RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532127.5

PUF60-219, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, human

TSL 2

Gene PUF60, Length 604 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUF60-219	ENST00000532127	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	29.14	■■■□□ 2.25
PUF60-219	ENST00000532127	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	29.13	■■■□□ 2.25
PUF60-219	ENST00000532127	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	29.12	■■■□□ 2.25
PUF60-219	ENST00000532127	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		29.1	■■■□□ 2.25
PUF60-219	ENST00000532127	HRC	P23327	699 aa		29.1	■■■□□ 2.25
PUF60-219	ENST00000532127	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		29.06	■■■□□ 2.24
PUF60-219	ENST00000532127	GGT6	Q6P531	493 aa		29.05	■■■□□ 2.24
PUF60-219	ENST00000532127	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		29.04	■■■□□ 2.24
PUF60-219	ENST00000532127	KANK1	Q14678	1352 aa		29.04	■■■□□ 2.24
PUF60-219	ENST00000532127	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		29.03	■■■□□ 2.24
PUF60-219	ENST00000532127	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		29.03	■■■□□ 2.24
PUF60-219	ENST00000532127	MLEC	Q14165	292 aa		29.02	■■■□□ 2.24
PUF60-219	ENST00000532127	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		29.02	■■■□□ 2.24
PUF60-219	ENST00000532127	NUP155	O75694	1391 aa		29.01	■■■□□ 2.24
PUF60-219	ENST00000532127	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	29.01	■■■□□ 2.23	7e-7	■□□□□ 9.1
PUF60-219	ENST00000532127	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	29.01	■■■□□ 2.23
PUF60-219	ENST00000532127	TRIM52	Q96A61	297 aa		28.99	■■■□□ 2.23
PUF60-219	ENST00000532127	ABCC3	O15438	1527 aa		28.98	■■■□□ 2.23
PUF60-219	ENST00000532127	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		28.96	■■■□□ 2.23
PUF60-219	ENST00000532127	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		28.94	■■■□□ 2.22
PUF60-219	ENST00000532127	CEP152	O94986	1710 aa		28.94	■■■□□ 2.22
PUF60-219	ENST00000532127	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		28.94	■■■□□ 2.22
PUF60-219	ENST00000532127	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		28.94	■■■□□ 2.22
PUF60-219	ENST00000532127	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		28.94	■■■□□ 2.22
PUF60-219	ENST00000532127	PZP	P20742	1482 aa		28.93	■■■□□ 2.22
PUF60-219	ENST00000532127	TET3	O43151	1660 aa		28.92	■■■□□ 2.22
PUF60-219	ENST00000532127	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	28.91	■■■□□ 2.22
PUF60-219	ENST00000532127	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	28.91	■■■□□ 2.22
PUF60-219	ENST00000532127	MADD	Q8WXG6	1647 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PUF60-219	ENST00000532127	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		28.89	■■■□□ 2.22
PUF60-219	ENST00000532127	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		28.89	■■■□□ 2.21
PUF60-219	ENST00000532127	MROH2A	A6NES4	1674 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PUF60-219	ENST00000532127	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	28.86	■■■□□ 2.21
PUF60-219	ENST00000532127	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PUF60-219	ENST00000532127	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PUF60-219	ENST00000532127	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
PUF60-219	ENST00000532127	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	28.8	■■■□□ 2.2
PUF60-219	ENST00000532127		E9PCH4	1651 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PUF60-219	ENST00000532127	NPAT	Q14207	1427 aa		28.78	■■■□□ 2.2
PUF60-219	ENST00000532127	ZMYM3	Q14202	1370 aa		28.78	■■■□□ 2.2
PUF60-219	ENST00000532127	PKD2	Q13563	968 aa		28.77	■■■□□ 2.2
PUF60-219	ENST00000532127	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	28.76	■■■□□ 2.2
PUF60-219	ENST00000532127	C3	P01024	1663 aa		28.75	■■■□□ 2.19
PUF60-219	ENST00000532127	PTPRM	P28827	1452 aa		28.71	■■■□□ 2.19
PUF60-219	ENST00000532127	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		28.7	■■■□□ 2.18
PUF60-219	ENST00000532127	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		28.7	■■■□□ 2.18
PUF60-219	ENST00000532127	ERVK-7	P63135	1459 aa		28.69	■■■□□ 2.18
PUF60-219	ENST00000532127	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		28.68	■■■□□ 2.18
PUF60-219	ENST00000532127	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		28.67	■■■□□ 2.18
