RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527118.5

RBBP4-218, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, humanhuman

TSL 3

Gene RBBP4, Length 700 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4-218ENST00000527118 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
RBBP4-218ENST00000527118 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.43■■□□□ 1.5
RBBP4-218ENST00000527118 NCOA1Q15788 1441 aa24.42■■□□□ 1.5
RBBP4-218ENST00000527118 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
RBBP4-218ENST00000527118 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.41■■□□□ 1.5
RBBP4-218ENST00000527118 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
RBBP4-218ENST00000527118 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.4■■□□□ 1.5
RBBP4-218ENST00000527118 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.39■■□□□ 1.5
RBBP4-218ENST00000527118 ABCC5O15440 1437 aa24.38■■□□□ 1.49
RBBP4-218ENST00000527118 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
RBBP4-218ENST00000527118 PTPRTO14522 1441 aa24.37■■□□□ 1.49
RBBP4-218ENST00000527118 CERKQ8TCT0 537 aa24.37■■□□□ 1.49
RBBP4-218ENST00000527118 PZPP20742 1482 aa24.37■■□□□ 1.49
RBBP4-218ENST00000527118 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
RBBP4-218ENST00000527118 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
RBBP4-218ENST00000527118 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.36■■□□□ 1.49
RBBP4-218ENST00000527118 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
RBBP4-218ENST00000527118 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24.35■■□□□ 1.49
RBBP4-218ENST00000527118 CEP152O94986 1710 aa24.35■■□□□ 1.49
RBBP4-218ENST00000527118 MROH1Q8NDA8 1641 aa24.35■■□□□ 1.49
RBBP4-218ENST00000527118 DAPK1P53355 1430 aa24.35■■□□□ 1.49
RBBP4-218ENST00000527118 ABCC3O15438 1527 aa24.33■■□□□ 1.49
RBBP4-218ENST00000527118 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
RBBP4-218ENST00000527118 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24.33■■□□□ 1.48
RBBP4-218ENST00000527118 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.32■■□□□ 1.48
RBBP4-218ENST00000527118 TNRQ92752 1358 aa24.32■■□□□ 1.48
RBBP4-218ENST00000527118 KIF15Q9NS87 1388 aa24.31■■□□□ 1.48
RBBP4-218ENST00000527118 PLA2R1Q13018 1463 aa24.31■■□□□ 1.48
RBBP4-218ENST00000527118 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.3■■□□□ 1.48
RBBP4-218ENST00000527118 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
RBBP4-218ENST00000527118 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.26■■□□□ 1.47
RBBP4-218ENST00000527118 ERBINQ96RT1 1412 aa24.25■■□□□ 1.47
RBBP4-218ENST00000527118 LTBP4Q8N2S1 1624 aa24.24■■□□□ 1.47
RBBP4-218ENST00000527118 PKD2Q13563 968 aa24.24■■□□□ 1.47
RBBP4-218ENST00000527118 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
RBBP4-218ENST00000527118 DEPDC5O75140 1603 aa24.22■■□□□ 1.47
RBBP4-218ENST00000527118 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa24.22■■□□□ 1.47
RBBP4-218ENST00000527118 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
RBBP4-218ENST00000527118 NLRP1Q9C000 1473 aa24.21■■□□□ 1.47
RBBP4-218ENST00000527118 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.21■■□□□ 1.47
RBBP4-218ENST00000527118 UGGT1Q9NYU2 1555 aa24.2■■□□□ 1.46
RBBP4-218ENST00000527118 ERVK-7P63135 1459 aa24.19■■□□□ 1.46
RBBP4-218ENST00000527118 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.18■■□□□ 1.464e-8■■■□□ 17.9
RBBP4-218ENST00000527118 NEURL4Q96JN8 1562 aa24.17■■□□□ 1.46
RBBP4-218ENST00000527118 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
RBBP4-218ENST00000527118 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.16■■□□□ 1.46
