RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528966.5

LTBP3-211, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene LTBP3, Length 553 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3-211ENST00000528966 VWDEQ8N2E2 1590 aa29.12■■■□□ 2.25
LTBP3-211ENST00000528966 TNRQ92752 1358 aa29.12■■■□□ 2.25
LTBP3-211ENST00000528966 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
LTBP3-211ENST00000528966 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
LTBP3-211ENST00000528966 MBD5Q9P267 1494 aa29.1■■■□□ 2.25
LTBP3-211ENST00000528966 PZPP20742 1482 aa29.07■■■□□ 2.24
LTBP3-211ENST00000528966 TIAM1Q13009 1591 aa29.06■■■□□ 2.24
LTBP3-211ENST00000528966 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
LTBP3-211ENST00000528966 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa29.05■■■□□ 2.24
LTBP3-211ENST00000528966 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.05■■■□□ 2.24
LTBP3-211ENST00000528966 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.04■■■□□ 2.24
LTBP3-211ENST00000528966 KDM5DQ9BY66 1539 aa29.04■■■□□ 2.24
LTBP3-211ENST00000528966 ANKLE2Q86XL3 938 aa29.03■■■□□ 2.24
LTBP3-211ENST00000528966 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
LTBP3-211ENST00000528966 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.02■■■□□ 2.24
LTBP3-211ENST00000528966 MED14O60244 1454 aa29.02■■■□□ 2.24
LTBP3-211ENST00000528966 DEPDC5O75140 1603 aa29.02■■■□□ 2.24
LTBP3-211ENST00000528966 FAM135AQ9P2D6 1515 aa29.01■■■□□ 2.23
LTBP3-211ENST00000528966 KIF3BO15066 747 aa28.99■■■□□ 2.23
LTBP3-211ENST00000528966 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
LTBP3-211ENST00000528966 STRCP1A6NGW2 1772 aa28.98■■■□□ 2.23
LTBP3-211ENST00000528966 UGGT1Q9NYU2 1555 aa28.98■■■□□ 2.23
LTBP3-211ENST00000528966 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
LTBP3-211ENST00000528966 NLRP1Q9C000 1473 aa28.97■■■□□ 2.23
LTBP3-211ENST00000528966 IQGAP1P46940 1657 aa28.96■■■□□ 2.23
LTBP3-211ENST00000528966 MIA2Q96PC5 1412 aa28.96■■■□□ 2.23
LTBP3-211ENST00000528966 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa28.94■■■□□ 2.22
LTBP3-211ENST00000528966 LRRC7Q96NW7 1537 aa28.92■■■□□ 2.22
LTBP3-211ENST00000528966 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.91■■■□□ 2.22
LTBP3-211ENST00000528966 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
LTBP3-211ENST00000528966 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
LTBP3-211ENST00000528966 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.9■■■□□ 2.22
LTBP3-211ENST00000528966 SYNMO15061 1565 aa28.88■■■□□ 2.21
LTBP3-211ENST00000528966 CEP162Q5TB80 1403 aa28.87■■■□□ 2.21
LTBP3-211ENST00000528966 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa28.84■■■□□ 2.21
LTBP3-211ENST00000528966 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
LTBP3-211ENST00000528966 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
LTBP3-211ENST00000528966 ABCC3O15438 1527 aa28.77■■■□□ 2.2
LTBP3-211ENST00000528966 RSPH4AQ5TD94 716 aa28.75■■■□□ 2.19
LTBP3-211ENST00000528966 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
LTBP3-211ENST00000528966 ARHGEF5Q12774 1597 aa28.75■■■□□ 2.19
LTBP3-211ENST00000528966 ERVK-7P63135 1459 aa28.74■■■□□ 2.19
LTBP3-211ENST00000528966 NCOA2Q15596 1464 aa28.74■■■□□ 2.19
LTBP3-211ENST00000528966 UBR1Q8IWV7 1749 aa28.74■■■□□ 2.19
LTBP3-211ENST00000528966 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
LTBP3-211ENST00000528966 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
LTBP3-211ENST00000528966 MROH1Q8NDA8 1641 aa28.69■■■□□ 2.18
LTBP3-211ENST00000528966 CEP152O94986 1710 aa28.66■■■□□ 2.18
