RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527103.1

PITPNM1-208, Transcript of phosphatidylinositol transfer protein membrane associated 1, human

TSL 4

Gene PITPNM1, Length 308 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PITPNM1-208	ENST00000527103	PTPRK	Q15262	1439 aa		34.06	■■■■□ 3.04
PITPNM1-208	ENST00000527103	C3	P01024	1663 aa		34.04	■■■■□ 3.04
PITPNM1-208	ENST00000527103	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	34.03	■■■■□ 3.04
PITPNM1-208	ENST00000527103	ADGRL2	O95490	1459 aa		34.03	■■■■□ 3.04
PITPNM1-208	ENST00000527103	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		34.02	■■■■□ 3.04
PITPNM1-208	ENST00000527103	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	34.01	■■■■□ 3.03
PITPNM1-208	ENST00000527103	MROH2A	A6NES4	1674 aa		34	■■■■□ 3.03
PITPNM1-208	ENST00000527103	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	34	■■■■□ 3.03
PITPNM1-208	ENST00000527103	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		33.98	■■■■□ 3.03
PITPNM1-208	ENST00000527103	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	33.95	■■■■□ 3.03
PITPNM1-208	ENST00000527103	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	33.95	■■■■□ 3.03
PITPNM1-208	ENST00000527103	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		33.94	■■■■□ 3.02
PITPNM1-208	ENST00000527103	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		33.94	■■■■□ 3.02
PITPNM1-208	ENST00000527103	HSPA2	P54652	639 aa		33.93	■■■■□ 3.02
PITPNM1-208	ENST00000527103	ROCK1	Q13464	1354 aa		33.93	■■■■□ 3.02
PITPNM1-208	ENST00000527103	NPAT	Q14207	1427 aa		33.93	■■■■□ 3.02
PITPNM1-208	ENST00000527103	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	33.92	■■■■□ 3.02
PITPNM1-208	ENST00000527103	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		33.9	■■■■□ 3.02
PITPNM1-208	ENST00000527103	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		33.89	■■■■□ 3.02
PITPNM1-208	ENST00000527103	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	33.89	■■■■□ 3.02
PITPNM1-208	ENST00000527103	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		33.88	■■■■□ 3.01
PITPNM1-208	ENST00000527103	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		33.86	■■■■□ 3.01
PITPNM1-208	ENST00000527103	ABCC3	O15438	1527 aa		33.85	■■■■□ 3.01
PITPNM1-208	ENST00000527103	KANK1	Q14678	1352 aa		33.84	■■■■□ 3.01
PITPNM1-208	ENST00000527103	PZP	P20742	1482 aa		33.82	■■■■□ 3
PITPNM1-208	ENST00000527103	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	33.79	■■■■□ 3
PITPNM1-208	ENST00000527103	DEPDC5	O75140	1603 aa		33.78	■■■■□ 3
PITPNM1-208	ENST00000527103	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	33.77	■■■■□ 3
PITPNM1-208	ENST00000527103	TNR	Q92752	1358 aa		33.75	■■■□□ 2.99
PITPNM1-208	ENST00000527103	CEP152	O94986	1710 aa		33.72	■■■□□ 2.99
PITPNM1-208	ENST00000527103	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		33.69	■■■□□ 2.98
PITPNM1-208	ENST00000527103	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		33.68	■■■□□ 2.98
PITPNM1-208	ENST00000527103	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		33.68	■■■□□ 2.98
PITPNM1-208	ENST00000527103	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		33.67	■■■□□ 2.98
PITPNM1-208	ENST00000527103	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		33.64	■■■□□ 2.98
PITPNM1-208	ENST00000527103	ERVK-7	P63135	1459 aa		33.63	■■■□□ 2.97
PITPNM1-208	ENST00000527103	NAIP	Q13075	1403 aa		33.62	■■■□□ 2.97
PITPNM1-208	ENST00000527103	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		33.61	■■■□□ 2.97
PITPNM1-208	ENST00000527103	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		33.61	■■■□□ 2.97
PITPNM1-208	ENST00000527103	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	33.6	■■■□□ 2.97
PITPNM1-208	ENST00000527103	NUP155	O75694	1391 aa		33.6	■■■□□ 2.97
PITPNM1-208	ENST00000527103	NLRP1	Q9C000	1473 aa		33.58	■■■□□ 2.97
PITPNM1-208	ENST00000527103	UNC13B	O14795	1591 aa		33.58	■■■□□ 2.97
PITPNM1-208	ENST00000527103	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	33.57	■■■□□ 2.97
PITPNM1-208	ENST00000527103	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		33.57	■■■□□ 2.96
PITPNM1-208	ENST00000527103	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	33.55	■■■□□ 2.96
PITPNM1-208	ENST00000527103	HFM1	A2PYH4	1435 aa		33.54	■■■□□ 2.96
PITPNM1-208	ENST00000527103	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	33.54	■■■□□ 2.96
PITPNM1-208	ENST00000527103	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		33.53	■■■□□ 2.96