RBBP4-218ENST00000527118 ADGRL2O95490 1459 aa24.15■■□□□ 1.46
RBBP4-218ENST00000527118 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
RBBP4-218ENST00000527118 UBR1Q8IWV7 1749 aa24.12■■□□□ 1.45
RBBP4-218ENST00000527118 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
RBBP4-218ENST00000527118 KANK1Q14678 1352 aa24.11■■□□□ 1.45
RBBP4-218ENST00000527118 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa24.1■■□□□ 1.45
RBBP4-218ENST00000527118 VWDEQ8N2E2 1590 aa24.09■■□□□ 1.45
RBBP4-218ENST00000527118 ANKLE2Q86XL3 938 aa24.09■■□□□ 1.45
RBBP4-218ENST00000527118 IQSEC2Q5JU85 1478 aa24.08■■□□□ 1.45
RBBP4-218ENST00000527118 LMTK2Q8IWU2 1503 aa24.06■■□□□ 1.44
RBBP4-218ENST00000527118 IQGAP1P46940 1657 aa24.06■■□□□ 1.44
RBBP4-218ENST00000527118 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa24.04■■□□□ 1.44
RBBP4-218ENST00000527118 PIK3C2BO00750 1634 aa24.04■■□□□ 1.44
RBBP4-218ENST00000527118 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
RBBP4-218ENST00000527118 MED14O60244 1454 aa24.03■■□□□ 1.44
RBBP4-218ENST00000527118 EFCAB6Q5THR3 1501 aa24.03■■□□□ 1.44
RBBP4-218ENST00000527118 SYNMO15061 1565 aa23.99■■□□□ 1.43
RBBP4-218ENST00000527118 UNC13BO14795 1591 aa23.97■■□□□ 1.43
RBBP4-218ENST00000527118 ITGAEP38570 1179 aa23.97■■□□□ 1.43
RBBP4-218ENST00000527118 TET3O43151 1660 aa23.96■■□□□ 1.43
RBBP4-218ENST00000527118 STRCP1A6NGW2 1772 aa23.96■■□□□ 1.43
RBBP4-218ENST00000527118 SLIT1O75093 1534 aa23.95■■□□□ 1.43
RBBP4-218ENST00000527118 CPS1P31327 1500 aa23.95■■□□□ 1.43
RBBP4-218ENST00000527118 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
RBBP4-218ENST00000527118 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.95■■□□□ 1.42
RBBP4-218ENST00000527118 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
RBBP4-218ENST00000527118 ARHGAP23Q9P227 1491 aa23.94■■□□□ 1.42
RBBP4-218ENST00000527118 ROCK1Q13464 1354 aa23.94■■□□□ 1.42
RBBP4-218ENST00000527118 UBAP1LF5GYI3 381 aa23.93■■□□□ 1.42
RBBP4-218ENST00000527118 NOS1P29475 1434 aa23.93■■□□□ 1.42
RBBP4-218ENST00000527118 LTKP29376 864 aa23.92■■□□□ 1.42
RBBP4-218ENST00000527118 IDI1Q13907 227 aa23.92■■□□□ 1.42
RBBP4-218ENST00000527118 STAG3Q9UJ98 1225 aa23.92■■□□□ 1.42
RBBP4-218ENST00000527118 TXNDC2Q86VQ3 553 aa23.91■■□□□ 1.42
RBBP4-218ENST00000527118 MYO5BQ9ULV0 1848 aa23.91■■□□□ 1.42
RBBP4-218ENST00000527118 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.42
RBBP4-218ENST00000527118 E9PCH4 1651 aa23.89■■□□□ 1.41
RBBP4-218ENST00000527118 ADGRB3O60242 1522 aa23.88■■□□□ 1.41
RBBP4-218ENST00000527118 TMEM2Q9UHN6 1383 aa23.88■■□□□ 1.41
RBBP4-218ENST00000527118 IQGAP3Q86VI3 1631 aa23.88■■□□□ 1.41
RBBP4-218ENST00000527118 EID1Q9Y6B2 187 aa23.87■■□□□ 1.41
RBBP4-218ENST00000527118 SLC52A1Q9NWF4 448 aa23.82■■□□□ 1.4
RBBP4-218ENST00000527118 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
RBBP4-218ENST00000527118 LRRC7Q96NW7 1537 aa23.8■■□□□ 1.4
RBBP4-218ENST00000527118 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
RBBP4-218ENST00000527118 NUP155O75694 1391 aa23.79■■□□□ 1.4
RBBP4-218ENST00000527118 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa23.79■■□□□ 1.4
RBBP4-218ENST00000527118 PIP4K2BP78356 416 aa23.78■■□□□ 1.4
RBBP4-218ENST00000527118 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
RBBP4-218ENST00000527118 TOM1O60784 492 aa23.77■■□□□ 1.4
RBBP4-218ENST00000527118 ALKQ9UM73 1620 aa23.76■■□□□ 1.39
RBBP4-218ENST00000527118 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
RBBP4-218ENST00000527118 CHGAP10645 457 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
RBBP4-218ENST00000527118 SLC26A8Q96RN1 970 aa23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms