RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520872.5

STAU2-208, Transcript of staufen double-stranded RNA binding protein 2, human

TSL 3

Gene STAU2, Length 560 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
STAU2-208	ENST00000520872	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		29.56	■■■□□ 2.32
STAU2-208	ENST00000520872	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	29.56	■■■□□ 2.32
STAU2-208	ENST00000520872	STRC	Q7RTU9	1775 aa		29.54	■■■□□ 2.32
STAU2-208	ENST00000520872	DAPK1	P53355	1430 aa		29.53	■■■□□ 2.32
STAU2-208	ENST00000520872	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		29.51	■■■□□ 2.32
STAU2-208	ENST00000520872	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	29.51	■■■□□ 2.31
STAU2-208	ENST00000520872	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		29.5	■■■□□ 2.31
STAU2-208	ENST00000520872	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		29.48	■■■□□ 2.31
STAU2-208	ENST00000520872	PZP	P20742	1482 aa		29.48	■■■□□ 2.31
STAU2-208	ENST00000520872	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	29.45	■■■□□ 2.31
STAU2-208	ENST00000520872	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	29.45	■■■□□ 2.31
STAU2-208	ENST00000520872	NCOA1	Q15788	1441 aa		29.45	■■■□□ 2.3
STAU2-208	ENST00000520872	KIF15	Q9NS87	1388 aa		29.44	■■■□□ 2.3
STAU2-208	ENST00000520872	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		29.44	■■■□□ 2.3
STAU2-208	ENST00000520872	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		29.44	■■■□□ 2.3
STAU2-208	ENST00000520872	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	29.43	■■■□□ 2.3
STAU2-208	ENST00000520872	ABCC3	O15438	1527 aa		29.43	■■■□□ 2.3
STAU2-208	ENST00000520872	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		29.41	■■■□□ 2.3
STAU2-208	ENST00000520872	PTPRT	O14522	1441 aa		29.4	■■■□□ 2.3
STAU2-208	ENST00000520872	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		29.39	■■■□□ 2.3
STAU2-208	ENST00000520872	ADGRL2	O95490	1459 aa		29.38	■■■□□ 2.29
STAU2-208	ENST00000520872	PLA2R1	Q13018	1463 aa		29.38	■■■□□ 2.29
STAU2-208	ENST00000520872	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	29.38	■■■□□ 2.29
STAU2-208	ENST00000520872	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		29.37	■■■□□ 2.29
STAU2-208	ENST00000520872	DEPDC5	O75140	1603 aa		29.36	■■■□□ 2.29
STAU2-208	ENST00000520872	TNR	Q92752	1358 aa		29.35	■■■□□ 2.29
STAU2-208	ENST00000520872	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		29.35	■■■□□ 2.29
STAU2-208	ENST00000520872	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	29.34	■■■□□ 2.29
STAU2-208	ENST00000520872	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		29.34	■■■□□ 2.29
STAU2-208	ENST00000520872	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		29.31	■■■□□ 2.28
STAU2-208	ENST00000520872	CEP152	O94986	1710 aa		29.29	■■■□□ 2.28
STAU2-208	ENST00000520872	FBXO41	Q8TF61	875 aa		29.29	■■■□□ 2.28
STAU2-208	ENST00000520872	NLRP1	Q9C000	1473 aa		29.29	■■■□□ 2.28
STAU2-208	ENST00000520872	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		29.27	■■■□□ 2.28
STAU2-208	ENST00000520872	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		29.26	■■■□□ 2.27
STAU2-208	ENST00000520872	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		29.26	■■■□□ 2.27
STAU2-208	ENST00000520872	ERVK-7	P63135	1459 aa		29.25	■■■□□ 2.27
STAU2-208	ENST00000520872	PKD2	Q13563	968 aa		29.25	■■■□□ 2.27
STAU2-208	ENST00000520872	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	29.25	■■■□□ 2.27
STAU2-208	ENST00000520872	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		29.23	■■■□□ 2.27
STAU2-208	ENST00000520872	CERK	Q8TCT0	537 aa		29.22	■■■□□ 2.27
STAU2-208	ENST00000520872	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	29.21	■■■□□ 2.27	2e-8	■■■■□ 22.5
STAU2-208	ENST00000520872	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		29.2	■■■□□ 2.26
STAU2-208	ENST00000520872	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		29.19	■■■□□ 2.26
STAU2-208	ENST00000520872	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		29.18	■■■□□ 2.26
STAU2-208	ENST00000520872	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		29.16	■■■□□ 2.26
STAU2-208	ENST00000520872	ROCK1	Q13464	1354 aa		29.15	■■■□□ 2.26
STAU2-208	ENST00000520872	KANK1	Q14678	1352 aa		29.15	■■■□□ 2.26
STAU2-208	ENST00000520872	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	29.14	■■■□□ 2.26
