aa41.82■■■■■ 4.29
GOLGA3-204ENST00000534967 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP41.81■■■■■ 4.28
GOLGA3-204ENST00000534967 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.79■■■■■ 4.28
GOLGA3-204ENST00000534967 MYOM3Q5VTT5 1437 aa41.78■■■■■ 4.28
GOLGA3-204ENST00000534967 ALKQ9UM73 1620 aa41.77■■■■■ 4.28
GOLGA3-204ENST00000534967 CEP152O94986 1710 aa41.77■■■■■ 4.28
GOLGA3-204ENST00000534967 MAP3K1Q13233 1512 aa41.74■■■■■ 4.27
GOLGA3-204ENST00000534967 STRCP1A6NGW2 1772 aa41.73■■■■■ 4.27
GOLGA3-204ENST00000534967 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP41.71■■■■■ 4.27
GOLGA3-204ENST00000534967 DUOX2Q9NRD8 1548 aa41.71■■■■■ 4.27
GOLGA3-204ENST00000534967 LRRC7Q96NW7 1537 aa41.69■■■■■ 4.27
GOLGA3-204ENST00000534967 UBR1Q8IWV7 1749 aa41.69■■■■■ 4.26
GOLGA3-204ENST00000534967 SYNMO15061 1565 aa41.63■■■■■ 4.25
GOLGA3-204ENST00000534967 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP41.62■■■■■ 4.25
GOLGA3-204ENST00000534967 KIF15Q9NS87 1388 aa41.62■■■■■ 4.25
GOLGA3-204ENST00000534967 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP41.61■■■■■ 4.25
GOLGA3-204ENST00000534967 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP41.59■■■■■ 4.25
GOLGA3-204ENST00000534967 LTKP29376 864 aa41.57■■■■■ 4.25
GOLGA3-204ENST00000534967 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa41.57■■■■■ 4.25
GOLGA3-204ENST00000534967 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa41.57■■■■■ 4.25
GOLGA3-204ENST00000534967 ARHGAP23Q9P227 1491 aa41.56■■■■■ 4.24
GOLGA3-204ENST00000534967 ABCC5O15440 1437 aa41.56■■■■■ 4.24
GOLGA3-204ENST00000534967 ERBINQ96RT1 1412 aa41.55■■■■■ 4.24
GOLGA3-204ENST00000534967 TXNDC2Q86VQ3 553 aa41.55■■■■■ 4.24
GOLGA3-204ENST00000534967 CROCC2H7BZ55 1655 aa41.55■■■■■ 4.24
GOLGA3-204ENST00000534967 SLIT1O75093 1534 aa41.54■■■■■ 4.24
GOLGA3-204ENST00000534967 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP41.53■■■■■ 4.24
GOLGA3-204ENST00000534967 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP41.52■■■■■ 4.24
GOLGA3-204ENST00000534967 PTPN23Q9H3S7 1636 aa41.51■■■■■ 4.23
GOLGA3-204ENST00000534967 PIK3C2BO00750 1634 aa41.45■■■■■ 4.23
GOLGA3-204ENST00000534967 EID1Q9Y6B2 187 aa41.45■■■■■ 4.23
GOLGA3-204ENST00000534967 DAPK1P53355 1430 aa41.44■■■■■ 4.23
GOLGA3-204ENST00000534967 KANK1Q14678 1352 aa41.41■■■■■ 4.22
GOLGA3-204ENST00000534967 TMEM2Q9UHN6 1383 aa41.39■■■■■ 4.22
GOLGA3-204ENST00000534967 APLP2Q06481 763 aa41.38■■■■■ 4.21
GOLGA3-204ENST00000534967 STAG3Q9UJ98 1225 aa41.38■■■■■ 4.21
GOLGA3-204ENST00000534967 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP41.38■■■■■ 4.21
GOLGA3-204ENST00000534967 FGD6Q6ZV73 1430 aa41.35■■■■■ 4.21
GOLGA3-204ENST00000534967 CHIC2Q9UKJ5 165 aa41.35■■■■■ 4.21
GOLGA3-204ENST00000534967 IDI1Q13907 227 aa41.31■■■■■ 4.2
GOLGA3-204ENST00000534967 EFCAB6Q5THR3 1501 aa41.31■■■■■ 4.2
GOLGA3-204ENST00000534967 LMTK2Q8IWU2 1503 aa41.31■■■■■ 4.2
GOLGA3-204ENST00000534967 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa41.31■■■■■ 4.2
GOLGA3-204ENST00000534967 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP41.26■■■■■ 4.2
GOLGA3-204ENST00000534967 TMEM94Q12767 1356 aa41.23■■■■■ 4.19
GOLGA3-204ENST00000534967 SLC26A8Q96RN1 970 aa41.21■■■■■ 4.19
GOLGA3-204ENST00000534967 NOS1P29475 1434 aa41.19■■■■■ 4.18
GOLGA3-204ENST00000534967 KCNA6P17658 529 aa41.19■■■■■ 4.18
GOLGA3-204ENST00000534967 FAM135BQ49AJ0 1406 aa41.18■■■■■ 4.18
GOLGA3-204ENST00000534967 TET3O43151 1660 aa41.18■■■■■ 4.18
GOLGA3-204ENST00000534967 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP41.16■■■■■ 4.18
GOLGA3-204ENST00000534967 ADGRB3O60242 1522 aa41.16■■■■■ 4.18
GOLGA3-204ENST00000534967 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP41.14■■■■■ 4.18
GOLGA3-204ENST00000534967 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP41.13■■■■■ 4.17
GOLGA3-204ENST00000534967 ADGRL2O95490 1459 aa41.1■■■■■ 4.17
GOLGA3-204ENST00000534967 SLC52A1Q9NWF4 448 aa41.09■■■■■ 4.17
GOLGA3-204ENST00000534967 BCANQ96GW7 911 aa41.06■■■■■ 4.16
GOLGA3-204ENST00000534967 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa41.06■■■■■ 4.16
GOLGA3-204ENST00000534967 NWD1Q149M9 1564 aa41.04■■■■■ 4.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 476.1 ms