RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526137.1

SIPA1-202, Transcript of signal-induced proliferation-associated 1, humanhuman

TSL 3

Gene SIPA1, Length 379 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1-202ENST00000526137 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa41.34■■■■■ 4.21
SIPA1-202ENST00000526137 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa41.31■■■■■ 4.2
SIPA1-202ENST00000526137 TNRQ92752 1358 aa41.3■■■■■ 4.2
SIPA1-202ENST00000526137 UBAP1LF5GYI3 381 aa41.3■■■■■ 4.2
SIPA1-202ENST00000526137 TSPY4P0CV99 314 aa41.28■■■■■ 4.2
SIPA1-202ENST00000526137 TSPY10P0CW01 314 aa41.28■■■■■ 4.2
SIPA1-202ENST00000526137 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP41.22■■■■■ 4.19
SIPA1-202ENST00000526137 PZPP20742 1482 aa41.22■■■■■ 4.19
SIPA1-202ENST00000526137 KDM5DQ9BY66 1539 aa41.2■■■■■ 4.19
SIPA1-202ENST00000526137 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.2■■■■■ 4.19
SIPA1-202ENST00000526137 FAM135AQ9P2D6 1515 aa41.17■■■■■ 4.18
SIPA1-202ENST00000526137 MIA2Q96PC5 1412 aa41.16■■■■■ 4.18
SIPA1-202ENST00000526137 SOCS7O14512 581 aa41.15■■■■■ 4.18
SIPA1-202ENST00000526137 ARHGEF5Q12774 1597 aa41.15■■■■■ 4.18
SIPA1-202ENST00000526137 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa41.15■■■■■ 4.18
SIPA1-202ENST00000526137 VPS8Q8N3P4 1428 aa41.13■■■■■ 4.17
SIPA1-202ENST00000526137 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP41.13■■■■■ 4.17
SIPA1-202ENST00000526137 ANKLE2Q86XL3 938 aa41.12■■■■■ 4.17
SIPA1-202ENST00000526137 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP41.12■■■■■ 4.17
SIPA1-202ENST00000526137 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP41.11■■■■■ 4.17
SIPA1-202ENST00000526137 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa41.08■■■■■ 4.17
SIPA1-202ENST00000526137 NLRP1Q9C000 1473 aa41.04■■■■■ 4.16
SIPA1-202ENST00000526137 NEURL4Q96JN8 1562 aa41.03■■■■■ 4.16
SIPA1-202ENST00000526137 SHANK2Q9UPX8 1470 aa41.01■■■■■ 4.16
SIPA1-202ENST00000526137 UGGT1Q9NYU2 1555 aa40.97■■■■■ 4.15
SIPA1-202ENST00000526137 CPS1P31327 1500 aa40.94■■■■■ 4.14
SIPA1-202ENST00000526137 TOM1O60784 492 aa40.94■■■■■ 4.14
SIPA1-202ENST00000526137 MYOM3Q5VTT5 1437 aa40.93■■■■■ 4.14
SIPA1-202ENST00000526137 ABCC3O15438 1527 aa40.93■■■■■ 4.14
SIPA1-202ENST00000526137 MAP3K1Q13233 1512 aa40.93■■■■■ 4.14
SIPA1-202ENST00000526137 PIP4K2BP78356 416 aa40.93■■■■■ 4.14
SIPA1-202ENST00000526137 MAST1Q9Y2H9 1570 aa40.93■■■■■ 4.14
SIPA1-202ENST00000526137 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP40.93■■■■■ 4.14
SIPA1-202ENST00000526137 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP40.92■■■■■ 4.14
SIPA1-202ENST00000526137 MED14O60244 1454 aa40.91■■■■■ 4.14
SIPA1-202ENST00000526137 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP40.89■■■■■ 4.14
SIPA1-202ENST00000526137 HSPA1LP34931 641 aa40.89■■■■■ 4.14
SIPA1-202ENST00000526137 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP40.89■■■■■ 4.14
SIPA1-202ENST00000526137 VWDEQ8N2E2 1590 aa40.85■■■■■ 4.13
SIPA1-202ENST00000526137 ERVK-7P63135 1459 aa40.83■■■■■ 4.13
SIPA1-202ENST00000526137 DEPDC5O75140 1603 aa40.81■■■■■ 4.12
SIPA1-202ENST00000526137 MROH1Q8NDA8 1641 aa40.78■■■■■ 4.12
SIPA1-202ENST00000526137 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP40.78■■■■■ 4.12
SIPA1-202ENST00000526137 DUOX2Q9NRD8 1548 aa40.77■■■■■ 4.12
SIPA1-202ENST00000526137 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa40.76■■■■■ 4.12
SIPA1-202ENST00000526137 KIF15Q9NS87 1388 aa40.75■■■■■ 4.11
SIPA1-202ENST00000526137 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP40.75■■■■■ 4.11
SIPA1-202ENST00000526137 ABCC5O15440 1437 aa40.73■■■■■ 4.11
SIPA1-202ENST00000526137 APLP2Q06481 763 aa40.68■■■■■ 4.1