PUF60-219	ENST00000532127	FOXD1	Q16676	465 aa		28.66	■■■□□ 2.18
PUF60-219	ENST00000532127	PTPRT	O14522	1441 aa		28.66	■■■□□ 2.18
PUF60-219	ENST00000532127	NOS1	P29475	1434 aa		28.66	■■■□□ 2.18
PUF60-219	ENST00000532127	TRPM2	O94759	1503 aa		28.64	■■■□□ 2.18
PUF60-219	ENST00000532127	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	28.63	■■■□□ 2.17
PUF60-219	ENST00000532127	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	28.63	■■■□□ 2.17
PUF60-219	ENST00000532127	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	28.62	■■■□□ 2.17
PUF60-219	ENST00000532127	PLA2R1	Q13018	1463 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PUF60-219	ENST00000532127	SYNM	O15061	1565 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PUF60-219	ENST00000532127	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PUF60-219	ENST00000532127	TNR	Q92752	1358 aa		28.58	■■■□□ 2.17
PUF60-219	ENST00000532127	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		28.57	■■■□□ 2.16
PUF60-219	ENST00000532127	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	28.56	■■■□□ 2.16
PUF60-219	ENST00000532127	PIK3C2B	O00750	1634 aa		28.54	■■■□□ 2.16
PUF60-219	ENST00000532127	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		28.54	■■■□□ 2.16
PUF60-219	ENST00000532127	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		28.54	■■■□□ 2.16
PUF60-219	ENST00000532127	CLTCL1	P53675	1640 aa		28.52	■■■□□ 2.16
PUF60-219	ENST00000532127	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		28.52	■■■□□ 2.16
PUF60-219	ENST00000532127	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		28.51	■■■□□ 2.15
PUF60-219	ENST00000532127	NLRP1	Q9C000	1473 aa		28.51	■■■□□ 2.15
PUF60-219	ENST00000532127	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		28.5	■■■□□ 2.15
PUF60-219	ENST00000532127	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	28.5	■■■□□ 2.15
PUF60-219	ENST00000532127	IDI1	Q13907	227 aa		28.44	■■■□□ 2.14
PUF60-219	ENST00000532127	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	28.42	■■■□□ 2.14
PUF60-219	ENST00000532127	KIF1B	O60333	1816 aa		28.42	■■■□□ 2.14
PUF60-219	ENST00000532127	ADGRB3	O60242	1522 aa		28.42	■■■□□ 2.14
PUF60-219	ENST00000532127	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	28.42	■■■□□ 2.14
PUF60-219	ENST00000532127	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	28.41	■■■□□ 2.14
PUF60-219	ENST00000532127	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		28.41	■■■□□ 2.14
PUF60-219	ENST00000532127	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		28.41	■■■□□ 2.14
PUF60-219	ENST00000532127	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		28.4	■■■□□ 2.14
PUF60-219	ENST00000532127	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		28.38	■■■□□ 2.13
PUF60-219	ENST00000532127	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		28.37	■■■□□ 2.13
PUF60-219	ENST00000532127	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		28.36	■■■□□ 2.13
PUF60-219	ENST00000532127	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		28.36	■■■□□ 2.13
PUF60-219	ENST00000532127	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PUF60-219	ENST00000532127	NEUROD1	Q13562	356 aa		28.33	■■■□□ 2.13
PUF60-219	ENST00000532127	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	28.32	■■■□□ 2.12
PUF60-219	ENST00000532127	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		28.31	■■■□□ 2.12
PUF60-219	ENST00000532127	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	28.26	■■■□□ 2.11
PUF60-219	ENST00000532127	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		28.26	■■■□□ 2.11
PUF60-219	ENST00000532127	TONSL	Q96HA7	1378 aa		28.24	■■■□□ 2.11
PUF60-219	ENST00000532127	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	28.24	■■■□□ 2.11
PUF60-219	ENST00000532127	RGL3	Q3MIN7	710 aa		28.23	■■■□□ 2.11
PUF60-219	ENST00000532127	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		28.23	■■■□□ 2.11
PUF60-219	ENST00000532127	SLIT1	O75093	1534 aa		28.23	■■■□□ 2.11
PUF60-219	ENST00000532127	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		28.22	■■■□□ 2.11
PUF60-219	ENST00000532127	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		28.21	■■■□□ 2.11
PUF60-219	ENST00000532127	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		28.21	■■■□□ 2.11
PUF60-219	ENST00000532127	IFT172	Q9UG01	1749 aa		28.21	■■■□□ 2.11
PUF60-219	ENST00000532127	PPL	O60437	1756 aa		28.19	■■■□□ 2.1

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