PITPNM1-208	ENST00000527103	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	33.52	■■■□□ 2.96
PITPNM1-208	ENST00000527103	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		33.52	■■■□□ 2.96
PITPNM1-208	ENST00000527103	STRC	Q7RTU9	1775 aa		33.51	■■■□□ 2.95
PITPNM1-208	ENST00000527103	PKD2	Q13563	968 aa		33.47	■■■□□ 2.95
PITPNM1-208	ENST00000527103	NOS1	P29475	1434 aa		33.46	■■■□□ 2.95
PITPNM1-208	ENST00000527103	TET3	O43151	1660 aa		33.46	■■■□□ 2.95
PITPNM1-208	ENST00000527103	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		33.46	■■■□□ 2.95
PITPNM1-208	ENST00000527103	PLA2R1	Q13018	1463 aa		33.46	■■■□□ 2.95
PITPNM1-208	ENST00000527103	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	33.46	■■■□□ 2.95
PITPNM1-208	ENST00000527103	IDI1	Q13907	227 aa		33.46	■■■□□ 2.95
PITPNM1-208	ENST00000527103	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		33.46	■■■□□ 2.95
PITPNM1-208	ENST00000527103	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		33.46	■■■□□ 2.95
PITPNM1-208	ENST00000527103	TRIM52	Q96A61	297 aa		33.45	■■■□□ 2.95
PITPNM1-208	ENST00000527103	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		33.42	■■■□□ 2.94
PITPNM1-208	ENST00000527103	PTPRT	O14522	1441 aa		33.42	■■■□□ 2.94
PITPNM1-208	ENST00000527103	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		33.41	■■■□□ 2.94
PITPNM1-208	ENST00000527103	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		33.4	■■■□□ 2.94
PITPNM1-208	ENST00000527103	SYNM	O15061	1565 aa		33.36	■■■□□ 2.93
PITPNM1-208	ENST00000527103		E9PCH4	1651 aa		33.35	■■■□□ 2.93
PITPNM1-208	ENST00000527103	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		33.31	■■■□□ 2.92
PITPNM1-208	ENST00000527103	PIK3C2B	O00750	1634 aa		33.3	■■■□□ 2.92
PITPNM1-208	ENST00000527103	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		33.29	■■■□□ 2.92
PITPNM1-208	ENST00000527103	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	33.29	■■■□□ 2.92
PITPNM1-208	ENST00000527103	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		33.27	■■■□□ 2.92
PITPNM1-208	ENST00000527103	LTK	P29376	864 aa		33.24	■■■□□ 2.91
PITPNM1-208	ENST00000527103	FBXO41	Q8TF61	875 aa		33.24	■■■□□ 2.91
PITPNM1-208	ENST00000527103	EID1	Q9Y6B2	187 aa		33.24	■■■□□ 2.91
PITPNM1-208	ENST00000527103	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		33.23	■■■□□ 2.91
PITPNM1-208	ENST00000527103	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	33.23	■■■□□ 2.91
PITPNM1-208	ENST00000527103	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	33.23	■■■□□ 2.91
PITPNM1-208	ENST00000527103	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		33.22	■■■□□ 2.91
PITPNM1-208	ENST00000527103	SLIT1	O75093	1534 aa		33.21	■■■□□ 2.91
PITPNM1-208	ENST00000527103	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		33.2	■■■□□ 2.91
PITPNM1-208	ENST00000527103	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	33.19	■■■□□ 2.9
PITPNM1-208	ENST00000527103	MED14	O60244	1454 aa		33.19	■■■□□ 2.9
PITPNM1-208	ENST00000527103	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	33.19	■■■□□ 2.9
PITPNM1-208	ENST00000527103	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	33.18	■■■□□ 2.9
PITPNM1-208	ENST00000527103	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		33.18	■■■□□ 2.9
PITPNM1-208	ENST00000527103	ADGRB3	O60242	1522 aa		33.18	■■■□□ 2.9
PITPNM1-208	ENST00000527103	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		33.17	■■■□□ 2.9
PITPNM1-208	ENST00000527103	CERK	Q8TCT0	537 aa		33.16	■■■□□ 2.9
PITPNM1-208	ENST00000527103	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	33.16	■■■□□ 2.9
PITPNM1-208	ENST00000527103	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	33.14	■■■□□ 2.9
PITPNM1-208	ENST00000527103	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	33.12	■■■□□ 2.89
PITPNM1-208	ENST00000527103	FOXD1	Q16676	465 aa		33.12	■■■□□ 2.89
PITPNM1-208	ENST00000527103	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		33.1	■■■□□ 2.89
PITPNM1-208	ENST00000527103	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		33.1	■■■□□ 2.89
PITPNM1-208	ENST00000527103	HRC	P23327	699 aa		33.08	■■■□□ 2.89
PITPNM1-208	ENST00000527103	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		33.06	■■■□□ 2.88
PITPNM1-208	ENST00000527103	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		33.05	■■■□□ 2.88
PITPNM1-208	ENST00000527103	IQGAP1	P46940	1657 aa		33.05	■■■□□ 2.88

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