SIPA1-202ENST00000526137 LTKP29376 864 aa40.67■■■■■ 4.1
SIPA1-202ENST00000526137 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP40.67■■■■■ 4.1
SIPA1-202ENST00000526137 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa40.67■■■■■ 4.1
SIPA1-202ENST00000526137 IQGAP1P46940 1657 aa40.66■■■■■ 4.1
SIPA1-202ENST00000526137 TXNDC2Q86VQ3 553 aa40.65■■■■■ 4.1
SIPA1-202ENST00000526137 ERBINQ96RT1 1412 aa40.64■■■■■ 4.1
SIPA1-202ENST00000526137 LRRC7Q96NW7 1537 aa40.63■■■■■ 4.1
SIPA1-202ENST00000526137 ALKQ9UM73 1620 aa40.62■■■■■ 4.09
SIPA1-202ENST00000526137 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP40.61■■■■■ 4.09
SIPA1-202ENST00000526137 CEP152O94986 1710 aa40.59■■■■■ 4.09
SIPA1-202ENST00000526137 DAPK1P53355 1430 aa40.58■■■■■ 4.09
SIPA1-202ENST00000526137 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP40.57■■■■■ 4.09
SIPA1-202ENST00000526137 ARHGAP23Q9P227 1491 aa40.57■■■■■ 4.08
SIPA1-202ENST00000526137 CHIC2Q9UKJ5 165 aa40.55■■■■■ 4.08
SIPA1-202ENST00000526137 EID1Q9Y6B2 187 aa40.55■■■■■ 4.08
SIPA1-202ENST00000526137 UBR1Q8IWV7 1749 aa40.54■■■■■ 4.08
SIPA1-202ENST00000526137 PTPN23Q9H3S7 1636 aa40.54■■■■■ 4.08
SIPA1-202ENST00000526137 SLIT1O75093 1534 aa40.53■■■■■ 4.08
SIPA1-202ENST00000526137 FGD6Q6ZV73 1430 aa40.53■■■■■ 4.08
SIPA1-202ENST00000526137 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP40.52■■■■■ 4.08
SIPA1-202ENST00000526137 KANK1Q14678 1352 aa40.52■■■■■ 4.08
SIPA1-202ENST00000526137 STRCP1A6NGW2 1772 aa40.52■■■■■ 4.08
SIPA1-202ENST00000526137 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP40.5■■■■■ 4.07
SIPA1-202ENST00000526137 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP40.49■■■■■ 4.07
SIPA1-202ENST00000526137 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa40.48■■■■■ 4.07
SIPA1-202ENST00000526137 TMEM2Q9UHN6 1383 aa40.48■■■■■ 4.07
SIPA1-202ENST00000526137 IDI1Q13907 227 aa40.47■■■■■ 4.07
SIPA1-202ENST00000526137 STAG3Q9UJ98 1225 aa40.47■■■■■ 4.07
SIPA1-202ENST00000526137 CROCC2H7BZ55 1655 aa40.44■■■■■ 4.06
SIPA1-202ENST00000526137 SYNMO15061 1565 aa40.42■■■■■ 4.06
SIPA1-202ENST00000526137 LMTK2Q8IWU2 1503 aa40.38■■■■■ 4.06
SIPA1-202ENST00000526137 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP40.38■■■■■ 4.05
SIPA1-202ENST00000526137 PIK3C2BO00750 1634 aa40.35■■■■■ 4.05
SIPA1-202ENST00000526137 SLC26A8Q96RN1 970 aa40.3■■■■■ 4.04
SIPA1-202ENST00000526137 NOS1P29475 1434 aa40.3■■■■■ 4.04
SIPA1-202ENST00000526137 EFCAB6Q5THR3 1501 aa40.3■■■■■ 4.04
SIPA1-202ENST00000526137 KCNA6P17658 529 aa40.29■■■■■ 4.04
SIPA1-202ENST00000526137 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP40.28■■■■■ 4.04
SIPA1-202ENST00000526137 SLC52A1Q9NWF4 448 aa40.27■■■■■ 4.04
SIPA1-202ENST00000526137 TMEM94Q12767 1356 aa40.25■■■■■ 4.03
SIPA1-202ENST00000526137 ADGRL2O95490 1459 aa40.24■■■■■ 4.03
SIPA1-202ENST00000526137 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP40.21■■■■■ 4.03
SIPA1-202ENST00000526137 FAM135BQ49AJ0 1406 aa40.2■■■■■ 4.03
SIPA1-202ENST00000526137 TET3O43151 1660 aa40.18■■■■■ 4.02
SIPA1-202ENST00000526137 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa40.18■■■■■ 4.02
SIPA1-202ENST00000526137 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP40.18■■■■■ 4.02
SIPA1-202ENST00000526137 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP40.18■■■■■ 4.02
SIPA1-202ENST00000526137 BCANQ96GW7 911 aa40.14■■■■■ 4.02
SIPA1-202ENST00000526137 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP40.13■■■■■ 4.01
SIPA1-202ENST00000526137 ADGRB3O60242 1522 aa40.12■■■■■ 4.01
SIPA1-202ENST00000526137 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP40.12■■■■■ 4.01
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