LTBP3-211ENST00000528966 TSPY4P0CV99 314 aa28.65■■■□□ 2.18
LTBP3-211ENST00000528966 TSPY10P0CW01 314 aa28.65■■■□□ 2.18
LTBP3-211ENST00000528966 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
LTBP3-211ENST00000528966 LTKP29376 864 aa28.64■■■□□ 2.18
LTBP3-211ENST00000528966 ARHGAP23Q9P227 1491 aa28.64■■■□□ 2.17
LTBP3-211ENST00000528966 SLIT1O75093 1534 aa28.63■■■□□ 2.17
LTBP3-211ENST00000528966 MAST1Q9Y2H9 1570 aa28.62■■■□□ 2.17
LTBP3-211ENST00000528966 POTEAQ6S8J7 498 aa28.61■■■□□ 2.17
LTBP3-211ENST00000528966 FAM135BQ49AJ0 1406 aa28.6■■■□□ 2.17
LTBP3-211ENST00000528966 TXNDC2Q86VQ3 553 aa28.58■■■□□ 2.17
LTBP3-211ENST00000528966 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa28.51■■■□□ 2.16
LTBP3-211ENST00000528966 PIK3C2BO00750 1634 aa28.5■■■□□ 2.15
LTBP3-211ENST00000528966 TMEM94Q12767 1356 aa28.5■■■□□ 2.15
LTBP3-211ENST00000528966 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa28.49■■■□□ 2.15
LTBP3-211ENST00000528966 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
LTBP3-211ENST00000528966 EID1Q9Y6B2 187 aa28.48■■■□□ 2.15
LTBP3-211ENST00000528966 MAP3K1Q13233 1512 aa28.48■■■□□ 2.15
LTBP3-211ENST00000528966 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
LTBP3-211ENST00000528966 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.46■■■□□ 2.15
LTBP3-211ENST00000528966 TMEM2Q9UHN6 1383 aa28.46■■■□□ 2.15
LTBP3-211ENST00000528966 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.42■■■□□ 2.14
LTBP3-211ENST00000528966 TET3O43151 1660 aa28.4■■■□□ 2.14
LTBP3-211ENST00000528966 KCNA6P17658 529 aa28.4■■■□□ 2.14
LTBP3-211ENST00000528966 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
LTBP3-211ENST00000528966 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
LTBP3-211ENST00000528966 EFCAB6Q5THR3 1501 aa28.38■■■□□ 2.13
LTBP3-211ENST00000528966 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
LTBP3-211ENST00000528966 SLC26A8Q96RN1 970 aa28.35■■■□□ 2.13
LTBP3-211ENST00000528966 NWD1Q149M9 1564 aa28.35■■■□□ 2.13
LTBP3-211ENST00000528966 KIF15Q9NS87 1388 aa28.35■■■□□ 2.13
LTBP3-211ENST00000528966 PHLPP1O60346 1717 aa28.35■■■□□ 2.13
LTBP3-211ENST00000528966 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.35■■■□□ 2.13
LTBP3-211ENST00000528966 STAG3Q9UJ98 1225 aa28.34■■■□□ 2.13
LTBP3-211ENST00000528966 ERBINQ96RT1 1412 aa28.34■■■□□ 2.13
LTBP3-211ENST00000528966 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
LTBP3-211ENST00000528966 IDI1Q13907 227 aa28.31■■■□□ 2.12
LTBP3-211ENST00000528966 CROCC2H7BZ55 1655 aa28.31■■■□□ 2.12
LTBP3-211ENST00000528966 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.3■■■□□ 2.12
LTBP3-211ENST00000528966 JCADQ9P266 1359 aa28.28■■■□□ 2.12
LTBP3-211ENST00000528966 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
LTBP3-211ENST00000528966 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.27■■■□□ 2.12
LTBP3-211ENST00000528966 MSH6P52701 1360 aa28.26■■■□□ 2.12
LTBP3-211ENST00000528966 SLAIN2Q9P270 581 aa28.26■■■□□ 2.11
LTBP3-211ENST00000528966 ABCC5O15440 1437 aa28.26■■■□□ 2.11
LTBP3-211ENST00000528966 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
LTBP3-211ENST00000528966 LMTK2Q8IWU2 1503 aa28.25■■■□□ 2.11
LTBP3-211ENST00000528966 ADGRB3O60242 1522 aa28.24■■■□□ 2.11
LTBP3-211ENST00000528966 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.24■■■□□ 2.11
LTBP3-211ENST00000528966 KANK1Q14678 1352 aa28.23■■■□□ 2.11
LTBP3-211ENST00000528966 LRP6O75581 1613 aa28.22■■■□□ 2.11
LTBP3-211ENST00000528966 NOS1P29475 1434 aa28.21■■■□□ 2.11
LTBP3-211ENST00000528966 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.11
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