RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520911.5

RNF130-204, Transcript of ring finger protein 130, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RNF130, Length 1,790 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF130-204ENST00000520911 MLECQ14165 292 aa41.94■■■■■ 4.3
RNF130-204ENST00000520911 HRCP23327 699 aa41.91■■■■■ 4.3
RNF130-204ENST00000520911 BCORL1Q5H9F3 1711 aa41.9■■■■■ 4.3
RNF130-204ENST00000520911 MROH1Q8NDA8 1641 aa41.86■■■■■ 4.29
RNF130-204ENST00000520911 NUP155O75694 1391 aa41.86■■■■■ 4.29
RNF130-204ENST00000520911 UNC13BO14795 1591 aa41.86■■■■■ 4.29
RNF130-204ENST00000520911 DEPDC5O75140 1603 aa41.85■■■■■ 4.29
RNF130-204ENST00000520911 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP41.85■■■■■ 4.29
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RNF130-204ENST00000520911 PZPP20742 1482 aa41.73■■■■■ 4.27
RNF130-204ENST00000520911 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa41.71■■■■■ 4.27
RNF130-204ENST00000520911 KDM5DQ9BY66 1539 aa41.71■■■■■ 4.27
RNF130-204ENST00000520911 VWDEQ8N2E2 1590 aa41.7■■■■■ 4.27
RNF130-204ENST00000520911 FAM135AQ9P2D6 1515 aa41.7■■■■■ 4.27
RNF130-204ENST00000520911 MPHOSPH9Q99550 1183 aa41.7■■■■■ 4.27
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RNF130-204ENST00000520911 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP41.69■■■■■ 4.26
RNF130-204ENST00000520911 IQGAP3Q86VI3 1631 aa41.68■■■■■ 4.26
RNF130-204ENST00000520911 CEP152O94986 1710 aa41.66■■■■■ 4.26
RNF130-204ENST00000520911 ABCC3O15438 1527 aa41.65■■■■■ 4.26
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RNF130-204ENST00000520911 PKD2Q13563 968 aa41.58■■■■■ 4.25
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RNF130-204ENST00000520911 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP41.58■■■■■ 4.25
RNF130-204ENST00000520911 LMTK2Q8IWU2 1503 aa41.56■■■■■ 4.24
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RNF130-204ENST00000520911 MADDQ8WXG6 1647 aa41.5■■■■■ 4.23
RNF130-204ENST00000520911 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa41.5■■■■■ 4.23
RNF130-204ENST00000520911 EFCAB6Q5THR3 1501 aa41.48■■■■■ 4.23
RNF130-204ENST00000520911 E9PCH4 1651 aa41.46■■■■■ 4.23
RNF130-204ENST00000520911 ZMYM3Q14202 1370 aa41.45■■■■■ 4.23
RNF130-204ENST00000520911 NPATQ14207 1427 aa41.45■■■■■ 4.23
RNF130-204ENST00000520911 CNTLNQ9NXG0 1405 aa41.44■■■■■ 4.22
RNF130-204ENST00000520911 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP41.43■■■■■ 4.22
RNF130-204ENST00000520911 PLPPR3Q6T4P5 718 aa41.41■■■■■ 4.22
RNF130-204ENST00000520911 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP41.4■■■■■ 4.22
RNF130-204ENST00000520911 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP41.4■■■■■ 4.22
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RNF130-204ENST00000520911 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP41.38■■■■■ 4.22
RNF130-204ENST00000520911 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa41.38■■■■■ 4.21
RNF130-204ENST00000520911 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa41.35■■■■■ 4.21
RNF130-204ENST00000520911 MROH2AA6NES4 1674 aa41.34■■■■■ 4.21
RNF130-204ENST00000520911 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP41.32■■■■■ 4.2
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RNF130-204ENST00000520911 C3P01024 1663 aa41.29■■■■■ 4.2
RNF130-204ENST00000520911 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa41.29■■■■■ 4.2
RNF130-204ENST00000520911 PTPRTO14522 1441 aa41.24■■■■■ 4.19
RNF130-204ENST00000520911 PREX1Q8TCU6 1659 aa41.23■■■■■ 4.19
RNF130-204ENST00000520911 ERVK-7P63135 1459 aa41.23■■■■■ 4.19
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RNF130-204ENST00000520911 NOS1P29475 1434 aa41.22■■■■■ 4.19
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RNF130-204ENST00000520911 TRPM2O94759 1503 aa41.16■■■■■ 4.18
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RNF130-204ENST00000520911 TNRQ92752 1358 aa41.1■■■■■ 4.17
RNF130-204ENST00000520911 CCDC144AA2RUR9 1427 aa41.1■■■■■ 4.17
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RNF130-204ENST00000520911 CLTCL1P53675 1640 aa41.07■■■■■ 4.17
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RNF130-204ENST00000520911 NLRP1Q9C000 1473 aa40.87■■■■■ 4.13
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RNF130-204ENST00000520911 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa40.86■■■■■ 4.13
RNF130-204ENST00000520911 KIF1BO60333 1816 aa40.85■■■■■ 4.13
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RNF130-204ENST00000520911 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP40.79■■■■■ 4.12
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RNF130-204ENST00000520911 NEURL4Q96JN8 1562 aa40.69■■■■■ 4.1
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RNF130-204ENST00000520911 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa40.67■■■■■ 4.1
RNF130-204ENST00000520911 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP40.65■■■■■ 4.1
RNF130-204ENST00000520911 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP40.65■■■■■ 4.1
RNF130-204ENST00000520911 TMEM2Q9UHN6 1383 aa40.6■■■■■ 4.09
RNF130-204ENST00000520911 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa40.6■■■■■ 4.09
RNF130-204ENST00000520911 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa40.59■■■■■ 4.09
RNF130-204ENST00000520911 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa40.58■■■■■ 4.09
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