STAU2-208	ENST00000520872	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		29.14	■■■□□ 2.26
STAU2-208	ENST00000520872	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	29.12	■■■□□ 2.25
STAU2-208	ENST00000520872	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	29.1	■■■□□ 2.25	5e-6	■■■□□ 16.1
STAU2-208	ENST00000520872	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		29.1	■■■□□ 2.25
STAU2-208	ENST00000520872	MED14	O60244	1454 aa		29.08	■■■□□ 2.25
STAU2-208	ENST00000520872	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		29.07	■■■□□ 2.24
STAU2-208	ENST00000520872	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		29.07	■■■□□ 2.24
STAU2-208	ENST00000520872	UNC13B	O14795	1591 aa		29.06	■■■□□ 2.24
STAU2-208	ENST00000520872	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	29.06	■■■□□ 2.24
STAU2-208	ENST00000520872	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	29.06	■■■□□ 2.24
STAU2-208	ENST00000520872	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	29.06	■■■□□ 2.24
STAU2-208	ENST00000520872	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		29.03	■■■□□ 2.24
STAU2-208	ENST00000520872	NOS1	P29475	1434 aa		29.03	■■■□□ 2.24
STAU2-208	ENST00000520872	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	29.02	■■■□□ 2.24
STAU2-208	ENST00000520872	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	29	■■■□□ 2.23
STAU2-208	ENST00000520872	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	29	■■■□□ 2.23
STAU2-208	ENST00000520872	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		29	■■■□□ 2.23
STAU2-208	ENST00000520872	SYNM	O15061	1565 aa		29	■■■□□ 2.23
STAU2-208	ENST00000520872	SLIT1	O75093	1534 aa		28.99	■■■□□ 2.23
STAU2-208	ENST00000520872	TET3	O43151	1660 aa		28.99	■■■□□ 2.23
STAU2-208	ENST00000520872	PIK3C2B	O00750	1634 aa		28.98	■■■□□ 2.23
STAU2-208	ENST00000520872	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	28.96	■■■□□ 2.23
STAU2-208	ENST00000520872	IQGAP1	P46940	1657 aa		28.95	■■■□□ 2.22
STAU2-208	ENST00000520872	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		28.95	■■■□□ 2.22
STAU2-208	ENST00000520872	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		28.94	■■■□□ 2.22
STAU2-208	ENST00000520872	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	28.91	■■■□□ 2.22
STAU2-208	ENST00000520872	IDI1	Q13907	227 aa		28.89	■■■□□ 2.22
STAU2-208	ENST00000520872	ITGAE	P38570	1179 aa		28.88	■■■□□ 2.21
STAU2-208	ENST00000520872	CPS1	P31327	1500 aa		28.88	■■■□□ 2.21
STAU2-208	ENST00000520872	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		28.88	■■■□□ 2.21
STAU2-208	ENST00000520872	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		28.87	■■■□□ 2.21
STAU2-208	ENST00000520872	ADGRB3	O60242	1522 aa		28.87	■■■□□ 2.21
STAU2-208	ENST00000520872		E9PCH4	1651 aa		28.86	■■■□□ 2.21
STAU2-208	ENST00000520872	LTK	P29376	864 aa		28.85	■■■□□ 2.21
STAU2-208	ENST00000520872	NUP155	O75694	1391 aa		28.81	■■■□□ 2.2
STAU2-208	ENST00000520872	NAIP	Q13075	1403 aa		28.8	■■■□□ 2.2
STAU2-208	ENST00000520872	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		28.8	■■■□□ 2.2
STAU2-208	ENST00000520872	EID1	Q9Y6B2	187 aa		28.77	■■■□□ 2.2
STAU2-208	ENST00000520872	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		28.76	■■■□□ 2.19
STAU2-208	ENST00000520872	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		28.76	■■■□□ 2.19
STAU2-208	ENST00000520872	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		28.76	■■■□□ 2.19
STAU2-208	ENST00000520872	HFM1	A2PYH4	1435 aa		28.74	■■■□□ 2.19
STAU2-208	ENST00000520872	ZFYVE9	O95405	1425 aa		28.72	■■■□□ 2.19
STAU2-208	ENST00000520872	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		28.69	■■■□□ 2.18
STAU2-208	ENST00000520872	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		28.68	■■■□□ 2.18
STAU2-208	ENST00000520872	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		28.65	■■■□□ 2.18
STAU2-208	ENST00000520872	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		28.64	■■■□□ 2.18
STAU2-208	ENST00000520872	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		28.62	■■■□□ 2.17
STAU2-208	ENST00000520872	ALK	Q9UM73	1620 aa		28.61	■■■□□ 2.17
STAU2-208	ENST00000520872	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		28.61	■■■□□ 2.17
STAU2-208	ENST00000520872	NWD1	Q149M9	1564 aa		28.57	■■■□□ 2.16

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